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Nicolas BARGUES

Lyon

En résumé

Diplômé d’un Master professionnel Bioinformatique Biochimie Structurale et Génomique et bénéficiant d’une première expérience‭ ‬professionnelle en tant qu’Ingénieur Bioinformatique, je souhaite poursuivre ma carrière dans l’analyse de donnée en qualité d’ingénieur Bioinformatique, plus particulièrement dans le traitement de donnée "Next-Generation Sequencing".

Je suis en recherche active d'un CDD/CDI.

Mes compétences :
Java
UNIX
SQL
Python Programming
Personal Home Page
HTML5
Cascading Style Sheets
LaTeX
Transcriptomics
Bio-informatique
Sequence analysis
DNA Sequencing
Analyse NGS
Programmation
Statistiques
Analyse de données

Entreprises

  • Hospices Civils de Lyon - Ingénieur Bioinformatique

    Lyon 2017 - maintenant

  • CHU Limoges - Ingénieur Bioinformatique

    Limoges 2016 - 2017 Implémentation du traitement bioinformatique et biostatistique des données générées par NGS (Ion Proton) pour l’oncogénétique des tumeurs solides et des hémopathies:

    - Accompagnement et assistance bioinformatique pour les biologistes
    - SNP : Automatisation de l’annotation de variant (critère de sélection, script Python, Annovar, BDD : Cosmic, IARC TP53 Database, …)
    - CNV : Collaboration avec l’équipe EA6309 pour l’analyse de données issues spécifiquement de la chimie Ion Torrent (logiciel Proflect développé au CHU de Limoges)

  • CNRS - Ingénieur Bioinformatique

    Paris 2015 - 2015 - Utilisation et création d’outil Bioinformatique pour l’analyse phylogénétique de séquence d’élément transposable de Drosophiles.
    - Création d’un workflow pour la découverte et la confirmation de Transfert Horizontal.
    - Estimation des proportions d’élément transposable dans les génomes de Drosophiles (RepeatMasker, OCTFTA).

  • Centre Hospitalier d'Aix-en-provence - Technicien Bactériologie

    2011 - 2011 en Laboratoire de Bactériologie à Aix en Provence (dans le cadre du
    BTS Bioanalyses et Contrôles)
    Analyse et identification bactérienne en milieu hospitalier dans la prévention
    des maladies nosocomiales et identification de Legionella Pneumophila

Formations

  • Université Aix Marseille 2 Mediterranée M2 BBSG pro Bioinfo

    Marseille 2013 - 2015 Génomique fonctionnelle – Méthodes Bioinformatiques pour la génomique et la protéomique – Phylogénie et évolution des génomes – Analyse des polymorphismes – Programmation avancée – Base de donnée – Analyses statistiques des données génomiques

  • Aix-Marseille Université

    Marseille 2011 - 2013 Bioinformatique appliquée – Génétique moléculaire – Enzymologie –Statistique – Thermodynamique – Métabolisme – Structure et fonction des protéines

  • Lycée Marie Curie BTS BioAc

    Marseille 2009 - 2011
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