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Annthomy GILLES

MARCY-L'ETOILE

En résumé

Parce que le monde est dirigé par les avancées technologiques et les progrès de la science,
la société actuelle nécessite de nouvelles approches thérapeutiques face à de nouveaux problèmes.

C'est de cette perspective qu'est née ma passion pour la biologie au service de la santé. Après une Licence en Biochimie-Biologie, je me suis donc naturellement orienté vers la Biologie Santé afin de développer et parfaire mes compétences en recherche fondamentale et appliquée. Puis, mon cursus m'a permis d'élargir mes perspectives en suscitant un vif intérêt pour la bioinformatique, un domaine d'avenir. J'enrichi donc ma vision en me formant durant 3 années , dont 2 en alternances dans la bioinformatique et les mathématiques.
A terme, cette double compétences en biologie et bioinformatique me permettra d'avoir une vision encore plus aboutie de la recherche.

Mes compétences :
Cytométrie en flux
Microscopie à Fluorescence
Biologie moléculaire et cellulaire
QPCR
MySQL
Annotation de génome
Biostatistiques
Perl/BioPerl
HTML/CSS/PHP
R

Entreprises

  • bioMérieux - Ingénieur en Bioinformatique (Apprenti)

    MARCY-L'ETOILE 2016 - maintenant Analyse de données métagénomiques et développement d’outils de diagnostic moléculaire.
    Développement en C, Perl,R, Python

  • Max Planck Institute for Biology of Ageing - Stage Ingénieur

    2016 - 2016 ANALYSE DE DONNEES RNA-SEQ

    The applicant will be involved in the analysis of NGS data from in-house research projects. The applicant will be responsible for developing analysispipelines using already existing tools for the extraction of value and meaning from NGS data:
    Eg. a)Differential gene expression combined with variant calling from RNAseq data;
    b) Differential gene expression combined with motif analysis on RNAs of interest as well as motif analysis of promoter
    regions;
    c) StringTie-DeSEQ2-DAVID pipe. The applicant is expected to develop such pipelines with a
    great degree of autonomy. Publication of the pipelines will be done through public repositories and if
    appropriate peer-reviewed publications without the exposure of in-house data.

    Methods and tools to be used during the internship:
    Bash, Python, R, Tuxedo suite, DeSEQ2, MEME suite, GATK, and others.

  • Merial - Stagiaire

    Lyon 2015 - 2015 Caractérisation de facteurs de virulence pour le développement d’un vaccin à large spectre contre une bactérie pathogène du chien

    - Génération d'une banque de mutants
    - Caractérisation des mutants (Cytométrie en flux, PCR, microscopie)
    - Optimisation du protocole d'analyse par cytométrie en flux
    - Caractérisation de l'immunogénicité d'une sélection de protéines candidates (Western blot,
    immunofluorescence)
    Projet réalisé en partenariat avec Calixar (69), Genostar (38), PX'The rapeutics(38), VetagroSup (69) et Institut Pasteur (75)

  • Centre Régional Des Oeuvres Universitaires et Scolaires - Agent d'accueil

    2014 - 2015 Accueil des étudiants (contact, information,orientation, courriers, formalités administratives).
    Gestion des dossiers,des loyers, et des situations d'urgences.

  • CNRS - UPMC Observatoire océanologique de Banyuls-sur-Mer - Stagiaire: Etude de la cytotoxicité de nanoparticules d'oxyde de fer

    2014 - 2014 UMR 7232 -Biologie intégrative des organismes marins (BIOM)

    Cette étude est consacrée à une compréhension approfondie des interactions biologiques de nanoparticules d’oxyde de fer de type maghémite γFE2O3 sur un modèle marin présent dans l’environnement et maitrisé dans les études pharmacologiques : le Paracentrotus Lividus, une espèce d’oursin.

    Le projet de l’unité de recherche BIOM a pour objectif principal d’étudier les mécanismes de développement et d’adaptation des organismes à travers une approche évolutive.Ce type d’approche a souvent abouti à des avancées significatives dans divers domaines de la biologie en permettant de répondre à certaines questions biologiques fondamentales.

Formations

  • Université Rouen Haute Normandie

    Mont Saint Aignan 2015 - 2018 Master 1

    Master Recherche & Professionnel en Bioinformatique, Biostatistiques et Biomathématiques en Alternance et Apprentissage en 3 ans.
    L'objectif de ce Master est de former des ingénieurs bioinformaticiens et biostatisticiens spécialistes de la gestion, du traitement et de l’analyse des séquences et données massives en biologie, issues des nouvelles approches expérimentales à très grande échelle.

  • Université Poitiers

    Poitiers 2013 - 2015 Génie cellulaire et moléculaire

    Compétences théoriques et méthodologiques, leur permettant de participer à la recherche fondamentale et/ou appliquée en biochimie, biologie moléculaire, biologie cellulaire, immunologie,microbiologie, physiologie, pharmacologie, épidémiologie ainsi qu’en informatique appliquée aux biotechnologies et à la biologie de la santé

  • Université Antilles Guyane UAG (Pointe À Pitre)

    Pointe À Pitre 2010 - 2013 Licence de Biochimie et Biologie

    Cell Biology, Molecular Biology, Physiology, Immunology, Pharmacology, Genetics, Cancer Cell Biology, Microbiology, Statistics, Metabolism, Population Genetics, Cell Signaling
    Biotechnology, Embryology

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