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Bérengère POCACHARD

MARSEILLE

En résumé

Ingénieur Microbiologie et biologie moléculaire – Ecole supérieure d’ingénieurs de Luminy (ESIL).

J’ai réalisé mon stage de fin d’études au sein de l'entreprise Inodiag (développement de micro-arrays à protéines pour le diagnostique sérologique). J'ai eu l’opportunité de gérer un projet en autonomie : développement d’un nouvel outil diagnostique.

Après ce stage, j’ai occupé un poste d’ingénieur de recherche dans le service de génétique chromosomique du Professeur Levy à l’hôpital La Timone enfants.
Mon projet qui a duré 15 mois portait sur l’étude génétique d’une cohorte de 250 patients sélectionnés pour leurs troubles de type autistique. Pour ce projet, j’ai été amenée à utiliser différentes techniques de biologie moléculaire (puces à ADN Agilent, qPCR, FISH, extraction ARN...), de microbiologie (culture bactérienne et extraction de BACs). Les spécificités et les résolutions différentes de ces techniques garantissent un diagnostique sûr et précis. J’ai également été impliquée dans la rédaction de certaines procédures techniques nécessaires au processus d’accréditation du laboratoire.

J’ai par la suite rejoint le CNRS pour intégrer un projet de microbiologie financé pour deux ans par la FRM. Ce projet a eu pour but d’étudier les modalités d’adaptation de Salmonella typhimurium à son environnement vacuolaire, suite à son intrusion dans l’organisme, par sa traversée de la paroi intestinale. Ce projet a nécessité l’utilisation de techniques purement microbiologiques (étude de croissance, stress test, compétition…), mais aussi de biologie moléculaire (clonage, design d’oligos, fusion transcriptionnelle pour la fabrication de biosenseurs, détection de fluorescence par TECAN, FACS) et enfin de culture cellulaire (culture et infection de cellules Raw). L’étude de ce pathogène s’est faite en laboratoire de type P2.

Je suis à la recherche d’un poste d’ingénieur R&D ou d’étude, en entreprise ou en laboratoire. Je souhaite mobiliser à la fois mes compétences techniques mais également mon désir d’évolution professionnelle vers des responsabilités managériales. Très attirée également par la Qualité, et ayant effectué un stage dans ce domaine, je serais très intéressée également par un poste d'ingénieur Assurance Qualité.

Mobilité : PACA
Disponibilité : Immédiate
Anglais : Toeic 840/990
Coordonnées : berengere.pocachard@gmail.com


Mes compétences :
Analyse des risques
Biologie
Biologie moléculaire
Biotechnologies
Gestion de projet
Microarrays
Microbiologie
Puces à ADN
QPCR
Qualité
Validation

Entreprises

  • CNRS - Laboratoire de chimie bactérienne, Pr F .Barras, Marseille - Ingénieur d'étude

    2010 - maintenant Etude de l’adaptation de Salmonella typhimurium à son environnement vacuolaire.
    Techniques : caractérisation de mutants, stress test, clonage, construction de bio-senseurs par fusions transcriptionnelles sur plasmides et sur chromosomes, design d’oligos, FACS, TECAN, culture cellulaire et infection de cellules RAW.

  • Service de génétique chromosomique, Prof N. Levy, La Timone Enfants, Marseille - Ingénieure de Recherche

    2009 - 2010 Etude du profil génétique (puces à ADN, qPCR, FISH) d’une cohorte d’environ 200 patients présentant des troubles autistiques.

    Objectifs :
    - Extraction et purification des ADN de patients
    - Analyse des ADN sur puces ADN haute résolution
    - Contrôle des anomalies détectées par qPCR
    - Préparation des BACs marqués pour les contrôles d’anomalies avec la technique FISH.
    - Veille bibliographique sur l’autisme et les gènes présentant une anomalie dans la cohorte
    - Rédaction de procédures (accréditation du laboratoire).

    Techniques :
    - extraction saline d’ADN génomique à partir de sang,
    - purification (QIAamp DNA Micro Kit),
    - contrôles qualités sur Nanodrop (Thermo Scientific) et Bioanalyzer 2100 (Agilent),
    - digestion par enzymes de restriction,
    - marquage de l’ADN avec fluorochromes (cyanines),
    - concentration d’ADN avec SpeedVac (Thermo Scientific),
    - hybridation sur puces à ADN Agilent (244K, 4x180K, 2x400K) puis analyse des résultats sur logiciel DNA Analytics,
    - design de primers,
    - qPCR (7500 Fast Real-Time PCR System),
    - culture bactérienne,
    - extraction de BACs,
    - marquage d’ADN par Nick Translation (Abbott) avec dUTP Spectrum Orange et Green,
    - hybridation in situ (FISH) sur préparations chromosomiques (Hybrite d’Abbott),
    - analyse des hybridations par lecture en microscopie à fluorescence.

    Résultats : Cohorte étudiée à 70%, plusieurs patients présentent des anomalies (duplications ou délétions) en cours de contrôle par qPCR et FISH.

  • Inodiag - Stage fin d'études Ingénieur Développement/Industrialisation

    2008 - 2008 Développement de kits de diagnostic in vitro pour la sérologie.
    Objectifs du stage : assurer la phase de développement du projet InoMust12 :
    - définition et mise en place du planning du projet
    - réalisation de puces à protéines (diagnostic in vitro) sur un nouveau type de support
    - évaluation de la compatibilité de l’Arrayer Affymétrix pour la production des nouvelles puces
    - validation et paramétrage d’un automate d’incubation type X-Y pour l’incubation des nouvelles puces.
    - mise au point de protocoles d’incubation manuelle et automatisée
    - réalisation de l’analyse des risques (dossier de conception des puces InoMuS.T.12).
    Résultats obtenus : évaluation de l’Arrayer achevée, paramétrage et validation de l’automate X-Y finalisés, mise au point de protocoles d’incubation performants. Analyse des risques validée.

  • Laboratoire Bioinorganique Structurale (LBS) - Stage de recherche appliquée

    2007 - 2007 Objectifs du stage : Création d’enzymes artificielles : construction de gènes hybrides par recombinaison homologue chez la levure S. cerevisiae, criblage et optimisation de procédés.
    Techniques utilisées : PCR, transformation de levures et bactéries, extraction de plasmides, électrophorèse sur gel d’agarose, extraction d’ADN sur gel et restriction enzymatique.
    Résultats obtenus : Transformations de levures réussies, mais aucune enzyme artificielle obtenue. Premiers résultats de l’optimisation encourageants.

  • Grands moulins Storione - Stage service qualité

    2006 - 2006 Stage effectué au sein du service qualité et produits. Objectifs du laboratoire : Contrôle de la qualité des matières premières, intermédiaires et des produits finis, respect du cahier des charges et de la norme ISO 9001. Objectifs du stage : Réaliser des échantillons représentatifs de blés et farines, réaliser des analyses physicochimiques sur échantillons et enfin veiller à la traçabilité des échantillons réalisés puis analysés.

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