Mes compétences :
Microsoft office
Bioinformatique : Design primers
Microbiologie
Biochimie
Biologie moléculaire : PCR, qPCR, RT-PCR, LAMP
Entreprises
Inserm
- Assistante Ingénieur en techniques biologiques
PARIS 132013 - maintenantMissions : Identification des déterminants moléculaires de l’adaptation d’Escherichia coli, en testant l’impact du polymorphisme nucléotidique et/ou l’inactivation de gènes.
Objectifs :
1. Construction des mutants E.coli par génie génétique (KO, KI, technologie "Lambda red recombineering" décrite par Datsenko et Wanner)
2. Caractérisation de l'effet des mutations sur l'évolution d'E.coli, par des courbes de croissance et des compétitions (Tecan Infinite M200, cytométrie en flux Guava EasyCyte Plus...)
3. Développement du système CRISPR/Cas9 chez E.coli
4. Autres : gestion des commandes et des stocks de consommables du laboratoire; encadrement d'étudiants
Techniques utilisées :
- Biologie moléculaire : extraction ADN/ARN/plasmides, PCR, qRT-PCR, purification et quantification au nanodrop/qubit, clonage/mutagenèse dirigée, préparation des cellules électrocompétentes, électroporation, tests de complémentation...
- Microbiologie : Préparation des milieux, autoclave, ensemencement des souches, mesure de la densité optique au spectrophotomètre (cuvette ou plaque), comptage des colonies (manuel ou au cytométrie en flux), cryoconservation des souches, courbes de croissance et compétitions (Tecan, FACS)...
- Bioinformatique : design d'amorces (Primer3Plus, PerlPrimer, BLAST, OligoAnalyzer), analyse des séquences nucléotidiques (BioEdit), alignement des gènes (MicroScope platform, ClustalW)
- Initiation à l'expérimentation animale : injection d'OGM dans le cou des souris, surveillance des souris, mise à mort des souris, broyage des rates.
ACOBIOM
- Stagiaire Ingénieure en R&D
Grabels2013 - 2013Développement d'un kit de diagnostic multiplexé pour la détection des poxvirus. Ce kit de diagnostic utilise des technologies basées sur de la Biologie Moléculaire. J'ai réalisé trois prototypes différents : un premier utilisant la technologie du Mini-Array, un autre utilisant une PCR combinée à un système "lateral flow" ou test immuno-chromatographique, et un dernier utilisant une amplification isothermale LAMP combinée à un test immuno-chromatographique ce qui permettait de s'affranchir de l'utilisation d'un thermocycleur.
Techniques utilisées :
- design des amorces
- PCR simplex et multiplex
- amplification isothermale (LAMP)
- électrophorèse en gel d'agarose
- hybridation/coloration sur membrane de nylon (technique mini-array)
- test immuno-chromatographique (« lateral flow »)
Sekisui Diagnostics (auparavant Genzyme)
- Stagiaire Ingénieure en R&D
2011 - 2012Développement de tests de criblage pour l'expression de phosphatases alcalines recombinantes dans Escherichia coli
- clonage
- tests de criblage avec BCIP
- dosages enzymatiques avec pNPP
- identification des protéines : gel SDS-PAGE
Biophyres
- Stagiaire Assistante Ingénieur en R&D
2011 - 2011Optimisation des milieux gélosés et des sacs de sciure de bois, pour la culture de Tuber melanosporum
- analyses génétiques : PCR
- HPLC
- chromatographie ionique des mycéliums et truffes
CHU Nîmes
- Stagiaire Technicienne de laboratoire
2011 - 2011La Leucémie Myéloïde Chronique : du diagnostic au suivi de la maladie résiduelle