Benoit HILSELBERGER

En résumé

Entreprises

• Genclis - Ingénieur de recherche bioinformatique

  2010 - maintenant -Mise en place d’un environnement bioinformatique autour des technologies de séquençage haut débit.
  -Gestion et analyse des données de séquençage exome et transcriptome.
  -Développement et maintient d’un pipeline d’identification de positions d’intérêts pour la sélection de marqueurs.
  -Analyse globale des données de séquençage : expression, polymorphisme génétique
  -Conception de bases de données et création des interfaces web dédiées
  -Conception d’un modèle de prédiction de positions génomiques d’intérêts : chaines de Markov cachées
  

• INRA -Centre de Versailles - Ingénieur d'études bioinformatique (CDD)

  Paris 2008 - 2009 -Déploiement et configuration des outils d'annotation du génome de la vigne (Gbrowse,Apollo).
  -Intégration des données génomiques et transcriptomiques de la vigne dans le système d'information de l'URGI.
  -Conception des outils pour la mise à jour de la base de données transcriptomique de L'URGI dans le cadre de l'intégration des données de puce à oligonucléotides.
  -Développement d'outils d'analyse dans le cadre de l'équipe de développement de l'URGI : structure de développement commune (méthode Agile)

• INRA - Centre de Nancy - Ingénieur d'études bioinformatique (CDD)

  Paris 2007 - 2008 -Réalisation et interprétation des analyses bioinformatiques.
  -Développement d'outils pour l'automatisation des applications d'analyse et l'extraction des données d'intérêts.
  -Administration du serveur du laboratoire.
  -Création de nouvelles bases de données et gestion des bases existantes.
  

• INRA - Centre de Nancy - Stage - Master professionnel 2eme année

  Paris 2007 - 2007 -Conception d'une base de données d'annotation de séquences transcrites chez la truffe noire du Périgord.
  -Développement de l'interface web d'édition de la base de données.

• Laboratoire Lorrain de recherche en informatique et ses applications - Stage - Master 1ère année

  2006 - 2006 -Réalisation d’une interface homme machine pour une application de recherche de motifs dans une séquence d’ADN

Formations

• Université Nancy 1 Henri Poincaré

  Vandoeuvre Les Nancy 2002 - 2007 Master science de la vie et de la santé
  
  Génomique et Informatique

Réseau

• Agathe VETTIER

• Benoit SANSAS

• Lionel BONNARD

• Mickael LHUILLIER

• Nicolas COUTURIER

• Papa-Yatma SARR

• Stéphane VERDUN