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Romain POGORELCNIK

Paris

Résultats examens 2026

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En résumé

Mes compétences :
Perl
C/C++
R
Analyse de données
Bio-informatique
UNIX
Perl Programming
C++
UML/OMT
SQL
Microsoft Windows
Merise Methodology
Mathematical Programming
HTML
CGI Web Development
C Programming Language
Apple MacOS

Entreprises

  • Cnrs - Ingénieur de recherche en bio-informatique

    Paris 2017 - maintenant *Développement d’un programme permettant de définir des ARN guides pour
    l’invalidation spécifique de variants génétiques via CRISPR/Cas9

  • BIOGEMMA - Bioinformaticien

    2016 - 2017 * Création de pipelines pour la détection de variants à l’aide de séquençage à haut
    débit.
    * Expertise en analyse de données RNA-seq.

  • GRED - Ingénieur

    2013 - 2015 * Analyse des données de séquençage haut débit : DNA-seq, RNA-seq, Small RNA-seq,
    MeDIP-seq, BS-seq, 4C-seq, Next-generation mutation mapping

    * Gestion serveur Galaxy
    * Développement de pipelines d'analyses de données RNA-seq, BS-seq, Small RNA-seq.
    (Arabidopsis thaliana)
    * Intégration de scripts et de pipelines sous Galaxy
    * Formation à l'utilisation de Galaxy et aux outils de visualisation de données (IGV, IGB, seqMonk...)

    * Développement d'un pipeline de détection de transcripts chimères chez l'humain
    * Recherche de trangènes

  • école d'ingénieur - Enseignant

    2012 - 2013 * Algorithmique et structure de données
    * Méthodes et outils de développement logiciel C++
    * Recherche opérationnelle
    * Utilisation ILOG CPLEX

    * Algorithme des graphes

    Chercheur en informatique

  • LIMOS - Doctorat de bioinformatique

    2009 - 2013 * Utilisation de la théorie des graphes pour la représentation de données issues de la biologie
    ▶ Programmation du logiciel MosaïcFinder permettant la recherche de gènes fusionnés
    ▶ Clusterisation de données issues de la transcriptomique à l'aide de graphes

    * Amélioration de la complexité d'algorithmes de décomposition de graphes

  • UBP - Enseignant

    2009 - 2012 * Réseaux biologiques
    * Bases de données
    * Introduction à l'environnement Unix
    * Langage C

    * Théorie des graphes

    Bioinformaticien

  • ADNid - Assistant de recherche

    Clapiers 2009 - 2009 * Réalisation de programmes pour la création d'amorces avec interface Web (Perl, CGI)

    Assistant de recherche

Formations

Annuaire des membres :