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Cédric MEERSSEMAN

MONTPELLIER

En résumé

Fort de plus de 6 ans d'expérience professionnelle dans le domaine du séquençage/NGS, j'ai pour projet professionnel d'intégrer une entreprise en tant qu'Ingénieur R&D ou Expert technique en relation clientèle. Actuellement en poste en CDD, je suis à l'écoute d'opportunités en CDI me permettant de mettre à profit mes diverses connaissances et expériences sur un poste long terme.

Maîtrise des technologies de séquençage Sanger, Illumina, 10x Genomics, Pacifiques Biosciences, Oxford Nanopore Technologies et Bionano Genomics (Optical mapping).

Mes compétences :
Rédaction de protocoles et articles scientifiques
Veille bibliographique et technologique
Présentation de résultats en congrès
Anglais – niveau européen B2
Optimisation expérimentale
Gestion de projets

Entreprises

  • HalioDx - NGS Scientist

    2019 - maintenant Prise en charge des développements NGS à partir d’échantillons FFPE pour séquençage Illumina. Application à des projets en immuno-oncologie.

  • SOPHiA GENETICS - Subject Matter Expert

    2019 - 2019 Consolidation des connaissances sur les produits de l’entreprise dans le domaine du diagnostic moléculaire (panels de gènes et exomes) et formation des vendeurs.

  • Centre National de Recherche en Génomique Humaine - Post-doctorat

    2017 - 2018 Prise en charge des développements pour séquençage longs fragments via les technologies 10x Genomics et Bionano Genomics. Applications aux projets du labex GenMed (Homme).

    - Veille bibliographique et technologique.
    - Extractions d’ADN de haut-poids moléculaire (50-100 kb) et très haut-poids moléculaires (>300 kb) à partir de cellules humaines.
    - Maîtrise de la technologie 10x Genomics pour préparation de librairies de séquençage via séquenceurs Illumina (HiSeq-X), et analyse de données.
    - Maîtrise de la technologie Saphyr de Bionano Genomics et analyse de données.
    - Participation à des projets NGS.

  • HM.Clause - Ingénieur d'étude en Génétique moléculaire

    2016 - 2016 Etude et comparaison des technologies de seconde et troisième générations de séquençage.

    - Veille bibliographique et technologique.
    - Maîtrise des technologies de séquençage 454, Ion Torrent, Illumina, Pacific Biosciences et Oxford Nanopore.
    - Participation à des projets NGS.

  • UMR 5203 IGF, CNRS – INSERM U661, Montpellier - Ingénieur de recherche

    2014 - 2015 Caractériser la diversité moléculaire des cellules microgliales dans le contexte de la maladie d’Alzheimer (Modèle murin APP.PS1).

    - Expérimentation sur souris.
    - Réalisation de coupes au Cryostat sur tissu non fixé (épaisseur : 6 µm).
    - Capture de cellules microgliales par micro-dissection Laser.
    - Extractions d’ARN à partir de tissu et de faibles quantités de cellules (pg).
    - Double amplification d’ARN.
    - Réalisation de qRT-PCR (classique).
    - Acquisition d’images en mosaïque par microscopie à fluorescence et analyse.

  • UMR 1313 Génétique Animale et Biologie Intégrative, INRA – AgroParisTech, Jouy-en-Josas - Sauveteur Secouriste du Travail

    2011 - 2013

  • UMR 1313 GABI, INRA – AgroParisTech, Jouy-en-Josas et UMR 1061 GMA, INRA – Université de Limoges - Chargé de recherche stagiaire

    Limoges 2010 - 2014 Identifier et caractériser des promoteurs bidirectionnels (BiPs) chez l’espèce Bos taurus (Bovin).

    - Préparation de banques d’ADNc et production de données RNA-Seq et qRT-PCR (TLDA).
    - Normalisation et comparaison de données RNA-Seq et TLDA.
    - Création d’une méthode de normalisation corrigeant les biais du RNA-Seq (méthode SGTR).
    - Construction de divers vecteurs d’expression.
    - Transfection transitoire de cellules mammifères semi-adhérentes (C2C12 et COS-7)
    - Mesure de l’activité de gènes rapporteurs (GFP et DsRed) par microscopie à fluorescence et cytométrie en flux.
    - Analyse in silico de la composition et de la conservation de BiPs au cours de l’évolution.

  • UMR 6247 GReD, CNRS – Clermont Université – INSERM U 1103 - Ingénieur de recherche stagiaire

    2010 - 2010 Améliorer la connaissance sur la régulation du Facteur I, élément transposable de type LINE, chez l’espèce Drosophila melanogaster (Drosophile).

    - Design d’amorces PCR d’une dizaine d’éléments I ancestraux péricentromériques (dont l’Ip29).
    - Clonage des éléments I au sein de vecteurs plasmidiques.
    - Création d’une souche de drosophile transgénique par micro-injection d’embryons.
    - Réalisation de tests de stérilité.
    - Préparation de sondes ARN par transcription in vitro et dissection d’ovaires de drosophiles afin de réaliser des hybridations fluorescentes in situ d’ARN (RNA-FISH).
    - Localisation des ARNs d’intérêt par microscopie confocale.

  • UMR 1061 GMA, INRA – Université de Limoges - Ingénieur d’étude stagiaire

    Limoges 2009 - 2009 Réalisation d’une étude pilote afin de mettre en évidence des Copy Number Variants (CNVs) de type insertion/délétion chez l’espèce Bos taurus (Bovin).

    - Etude in silico en vue de sélectionner des régions d’insertion/délétion polymorphes putatives.
    - Validation expérimentale de régions d’intérêt par séquençage capillaire.

  • UMR 1061 GMA, INRA – Université de Limoges - Technicien stagiaire

    Limoges 2008 - 2008 Initiation aux techniques de génomique par analyse d’une souris mutante ENU, avec pour finalité l’affinage de la cartographie génétique.

    - PCR à moyen-débit.
    - Extractions d’ADN génomique à partir de queues de souris.
    - Génotypages à l’aide de marqueurs microsatellites.

  • Service Départemental d'Incendie et de Secours de la Charente-Maritime - Sauveteur en Mer Sapeur-Pompier

    2007 - 2011

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