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Samuel QUENTIN

Paris

En résumé

-> Analyse de données de séquençage à haut-débit NGS et de puces à ADN

-> Transfert technologique vers le soin (diagnostic APHP)

Mes compétences :
Next generation sequencing
Array-CGH
SNP-array
R
Linux
Bioinformatique
Génomique
Biotechnologie
Analyse
Oncologie

Entreprises

  • Assistance publique - Hôpitaux de Paris - Ingénieur d'études bioinformatique

    Paris 2012 - maintenant Analyses "omiques"​ de données issues de puces à ADN et de séquençage à haut débit
    - Impliqué dans les projets de recherche et dans les projets cliniques
    - Développement des chaines de traitement d'analyses
    - Implémentation de nouveaux outils d'analyses
    - Analyses tertiaires des données en collaboration avec les différents responsables des projets.
    - Programmation shell sous Unix/Linux
    - Bonne connaissance des langages Perl et R
    - Mise en place solution d'analyse Galaxy sur le réseau de l’hôpital.

  • Assistance publique - Hôpitaux de Paris - Ingénieur d'études en génomique

    Paris 2007 - 2012 Réalisation des expériences et analyses des données génomiques et transcriptomiques issus des puces à ADN :
    - Technologies 'Agilent'​ et 'Affymetrix'​
    - Mise en place des protocoles techniques (array-CGH, SNP-array, Gene expression array)
    - Maitrise des logiciels dédiés pour l'analyse.
    - Gestion et analyses des données bioinformatiques

    Réalisation des expériences et analyses des données de séquençage à haut-débit de type capture, exome-seq ou RNA-seq :
    - Technologies 'Illumina' HiSeq1000 et MiSeq
    - Mise en place des protocoles techniques
    - Analyses qualité
    - Gestion et analyses des données bioinformatiques

  • UNIVERSITE DE PARIS 7 - Ingénieur d'études en génétique moléculaire

    Paris 2006 - 2007 Etude des phénomènes de résistance à des drogues anticancéreuse chez Drosophila melanogaster.
    - Construction de lignée transgéniques
    - Marquage immunohistochimique
    - Apotome, microscope confocal
    - Mocrodissection, clones MARCM, RT-PCR real time

  • Laboratoire de Biotechnologies Environnementales - INRA - Narbonne - Ingénieur d'études stagiaire en biotechnologie

    2005 - 2005 - Etude de l’impact du sel sur le traitement biologique anaérobie des effluents.

    - J'ai étudié l’impact du sel sur le traitement biologique anaérobie des effluents en effectuant le suivi de réacteurs de type ASBR (Anaerobic Sequencing Batch Reactor). J'ai procédé à des mesures analytiques spécifiques (DCO, MES, MVS, AGV, biogaz, N-NTK, N-NH4+, pH). De plus, j'ai caractérisé la microflore et son adaptation aux conditions salines par SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism), technique basée sur l'analyse de l'ADNr 16S. Mais aussi, j'ai utilisé les différentes techniques classiques de biologie moléculaire comme l’extraction et la purification d'ADN, le clonage, etc.

    - Publication :
    Lefebvre O, Quentin S, Torrijos M, Godon JJ, Delgenès JP, Moletta R. Impact of increasing NaCl concentrations on the performance and community composition of two anaerobic reactors. Appl Microbiol Biotechnol. 2007 May;75(1):61-9. Epub 2007 Jan 24.

  • Pole de biotechnologie Végétale - INRA Toulouse - Stagiaire

    2003 - 2003

Formations

  • Université Pau - Pays De L'Adour (Pau)

    Pau 2000 - 2005 DEUG SDV, Licence et Maitrise de Biochimie, Master 2 pro Biotechnologie

    Microbiologie / Biotechnologie

Réseau

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