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Hugo DUVERGEY

Paris

En résumé

Mes compétences :
Bio-informatique
Bioinformatique
Biologie
Biologie biotechnologies
Biotechnologies
Informatique

Entreprises

  • CNRS - Ingénieur bioinformaticien

    Paris 2013 - maintenant CDD sur la Plateforme IMGT (International immunogenetics information system, Institut de Génétique Humaine, Montpellier).



    Outils : Java, OpenJPA, MySQL, Scripts shell, Perl

  • CNRS - Ingénieur bioinformaticien

    Paris 2011 - 2012 CDD sur la Plateforme de Protéomique Fonctionnelle (Institut de Génomique Fonctionnelle, Montpellier).

    Mise en place d'un LIMS permettant de stocker et tracer les données expérimentales de la plate-forme.

    * co-développement avec l'équipe CIBI de Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille
    * consultation régulière du personnel de la plate-forme pour préparer le déploiement du logiciel
    * développements d'outils périphériques au LIMS et spécifiques à la plate-forme :
    > interface de soumission et validation de fiches échantillons
    > annuaire LDAP des collaborateurs
    > script de transposition de données vers le LIMS à partir d'une arborescence de fichiers d'acquisition, d'analyse et de résultats
    > encadrement d'une stagiaire sur le service informatique de l'IGF

    Outils : PHP, MySQL, AJAX, Joomla!, LDAP

  • MédiFirst - Développeur

    2008 - 2011 CDI à MédiFirst, société éditrice de logiciels médicaux (Saint-Quentin-en-Yvelines)

    Projets divers sur des applications Web dédiées à l’Assistance Médicale à la Procréation et à la génétique médicale.

    * développement de nouvelles fonctionnalités, corrections et évolutions
    > exemple : intégration automatisée de données patients envoyées par les serveurs des hôpitaux
    * participation courante au support hotline (contact direct avec les personnels des différents hôpitaux et cliniques)
    * coordination d’équipes de 2 à 3 développeurs sur plusieurs périodes de 1 mois :
    > validations des cahiers des charges
    > aide au développement
    > gestion de projets multi-développeurs

    Outils : Java, PHP, MySQL, AJAX

  • INRA - Ingénieur bioinformaticien

    Paris 2007 - 2007 CDD à l’INRA de Jouy-en-Josas (unité Mathématique Informatique et Génome.).

    Design de sondes sur des micro-organismes vivant en milieu fromager.

    * correction d’un programme C préexistant effectuant le design de sondes
    * création de scripts PERL pour gérer les entrées et les sorties du programme
    * rédaction d’une documentation en anglais sur le logiciel et les scripts PERL
    * upload des sondes générées sur le site Web de l’entreprise chargée de faire le design des sondes in vivo.

    Outils : PERL, C, LateX

  • CNRS - Ingénieur bioinformaticien

    Paris 2006 - 2007 Contrat d’auxiliaire au CNRS de Gif-sur-Yvette (Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation.).

    Mise en place d’une base de données et d’une interface Web pour la gestion de populations d’abeilles.

    * établissement de la structure de la base de données
    * création d’une interface Web intuitive accessible aux différents membres de l’équipe
    * travail en binôme avec une biologiste

    Outils : PHP, MySQL, Javascript

  • Institut Pasteur - Stagiaire

    Paris 2005 - 2005 Stage à l’Institut Pasteur de Lille (unité INSERM 547 « schistosomiase et paludisme »).

    Mise en place d’un portail Web intégrant des logiciels bioinformatiques (outils de phylogénie : MrBayes, TREE-PUZZLE)

    * création d’un site Web présentant le personnel et les travaux de l’unité d’accueil
    * reprise de scripts CGI PERL permettant d’exécuter des programmes de phylogénie via une interface graphique

    Outils : PHP, MySQL, PERL

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Réseau

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