PARIS 52014 - 2014Stage de Bioinformatique :
J'ai été en charge d’un sujet de recherche qui m’a amenée à utiliser plusieurs jeux de données du transcriptome ainsi que les annotations moléculaires et pathologiques associées. Encadrée par une ingénieure d’étude en bionformatique, je maîtrise désormais les bases du langage R pour l'analyse des données transcriptomiques (récupération de données et d'annotation, formatage de données, graphiques, tests statistiques, méthodes de classification supervisée et non-supervisée). Je sait utiliser le logiciel RStudio pour développer des scripts utilisant différentes librairies R issues du CRAN ou de bioconductor. J' ai également une bonne connaissance des sites de données publiques tels que GEO de NCBI, BioMart d'Ensembl, GeneCards, BioGPS, David. Lors de mon stage, J'ai a également assisté à deux cours dispensés par l'unité de bioinformatique de l'institut Curie ( « Next Generation Sequencing » et « R BioStats Trainng »).
