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Aymeric DUCLERT

Paris

En résumé

Manager Bioinformatique et Informatique avec un forte double compétence en biologie et en informatique pour mener avec succès des projets et des équipes dans le domaine de la biotech et de la santé. Rigoureux, pragmatique, très motivé.

Mes compétences :
Java Platform
Linux
Informatique
Gestion de projet
Java EE
JavaScript
JQuery
Perl
R

Entreprises

  • Cellectis - Responsable du Departement Bioinformatique

    Paris 2011 - maintenant Exemples de réalisations :

    - management de l'équipe et supervision des projets de développement et d'analyse, en concertation avec les différentes filiales du groupe.
    - développements du LIMS (Laboratory Information Management System) pour l'adapter aux besoins divers des filiales de la société en France (cellules) et aux US (plantes).
    - analyse de données/machine learning : prédiction in silico de nucléases candidates, recherches de cibles dans les génomes, analyse de données de séquence 454, analyses statistiques.
    - évaluation de solutions de type Electronic Laboratory Notebook, notamment en vue d'une intégration avec le LIMS.

  • Cellectis - Responsable du département Informatique/Bioinformatique

    Paris 2005 - 2011 Exemples de réalisations :

    - management de l'équipe et supervision des projets.
    - développement d'un LIMS avec plus d'une centaine d'applications (interface web/serveur tomcat/base Oracle/framework Struts).
    - automatisation des process avec pipelines d'intégration et de traitement automatique des données de plate-formes robotisées.
    - suivi informatique du process de production de nucléases, de la commande jusqu'à la livraison.
    - datawarehouse pour l'hébergement des résultats et le requêtage.
    - applications bioinformatiques : recherches de cibles dans les séquences, analyse de données de séquencage 454 et Sanger.
    - analyses statistiques de données issues des cribles et prédictions in silico (par machine learning).
    - analyse d'image pour quantification de crible haut-débit.
    - architecture du système informatique (système, réseau).
    - supervision des applications non scientifiques de la société.

  • INRA - Directeur de l'unite INRA Genomique-Info

    Paris 2002 - 2004 Exemples de réalisations :

    - gestion administrative de l'unité.
    - supervision des activités de l'unité.
    - promotion/présentation des réalisations de l'unité au sein de Génoplante et de l'INRA.
    - gestion de projets collaboratifs avec les partenaires privés au sein de Génoplante (Biogemma et Bayer CropScience notamment) : recueil des besoins, coordination, écriture de demandes de subventions.

  • Valigen - Responsable du groupe LIMS et applications bioinformatiques

    2001 - 2002 Exemples de réalisations :

    - Supervision de l'équipe.
    - LIMS microarray.
    - intégration des plateformes.
    - outils bioinformatiques d'analyse de séquences.

  • Genset - Chef de service

    2000 - 2001 Exemples de réalisations :

    - management de l'équipe.
    - bases de données bioinformatiques et applications
    - base de donnée brevet.

  • Genset - Chercheur Bioinformatique, puis Chef de Projet Bioinformatique

    1997 - 1999 Exemples de réalisations :

    - pipelines d'annotation automatique des séquences.
    - réalisation d'une base de donnée pour le stockage des analyses de séquences.
    - automatisation du processus de séquencage des ADNc complets (par primer walking) pour des clients externes et pour des besoins internes.

Formations

Réseau

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