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Philippe BUN

HEIDELBERG

En résumé

Mes compétences :
Recherche
Vulgarisation scientifique
Enseignement
Communication
Microscopie
Pédagogie
Formation
Gestion
Conseil
Gestion de projet
Management
Encadrement

Entreprises

  • European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg (Germany) - Chercheur Post-Doctoral

    2013 - maintenant - EMBL Interdisciplinary Postdocs and Marie Curie Fellowship 2013-2016 -
    (EMBL is an inter-governmental organisation funded by public research monies from 21 member states, including much of Europe and Israel, and one associate member, Australia.)

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    * Gestion du projet " Imaging the structural dynamics of contractile F-actin meshwork for generating contraction during chromosome congression in starfish oocytes "

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    * Gestion du projet " Single cell extract for multiple spindle visualization in Xenopus Laevis eggs" en collaboration avec l'équipe de François Nédélec (EMBL, Heidelberg, Allemagne).

    Le fuseau mitotique est la structure chargée de séparer convenablement le matériel génétique au cours de la division cellulaire. L'utilisation du système dit "cell-free" a permis de clarifier la composition et l'organisation des protéines impliquées dans la formation du fuseau mitotique. Mais le système dit "cell-free" requiert un grand nombre d'oeufs, ainsi qu'une préparation longue et minutieuse. Nous proposons de mettre en place un nouveau protocole expérimental pour la visualisation de plusieurs fuseaux mitotiques à partir d'un seul et unique oeuf.
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    * Gestion du projet " Mouse-SPIM for starfish oocytes" en étroite collaboration avec l'équipe de Lars Hufnagel (EMBL, Heidelberg, Allemagne), spécialisée en microscopie super-résolutive.

    Ce projet consiste en la conception, le dévelopement et la réalisation d'un système de microscopie dit à Feuille de Lumière (SPIM) permettant d'imager des échantillons biologiques (ici, des embryons de souris et des ovocytes d'étoiles de mer) à très haute résolution temporelle sans altérer leur dévelopement.
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  • INSERM - Intervenant

    PARIS 13 2011 - 2011 Atelier de Formation - Phase pratique
    "Outils en émergence pour une microscopie de fluorescence quantitative appliquée à la biologie des systèmes."

    En binôme, les participants sont invités à traiter les images fluorescentes acquises à l'aide de la microscopie en épi-fluorescence et/ou confocale.
    Sont abordés ensuite les techniques de spectroscopie à corrélation en fluorescence en mode image telles que le RICS (Raster-Scan Image Correlation Spectroscopy) et le STICS (Spatio-Temporal Image Correlation Spectroscopy) afin d'extraire des informations sur la dynamique des molécules fluorescentes.
    Un dernier point pratique concernant l'importance des conditions d'acquisition d'images en fluorescence est présenté afin de rendre compte de possibles artefacts générés par l'utilisation des techniques d'analyse présentées.
  • CNRS - Intervenant

    Paris 2010 - 2010 Formation continue CNRS / Institut Curie / Institut Jacques Monod en microscopie: "Microscopie Optique pour la Biologie"

    Introduction à la théorie et aux applications de la pince optique en Biologie.
  • Institut Jacques Monod - CNRS/Université Paris VII - Doctorant (Ph.D) en Biophysique

    2008 - 2012 - Allocations de Recherche du Ministère de la Recherche 2008-2011 -
    - Programme doctorale " Frontières du Vivant " (Paris V, VII) , Fondation Bettencourt-Schueller -

    * Gestion du Projet: " Influence of the mechano-chemical environment on cell polarization process "

    - Mise en place d'un système de microscopie confocale couplé à une pince optique, outil permettant la manipulation d'objets de tailles micrométriques;
    - Etude du mécanisme de la polarisation cellulaire dans un environnement mécanique (pince optique) et topologique (traitement de la surface d'adhésion cellulaire) sous contrôle;
    * Publication en Juillet 2014 dans le journal Biophysical Journal: " Mechanical Checkpoint for Cell Polarization in adhesion-naive fibroblasts ".

