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Marilyne VIANO

Nancy

En résumé

Ingénieur chimiste spécialisé dans la modélisation moléculaire possédant des connaissances en alignement de séquence, homology modeling, docking protéine/protéine et protéine/ligand, modélisation moléculaire et en calcul d'énergie libres.
Je suis motivée, polyvalente et capable de travailler sur plusieurs projets en parallèle ainsi qu'en équipe pluridisciplinaire.

Mes compétences :
Modélisation moléculaire
Calcul d énergie libre
Docking
Biochimie
Autodock vina
MATLAB
Chimie
Recherche bibliographique ou Internet
Recherche scientifique
Bash
Shell
Gestion de stagiaire
C
TCL
Python
Plumed
Gromacs
AMBER
Modeller
UFED dAFED
Homology modelling
Travail en équipe

Entreprises

  • Institut Jean Barriol / Laboratoire SRSMC /CNRS - Nancy France - Ingénieur de recherche junior en modélisation moléculaire

    Nancy 2015 - 2015 Stage dans le cadre du Master 2 visant à étudier les membranes oxydée ainsi que la perméabilité de molécule au travers de membrane contenant diverse concentration de lipides peroxydés.

    J'ai pu réaliser les tâches suivantes :
    -Reconstruction de membranes biologique avec différentes concentrations en lipides peroxydés
    -Utilisation de protocole de calcul d'énergie libre UFED, dAFED, SteerMD.
    -Simulation de modélisation moléculaire
    -Réalisation de profils d'énergie libre à une et à deux dimensions.
    -Apprentissage du langage Bash, Shell et TCL
    -Utilisation de Matlab
    -Collaboration avec des personnes de domaines variés et de nationalité divers

    Dans un projet parallèle à mon sujet de stage portant sur l'effet d'un champ électrique sur des protéines cytoplasmiques j'ai réalisé les tâches :
    - Homology modeling de Loops
    - Simulation de dynamique moléculaire avec un champ électrique continue et sinusoïdale
    - Prise en charge d'un stagiaire

  • Institut de chimie de Nice - Ingénieur de recherche junior en modélisation moléculaire

    2014 - 2014 Études des protéines transmembranaire impliquées dans les sens chimiques

    Durant ce stage j'ai pu réaliser diverses tâches tels que :
    -Alignement de séquence de protéine
    -Reconstruction de protéine par homologie de séquence
    -Simulation de dynamique moléculaire
    -Création de petit script en python
    -Calcul d énergie libre à l'aide du programme MMGBSA
    -Études d’intéractions protéine/protéine et protéine/ligand
    -Réalisation d’un poster scientifique pour les JCFI
    -Communiquer à l’écrit et à l’orale
    -Recherche bibliographique,
    -Utiliser Linux, le terminal et les serveurs ssh
Une expérience absente ?

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