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Jean-Claude CHÈVRE

Paris

En résumé

Docteur en génétique moléculaire avec une formation initiale en biochimie, biologie du développement, biologie moléculaire, et organisation des génomes.
15 ans d'expérience dans la génomique et la génétique du diabète de type 2 et de l'obésité.
Particulièrement intéressé par
la recherche translationnelle et la "bio-curation",
en particulier par les approches bio-informatiques pour l'annotation, l'interprétation, la hiérarchisation des variants et des gènes en association avec les maladies / phénotypes, les réseaux biologiques (network) et voies métaboliques (pathways) et les médicaments,
plus généralement par le "big data to knowledge" pour la médecine de précision (precision medicine) et la biologie.

Mes compétences :
Biochimie
Biologie moléculaire
Génétique
Génomique
Biologie
Biotechnology
Biotechnologies

Entreprises

  • CNRS - Ingénieur de Recherche sur Projet (postdoctorant)

    Paris 2005 - 2010 UMR8199 dirigée par le Professeur Philippe Froguel, MD, PhD

    “Intégration génome entier centrée sur les gènes de données hétérogènes - génétiques, génomiques et fonctionnelles - concernant le diabète de type 2 et l'obésité pour: prioritisation de gènes issus d'études génome entier - d'expression, - d'association (WGAS) ou de CNVs; établissement de listes de gènes candidats pour séquençage par NGS «Next generation sequencing»; annotation fonctionnelle de SNPs et gènes (FTO, MTNR1B, HK1).“
    “Etudes génétiques et fonctionnelles de gènes candidats du diabète de type 2 ou de l’obésité: récepteur aux cannabinoides (CNR1), angiopoietines-like (ANGPTLs), C1orf32.“
    “Etude génomique et fonctionnelle du locus FTO associé à l’obésité.“

    Publications:Nature 2010 Feb; Diabetes 2009 Nov; Nature Genetics 2009 Jan, 2008 Dec, 2007 May; Human Molecular Genetics 2008 Jul.

    Raison du départ: limite des 6 ans atteinte sous contrat au CNRS, sans avoir jamais tenté les concours.
  • Columbia University, Columbia University Medical Center - Ingénieur de Recherche (postdoctorant)

    2000 - 2005 , Laboratoire de "Molecular Genetics" dirigé par le Professeur Rudolph L. Leibel, MD

    "Clonage positionnel - Cartographie physique et transcriptionnelle, in vitro et in silico, d'un locus responsable de la variabilité de l'hyperglycémie à jeun et en réponse au glucose (QTL, quantitative trait locus) dans un modèle de diabète de type 2 chez des souris obèses. Recherche de mutations par séquençage direct et études d'expression quantitative des transcripts identifiés afin de déterminer le gène susceptible d'être responsable du phénotype diabétique".

    Publication*: PLoS Genetics 2008 Jul.
  • CNRS - Ingénieur d'Etude (doctorant)

    Paris 1996 - 2000 CNRS UPRESA 8090, dirigé par le Professeur Philippe Froguel, MD, PhD

    "Etudes génétiques du diabète de type 2 de type MODY (Maturity-Onset Diabetes of the Young)”

Formations

  • FUN Université Numérique De France (MOOC)

    Paris 2016 - maintenant Aucun

    Plan du cours:
    Introduction
    Indicateurs
    Surveillance / études cas-témoins
    Etudes de cohorte
    Essais randomisés / dépistage
    Divers: Biais de classement, Enquêtes et sondages, Appariement, Fractions attribuables
    Examen
  • FUN Université Numérique De France (MOOC)

    Paris 2016 - 2016 aucun

    Score: 100%

    c'est tout un programme ...
    Qu'est-ce qu'un programme ?
    Langage source et langage cible.
    Structure d'un programme.
    Instructions d'entrées-sorties, déclarations, affectation.
    Prise en main des outils de développement.
    avec des si ...
    Instruction conditionnelle.
    Types et opérations.
    Approfondissement sur les variables et l'affectation.
    ça va durer encore
  • FUN Université Numérique De France (MOOC)

    Paris 2016 - maintenant aucun

    Introduction aux statistiques et à R, description d’une variable
    Lab 1 : Introduction à R studio, manipulation des fichiers et des variables
    Intervalles de confiance, association entre variables
    Lab 2 : Manipulation de données, résumés numériques et graphiques
    Lab 3 : RMarkdown et rapport automatisé
    Tests statistiques et pratique des tests
    Lab 4 : Mesures d'association, tests stat
  • Coursera.Org

    Cours En Ligne 2015 - maintenant aucun

    Introduction à Java
    Variables
    Expressions
    Structures de contrôle en Java
    Tableaux
    Chaînes de caractères
    Fonctions/Méthodes et réutilisabilité
    E/S de base
  • CNAM

    Paris 2011 - 2012 Certificat

    BNF101: Bases informatiques: Systèmes d'exploitation, bases de données, internet (60h) dont Unix (12h), HTML (14h), SQL (20h);
    BNF102: Initiation à la programmation: Scheme (60h);
    BNF104: Utilisation et applications de la bio-informatique (60h);
    BNF103: Algorithmique de la bioinformatique (60h)
    Moyenne générale : 13/20
  • Université Lille 2 Droit Et Sante

    Lille 2005 - 2006 Diplôme Universitaire

    Suivi mais non validé

    60 heures de cours magistraux, 45 heures d’études de cas sur machine avec le logiciel SPSS
  • Université Pierre Et Marie Curie Paris 6 (UPMC)

    Paris 1996 - 2000 Doctorat

    Thèse d' "Etude génétique du diabète de type 2 de type MODY (Maturity-Onset Diabetes of the Young)
    dirigée par le Professeur PHilippe Froguel dans l'Unité de recherche CNRS UPRESA 8090, Institut de Biologie de Lille, Institut Pasteur de Lille, Lille, France
    Mention Très bien
  • Université Pierre Et Marie Curie Paris 6 (UPMC)

    Paris 1994 - 1995 Diplôme d’Etudes Approfondies (DEA) / Master 2

    mention très bien.
    Sujet d'étude pratique: "Etablissement d'un modèle cellulaire stable avec inhibition du gène suppresseur de tumeur APC (Adenomatous Polyposis Coli) à l'aide d'un vecteur d'expression antisens",
    dirigé par le Dr M.M Lewin, directeur de l'unité de recherche INSERM U10, Hôpital Bichat, Paris
  • Université Pierre Et Marie Curie Paris 6 (UPMC)

    Paris 1993 - 1994 Master 1

    mention bien
  • Direction Centrale Du Service De Santé Des Armées

    Paris 1993 - 1994 Service Militaire
  • Université Pierre Et Marie Curie Paris 6 (UPMC)

    Paris 1992 - 1993 Master 1

    mention AB
    Module de "Biochimie, Génétique du développement et différenciation cellulaire", mention Bien
    Module de "Dynamique du génome" mention Bien
  • Université Pierre Et Marie Curie Paris 6 (UPMC)

    Paris 1987 - 1990 Diplôme d'Etudes Universitaires Générales (DEUG)
  • Ecole Alsacienne

    Paris 1973 - 1987 Baccalauréat

Réseau

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