Université de Yale
- Postgraduate
2013 - 2015
Equipe du Dr Sandra Wolin. Objectif du travail :
• « Étude du packaging des ARNs non codant hôte par le VIH»
Techniques acquises:
Virologie : infection de cellules de mammifères avec les virus de la leucémie murine de Moloney (MoMLV) et de l’immunodéficience humaine (HIV, lentivirus défectif pseudotypé), dosage de l’activité virale (RT assay), concentration des virus par ultracentrifugation, titration des virus par FACS.
Biologie moléculaire :
• Acides nucléiques : extractions d’ARNs viral, RNA protection assay,membrane flotation assay (equilibrium flotation centrifugation).
• Protéique : Western Blot, Immunoprécipitation couplée ARN ou proteines.
Biologie cellulaire : culture de lignées cellulaires humaine, simienne, murine et de
poulet, transfections de ces dernières avec plasmides et siRNA, test luciférase.
RNAseq: production de libraries ARN viral, analyses informatiques des données avec les logiciels bowtie, cufflinks, IGB
INSERM U869
- Ingénieur d'études en techniques biologiques
2008 - 2013
Equipe du Dr Fabien Darfeuille
Objectif du travail:
" Implication de microARNs dans la réponse à l’infection par Helicobacter pylori : mise au point de la technique d’hybridation in situ de microARN dans des cellules humaines cancéreuses en culture"
"Étude de petits ARNs chez Helicobacter pylori"
Techniques acquises:
Microbiologie: Culture de bactéries pathogènes ou non (Ex : Escherichia coli et Helicobacter pylori). Formation et quantification de biofilms chez H. pylori.
Biologie moléculaire : PCR, RTqPCR, cRT-PCR, Northern Blot, gel d’empreinte, transcription et traduction in vitro, clonage et mutagenèse dirigée, extractions d’ARNs et d’ADN de cellules eucaryotes et procaryotes, hybridation sur colonies, séquencage, utilisation des radioéléments S35, P32.
Biologie cellulaire : culture de lignées cellulaires adhérentes ou non (Lignées gastriques (AGS, MKN7, 45, 74, NCI-N87), HeLa; Hek293; Huh7, HepG2, THP-1), transfections, hybridation in situ, co-culture avec H. pylori, cytométrie de flux, microscopie à épifluorescence et confocale.
Logiciels: Connaissances de Chemdraw Chromeleon (HPLC), Axiovision (microscopie de fluorescence), MEGA 5 (phylogénétique), Blast, Clutsal, dessins d’amorces PCR et qPCR.
Autres: Mise à jour du souchier, entretien des stocks de bactéries et de lignées cellulaires
Publications:
• Godeau, G., H. Arnion, C. Brun, C. Staedel and P. Barthélémy (2010). Fluorocarbon oligonucleotide conjugates for nucleic acids delivery. Medchemcomm 1, 76
• Godeau, G., C. Brun, H. Arnion, C. Staedel and P. Barthélémy (2010). Glycosyl-nucleoside fluorinated based amphiphiles as components of nanostructured hydrogels. Tetrahedron letters 51, 1012-1015.
Communication orale:
• Communication orale pour le RNA club, IECB à Pessac le 29 septembre 2011: H. Arnion: Studying small non-coding RNAs in bacteria Helicobacter pylori.
