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Hélène MOUSSARD

  • Université de Bordeaux
  • microbiologiste

Bordeaux

En résumé

Microbiologiste de formation, plus de 15 ans d'expérience dans la recherche scientifique publique.
Spécialisée dans l'étude de la biodiversité microbienne par des approches culturales et moléculaires. Compétences en Microbiologie, Biochimie, Biologie Moléculaire, Bioinformatique, Génomique, Ecologie microbienne et Génétique Moléculaire.

Conjointement à cette expérience de chercheur en microbiologie, ai également une expérience dans l'enseignement universitaire avec notamment 2 années à temps plein en tant qu'attachée temporaire d'enseignement et de recherche.

Entreprises

  • Université de Bordeaux - Microbiologiste

    Autre | Bordeaux (33000) 2016 - 2020 Ingénieur d’étude :
    Optimisation et automatisation d’une méthode biologique d’identification des sources de contaminations fécales dans les eaux de surface.

    Chargée de recherche:
    Etude du microbiote de le coque, dans le cadre d'un projet de recherche européen visant à restaurer la production et les services fournis par ce bivalve matin menacé par les maladies.
  • Institut de Recherche pour le Développement - Chargée de Recherche

    MARSEILLE 2 2014 - 2015 - projet de ANR RISCO: Réponses des microorganismes pélagiques à une contamination par sédiments pollués
    - Objectif du projet: déterminer les conséquences de la pollution par sédiments contaminés sur la diversité et la fonction des communautés microbiennes pélagiques, premiers maillons de la chaîne trophique.

    - Développement d’outils de Biologie Moléculaire et Bioinformatique
    - Travail en équipe pluridisciplinaire, contexte multiculturel
    - 2 missions de terrain en Tunisie
  • Université de Pau et des Pays de l'Adour - Attachée Temporaire d'Enseignement et Recherche (ATER)

    2013 - 2014 Enseignement:
    - Chargée de CM, TD et TP en Licence de Sciences de la Vie et Master BioProtection et Microbiologie de l’Environnement:
    - Disciplines enseignées: Biochimie , Biologie Moléculaire, Génétique, Microbiologie, Biotransformations Microbiologiques
    - Création de nouvel enseignement - Renouvellement des enseignements - Correction des examens


    Recherche en Biologie Moléculaire: séquençage haut débit d’ADN microbien
    Traitement de données par bioinformatique
  • Département des Sciences de la Vie - Université de Warwick - Angleterre - Chargée de Recherche

    2007 - 2011 Intitulés des missions:
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    -> Mission 1 (3 ans): Construction de nouveaux biocatalyseurs: ingénierie de nouvelles monooxygénases -Financement: Biotechnology and Biological Sciences Research Council, BBSRC.

    -> Mission 2 (1 an): Etude de la dynamique des communautés méthylotrophes actives dans des écosystèmes aquatiques marins - Financement: Natural Environment Research Council NERC.

    -> MIssion 3 (3 mois): Exploration des propriétés catalytiques de la méthane monooxygenases sMMO. Subvention: BBSRC.

    Expertises:
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    -> Isolation et caractérisation des bactéries méthanotrophes et méthylotrophes dans les environnements terrestres et marine
    -> Methane monooxygénases, alcanes et alcènes monooxygénases


    Compétences de laboratoire:
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    -> Microbiologie
    * Isolation, culture et caractérisation de méthanotrophes et méthylotrophes
    * Production de biomasse: culture de micro-organismes (autotrophes et hétérotrophes) en bioréacteurs

    -> Techniques d'écologie microbienne:
    * Extraction d'ADN et ARN, RT-PCR
    * DGGE
    * DNA-SIP et RNA-SIP (Marquage d’acides nucléiques avec un isotope stable (13C), séparation des acides nucléiques 12C- et 13C par gradient isopicnique (CsCl et CsTFA))
    * Utilisation et interprétation de puces à ADN diagnostique (logiciel GENEPIX PRO)

    -> Annotation génomique (MicroScope -MaGe)

    -> Génétique, mutagénèse et chimeragenesis (knock-out, four-primer overlap extension)

    -> Biochimie, Enzymologie
    * Expression et purification de protéines recombinantes
    * Tests d’activités enzymatiques
    * Electrode à oxygène de Clark
    * Préparation de fractions cellulaires
    * SDS-PAGE et NuPAGE™
    * Chromatographie en phase gazeuse (FID).

