Romain POGORELCNIK

En résumé

Entreprises

• Cnrs - Ingénieur de recherche en bio-informatique

  Paris 2017 - maintenant *Développement d’un programme permettant de définir des ARN guides pour
  l’invalidation spécifique de variants génétiques via CRISPR/Cas9

• BIOGEMMA - Bioinformaticien

  2016 - 2017 * Création de pipelines pour la détection de variants à l’aide de séquençage à haut
  débit.
  * Expertise en analyse de données RNA-seq.

• GRED - Ingénieur

  2013 - 2015 * Analyse des données de séquençage haut débit : DNA-seq, RNA-seq, Small RNA-seq,
  MeDIP-seq, BS-seq, 4C-seq, Next-generation mutation mapping
  
  * Gestion serveur Galaxy
  * Développement de pipelines d'analyses de données RNA-seq, BS-seq, Small RNA-seq.
  (Arabidopsis thaliana)
  * Intégration de scripts et de pipelines sous Galaxy
  * Formation à l'utilisation de Galaxy et aux outils de visualisation de données (IGV, IGB, seqMonk...)
  
  * Développement d'un pipeline de détection de transcripts chimères chez l'humain
  * Recherche de trangènes

• école d'ingénieur - Enseignant

  2012 - 2013 * Algorithmique et structure de données
  * Méthodes et outils de développement logiciel C++
  * Recherche opérationnelle
  * Utilisation ILOG CPLEX
  
  * Algorithme des graphes
  
  Chercheur en informatique

• LIMOS - Doctorat de bioinformatique

  2009 - 2013 * Utilisation de la théorie des graphes pour la représentation de données issues de la biologie
  ▶ Programmation du logiciel MosaïcFinder permettant la recherche de gènes fusionnés
  ▶ Clusterisation de données issues de la transcriptomique à l'aide de graphes
  
  * Amélioration de la complexité d'algorithmes de décomposition de graphes

• UBP - Enseignant

  2009 - 2012 * Réseaux biologiques
  * Bases de données
  * Introduction à l'environnement Unix
  * Langage C
  
  * Théorie des graphes
  
  Bioinformaticien

• ADNid - Assistant de recherche

  Clapiers 2009 - 2009 * Réalisation de programmes pour la création d'amorces avec interface Web (Perl, CGI)
  
  Assistant de recherche

Formations

Pas de formation renseignée