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Benoit HILSELBERGER

NANCY

En résumé

Mes compétences :
CVS
PHP / MYSQL
Perl
HTML
SVN
Logiciel R
Python
Oracle
C++
Bioinformatique
Mac OSX
Linux/UNIX
Génomique
Base de données

Entreprises

  • Genclis - Ingénieur de recherche bioinformatique

    2010 - maintenant -Mise en place d’un environnement bioinformatique autour des technologies de séquençage haut débit.
    -Gestion et analyse des données de séquençage exome et transcriptome.
    -Développement et maintient d’un pipeline d’identification de positions d’intérêts pour la sélection de marqueurs.
    -Analyse globale des données de séquençage : expression, polymorphisme génétique
    -Conception de bases de données et création des interfaces web dédiées
    -Conception d’un modèle de prédiction de positions génomiques d’intérêts : chaines de Markov cachées

  • INRA -Centre de Versailles - Ingénieur d'études bioinformatique (CDD)

    Paris 2008 - 2009 -Déploiement et configuration des outils d'annotation du génome de la vigne (Gbrowse,Apollo).
    -Intégration des données génomiques et transcriptomiques de la vigne dans le système d'information de l'URGI.
    -Conception des outils pour la mise à jour de la base de données transcriptomique de L'URGI dans le cadre de l'intégration des données de puce à oligonucléotides.
    -Développement d'outils d'analyse dans le cadre de l'équipe de développement de l'URGI : structure de développement commune (méthode Agile)

  • INRA - Centre de Nancy - Ingénieur d'études bioinformatique (CDD)

    Paris 2007 - 2008 -Réalisation et interprétation des analyses bioinformatiques.
    -Développement d'outils pour l'automatisation des applications d'analyse et l'extraction des données d'intérêts.
    -Administration du serveur du laboratoire.
    -Création de nouvelles bases de données et gestion des bases existantes.

  • INRA - Centre de Nancy - Stage - Master professionnel 2eme année

    Paris 2007 - 2007 -Conception d'une base de données d'annotation de séquences transcrites chez la truffe noire du Périgord.
    -Développement de l'interface web d'édition de la base de données.

  • Laboratoire Lorrain de recherche en informatique et ses applications - Stage - Master 1ère année

    2006 - 2006 -Réalisation d’une interface homme machine pour une application de recherche de motifs dans une séquence d’ADN

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