Ph.D. en bioinformatique au sein du laboratoire d'hématologie expérimentale, Institut Jules Bordet, ULB, Bruxelles
en collaboration avec le laboratoire de Génomique Animale, GIGA, ULg, Liège
Mes recherches se focalisent sur l'analyse transcriptomique d'une leucémie viro-induite au moyen de données de séquençage à haut débit (RNA-Seq, smallRNA-Seq). Mon champ d'expertise couvre l'alignement des données en utilisant des outils adéquats (Tophat,STAR,bwa,...), l'analyse de l'expression des gènes cellulaires (DESeq, edgeR,...) et de l'expression virale, la découverte de nouveau transcrits ( lncRNA, microRNA,..) et l'analyse de fusion de gènes et de splicing alternatif.
Ma formation multi-disciplinaire ( Licence en Informatique , Master en Bioinformatique et Modélisation, Ph.D. en sciences biomédicales/bioinformatique) me permet de poser les bonnes questions biologiques ; et d'y répondre au moyen d'outils statistiques et bioinformatiques adaptés.
Spécialités: NGS, RNA-Seq, R, Bioconductor, Perl, Python
Mes compétences :
R&D
Informatique
Biotechnologies
Bio-informatique
Gestion de projet
Perl
smallRNA-Seq
R
Python
RNA-Seq