    Enseignement, Encadrement Scientifique:
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    -> Enseignement à des étudiants master 2 en microbiologie: "Phylogénie moléculaire: alignement de séquences et construction d'un arbre phylogénétique"

    -> Co- encadrement de 4 étudiants dont 2 doctorants et d'un chercheur en visite au laboratoire.

    -> Organisation fréquente de réunions de travail

    Communication Scientifique:
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    -> Rédaction d'un chapitre de livre et d'articles dans des revues internationales avec comité de lecture (7 dont 2 en tant que 1er auteur)
    -> Nombreuses communications orales ou écrites (poster) lors de réunions de travail avec des collaborateurs et de colloques internationaux.
  • Institut Universitaire Européen de la Mer, Université de Bretagne Occidentale - Doctorante - Chercheur

    2001 - 2006 Doctorat dans le Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes (UMR 6197), Brest. Sous la direction du Docteur Christian Jeanthon.

    Sujet de thèse:
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    Analyses moléculaires de la diversité et des fonctions de micro-organismes incultivés des sources hydrothermales profondes.

    Compétences:
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    -> Microbiologie:
    Techniques de culture et d’identification des procaryotes (bactéries et archaea) aérobies, anaérobies, mésophiles, hyperthermophiles, hétérotrophes et autotrophes.

    -> Biologie Moléculaire: Extraction d’ADN, PCR, Clonage et Séquençage

    -> Techniques d’écologie moléculaire: FISH, RFLP, PFGE

    -> Construction et analyse de banque métagénomique (fosmides)

    -> Méthodes de transformations cellulaires: utilisation de liposomes, formation de sphéroplastes et électroporation

    -> Bioinformatique:
    * Annotation et comparaison de génomes (logiciels et plateformes utilisés: Genostar, Artemis, Vector NTI)
    * Analyse phylogénétique des ARNr 16S et protéines (logiciels ARB, ClustalW, Phylowin, GCG et MEGA5)
    * Conception d’amorces et sondes oligonucléotidique (ARB, primer3)

    Communications scientifiques:
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    -> Rédaction du mémoire de thèse et soutenance orale: Thèse obtenue avec les félicitations du jury

    -> Rédactions d'articles scientifiques dans des revues internationales avec comité de lecture (4 articles en tant que 1er auteur)

    -> Encadrement d'une étudiante en licence et d'un étudiant en DEA
  • Station Biologique de Roscoff

    2000 - 2000

Formations

  • Institut Universitaire Européen De La Mer, Université De Bretagne Occidentale

    Plouzane 2001 - 2006 Doctorat

    Microbiologie Environnementale -
    Mention très honorable avec félicitations du jury.

    Thèse dirigée par le Dr Christian Jeanthon, soutenue en décembre 2006 à Brest.

    Financement: Allocation de recherche du Ministère de l’Enseignement et de la Recherche.
  • Institut Universitaire Européen De La Mer, Université De Bretagne Occidentale

    Plouzane 2000 - 2001 D.E.A.

    Microbiologie Fondamentale et Appliquée -
    Mention Bien.

    Stage D.E.A. dans le Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, UMR6197, Brest. Sous la direction des Professeurs Gaël Erauso et Daniel Prieur.
    Sujet: Optimisation de méthodes de transformation chez une Archaea hyperthermophile du genre Pyrococcus.
  • Université Caen Basse Normandie (Caen)

    Caen 1999 - 2000 Maîtrise de Biochimie Moléculaire et Cellulaire


    Mention Bien.

    Options: Physiologie et Biochimie Microbiennes, Signalisation et Prolifération Cellulaires, Physico-chimie des Macromolécules et Biologie Moléculaire
  • Université Caen Basse Normandie

    Caen 1998 - 1998 Licence


    Options: Microbiologie et Génétique microbienne, Immunologie, Biologie Moléculaire, Biochimie Structurale et Métabolique, Chimie Organique et Enzymologie.

Réseau

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