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Amélie CESSIEUX

VALENCE

En résumé

Ingénieur jeune diplômée en Bio-Informatique, je travaille au support utilisateurs de l'entreprise DefSystemes, éditrice de logiciels pour le monde médical et spécialisée en génétique humaine et biologie moléculaire.

o Objectif : développer des outils informatiques au service de la santé
o 18 mois d’expériences en entreprises et laboratoires
o Domaines de compétences : Bio-informatique, Biologie, Chimie
o Environnements : Santé, Pharmaceutique, Biologie, Chimie, Cosmétique
o Qualités : autonomie, adaptabilité, sens de l’organisation, rigueur et dynamisme

Mes compétences :
Système d’exploitation : Windows XP, Windows Vista
Microsoft Office, Open Office
Bases de données en ligne (Ensembl, PDB, UniProt,
MySQL
Python
Html/css
Perl
Chimie
Biologie
Adaptabilité
Microsoft SQL Server

Entreprises

  • Def-Systemes - Ingénieur Bio-informaticienne

    2013 - maintenant - Formation
    - Support aux utilisateurs
    - Rédaction de documentation
    - Développement sur SQL Server
    - Gestion de projet

  • INSERM - Ingénieur d'étude en Bio-informatique

    PARIS 13 2012 - 2013 Création de l’interface d’une base de données

    - Reconstruction d’un interactome humain propre et complet (100 000 interactions) : Perl
    - Développement d’un visualisateur de réseaux d’interactions protéiques : Cytoscape Web, HTML et JavaScript
    - Création de l’interface de la base de données : HTML, CSS, PHP, JavaScript, Jmol, PostGreSQL et David Web Services

  • Galderma R&D - Modélisation de la pénétration cutanée par un modèle Quantitative Structure Property relationship

    2012 - 2012 Modélisation de la pénétration cutanée basée sur la relation structure-propriété.

    - Maîtrise des concepts de modèles Quantitative strutcure activity/property relationship
    - Approfondissement des techniques de traitements des données : Perl, ADMET Predictor, Dicovery Studio
    - Création d’un modèle de prédiction de la pénétration cutanée basé sur un modèle QSAR/QSPR : Pipeline Pilot

  • Laboratoire University college of Dublin, Complex and adaptative systems laboratrory (UDC CASL) - Recherche en Bio-informatique sur les prédicteurs de localisation subcellulaire

    2011 - 2011 Recherche en Bio-informatique sur les prédicteurs de loclisation subcellulaire dans le plastide chez les parasites responsables du paludisme.

    - Maîtrise du concept et des applications des réseaux de neurones artificiels
    - Traitement des données hétérogènes : Perl
    - Publication d’un article scientifique dans Amino Acids

  • Laboratoire d'Informatique, Signaux et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) - Recherche en Bio-informatique

    2010 - 2010 Recherche en Bio-informatique sur la modélisation discrète du rythme circadien. Stage de cinq semaines.

    - Recherches bibliographiques et maîtrise de la méthode de René THOMAS
    - Création d’un modèle du rythme circadien des mammifères
    - Publication d’un chapitre de livre et d’un article scientifique dans Procedia Computer Science

  • Laboratoire Hypoxie et physiopathologies cardiovasculaire et respiratoires (HP2) - Technicienne de laboratoire

    2009 - 2009 Recherche sur l’apnée du sommeil, expérimentation animale sur rat. Stage de deux mois.

    - Dissection
    - Dosages protéiques
    - Marquages de tissus
    - Expériences de cœur isolé perfusé

  • Laboratoire Ingénierie et Interaction Biomoléculaire (I2BM) - Stagiaire en Chimie-Biologie

    2009 - 2009 Synthèse et étude de mimes enzymatiques au laboratoire Ingénierie et Interaction Biomoléculaire (I2BM) du Département de Chimie Moléculaire (DCM), Grenoble. Stage de un mois.

    - synthèse peptidique (synthétiseur Advanced ChemTech)
    - Purification de nucléotides
    - HPLC
    - Modélisation moléculaire

Formations

  • Polytech'Nice-Sophia EPU (Sophia Antipolis)

    Sophia Antipolis 2009 - 2012 Ingénieur en Bio-informatique

    - Matières principales : Base de données, Datamining, Drug design, Génie logiciel, Modélisation moléculaire, Omics, Pharmacologie, Simulation de systèmes biologiques, Toxicologie, Métabolisme, Algorithmes et Bio-statistiques

    - Outils abordés : R, Weka, MS Project, Visio Modeller, Visual Paradigm Autodock, BioCham, Gaussian, Gaussview, Knime, Netlogo, Scilab et SRS

  • Université Joseph Fourier

    Valence 2006 - 2009 Chimie Biologie

    Licence Chimie et procédés - Matières principales : Biochimie, Biologie moléculaire et cellulaire, Chimie organique et inorganique, Génétique, Informatique, Physiologie animale et végétale, Physique, Statistiques, Métabolisme

Réseau

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