Paris
Les activités de recherche que j'ai menées portent sur l'étude par des techniques in silico des interactions entre molécules et sur leurs implications dans les fonctions des macromolécules biologiques. Pour y parvenir, des techniques basées sur des méthodologies existantes ou nécessitant le développement de nouveaux outils ont été employées.
J'ai ainsi réalisé des études in silico classiques (études structurales, énergétiques, ...) sur des cibles thérapeutiques potentielles de natures diverses : ARN, protéine, ADN, ADN modifiés et complexe ADN-protéine.
Je me suis également attaquée à un autre versant de ces études en examinant des ligands dont la protéine cible était de structure inconnue, dans un objectif double : obtenir des informations sur le site actif de la protéine cible et concevoir de nouveaux candidats médicaments potentiellement plus performants en terme d’efficacité et d’innocuité.
C'est par ce biais que je me suis intéressée aux données de criblages classiques (criblage de chimiothèques) qui m'ont naturellement conduite à entreprendre des criblages virtuels (dockings à grande échelle) sur une cible protéique construite par des techniques de modélisation par homologie, techniques que j'ai pu réutiliser avec profit par la suite. Plusieurs de mes travaux se référant à des résidus non classiques ou des ligands dont les paramètres étaient inconnus, j'ai appliqué mes connaissances en chimie théorique pour calculer les paramètres du champ de force manquants.
Ces différentes expériences professionnelles réalisées au sein d’équipes aux thématiques diverses, détaillées dans les paragraphes ci-dessous, m’ont permis d’acquérir une solide expertise des différentes méthodes d'étude in silico des interactions entre molécules mais également du développement de méthodologies d’études innovantes.
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