C’est en tant que pianiste qu’Alexis Duffaure s’engage dans la musique à l’âge de 5 ans.
Passionné par la direction, il obtient en 2004 son diplôme de Direction de chœur avec félicitations du jury dans la classe d’Eliane Lavail au conservatoire de Bordeaux et son Diplôme Supérieur de Direction d’orchestre à l’École Normale de Musique de Paris dans la classe de Dominique Rouits.
Après avoir dirigé l’orchestre symphonique pendant 2 ans, le conservatoire de Bordeaux lui confie le Grand Chœur en 2009. Il gagne le prix international de direction de chœur au Florilège Vocal de Tours avec « le Chœur Voyageur » qui obtient les trois premiers prix du concours national, en mai 2009.
Il possède en outre une licence de musicologie, ses prix d’harmonie, de contrepoint et de fugue avec félicitations du jury et deux prix de la SACEM, ainsi que son DEM de percussion au Conservatoire de Bordeaux dans la classe de Jean-Daniel Lecocq.
Directeur artistique à l’Opéra National de Bordeaux dans le projet « Ma voix et toi » depuis 2013 après avoir
Il a travaillé de 2009 à 2012 en tant que coordinateur musical.
Il est actuellement Maître de Chapelle de la cathédrale de Bordeaux, intervenant au Conservatoire de Bordeaux et à la Faculté de musicologie de Bordeaux III, et dirige également « le Choeur Voyageur » et les deux chœurs d’enfants de la Maîtrise de Bordeaux.