    - Collaboration avec l'ESPCI et l'ENS-LKB (Paris) sur le développement d'une méthode basée sur l'holographie pour détecter et visualiser des objets à l'échelle du nanomètre.
    * Publication en Février 2010 dans le journal Optics Express: " Imaging gold nanoparticles in living cell environments using heterodyne digital holographic microscopy "


    - Développement et Adaptation sous MatLab de méthodes d'analyse permettant d'obtenir des informations semi-quantitatives sur la dynamique de molécules marquées en fluorescence, appelées Fluorescence Correlation Spectroscopy Techniques;
    * Publication en collaboration avec l'équipe de T. Galli, INSERM/Institut Jacques Monod en Avril 2012 dans le journal Developmental Cell: " A molecular network for the transport of the v-SNARE TI-VAMP/VAMP7 vesicles from cell center to periphery "
  • Université Paris 7 - Denis Diderot - Enseignant vacataire

    2008 - 2011 Missions ponctuelles d'enseignement auprès d'étudiants aux profils variés.


    - Étudiants en Master 2 - Ingénieur de Plateforme Technologique

    "Introduction à la Pince Optique"

    Les étudiants sont invités à découvrir cet outil permettant la manipulation d'objets à l'échelle du nanomètre/micromètre. La première partie du cours consiste en la présentation théorique et les applications de la pince optique. Une seconde partie pratique encourage les étudiants à piéger et déplacer des billes micrométriques.


    - Étudiants en Master 1 - Biologie Cellulaire Physiologie Pathologie

    "Imagerie Cellulaire et Tissulaire"

    A travers les enseignements donnés en petit groupe de 20, les étudiants sont invités à découvrir les outils permettant d'imager et analyser des phénomènes à l'échelle tissulaire et cellulaire.


    - Étudiants en Licence 3 Professionnelle Biophotonique et Analyse des Matériaux

    "Introduction à la Microscopie et aux techniques de spectroscopie de fluorescence en mode image"

    Dans un premier temps, en binôme, les étudiants apprennent à se servir d'un microscope à fluorescence en choisissant les réglages à effectuer sur le système et le logiciel d'acquisition.
    Dans un second temps, une présentation générale des techniques de spectroscopie de fluorescence permettent aux étudiants d'avoir un aperçu de la manière d'extraire des informations semi-quantitatives de phénomènes biologiques à partir d'images fluorescentes acquises au microscope.

Formations

  • Université Paris 7 Denis Diderot

    Paris 2008 - 2012 http://www.fdv-paris.org/fr/ecole-doctorale-fdv/

    Ecole Doctorale Frontières du Vivant - Programme Bettencourt Schueller - (1) Représentant des doctorants et Membre du conseil de l'Ecole Doctorale (Paris, Juin 2010 - Septembre 2011).
    (2) Co-organisateur du 1st Paris Interdisciplinairy PhD Symposium ("From sparse entities to crowded environements: number in living systems" - Paris, Décembre 2009).
    (3) Participation et Intervention à des Congrès,
  • Université Paris 6 Pierre Et Marie Curie

    Paris 2007 - 2008 http://www.edu.upmc.fr/physique/master/S_biophysique/

    (1) Stage de Master 2 (Janvier - Juillet 2008): Institut Jacques Monod, Groupe Complexes Macromoléculaires en Cellules Vivantes
    "Influence of the mechanical environment on cell polarization".

    (2) Retraite du Master à Roscoff (Janvier 2008): Présentation du stage de Master, Critique et Analyse d'articles scientifiques et Initiation pratique à la bio-informatique pour la cristallographie

  • Université Paris 7 Denis Diderot

    Paris 2005 - 2008 http://www.physique.univ-paris-diderot.fr/rubrique.php3?id_rubrique=11

    Magistère de Physique Fondamentale et Sciences pour l'Ingénieur - (1) Options Cosmologie, Physique Subatomique, Hydrodynamique, Matière Molle et Biophysique. (2) Stage en Cosmologie (Dr. Michel Piat, APC) sur la simulation et la détection du Fond Diffus Cosmologique (ou CMB) à l'aide du radiomètre de Penzas et Wilson. Programmation sous IDL. (3) Stage en Physique des Particules (Pr. Alessandra Ton
  • Université Paris 7 Denis Diderot

    Paris 2003 - 2005 http://www.math.univ-paris-diderot.fr/formations/licences/l-math.html


    (1) Option Mathématiques. (2) Introduction au langage JAVA et aux programmes MAPPLE et MATHEMATICA. (3) Projet de 2ème année sur la caractérisation de la trajectoire d'une bille piégée dans un cône de révolution.
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