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Julien PHILIPPE

LILLE

En résumé

Expertise biologique
- Séquençage de nouvelle génération : préparation de librairies pour du séquençage ciblé par PCR (Thunderstorm, RainDance Technologies) et par hybridation (HaloPlex, Agilent Technologies), séquençage de paillasse (MiSeq, Illumina)
- PCR, séquençage Sanger, qPCR and génotypage TaqMan (ViiA 7, Life Technologies), High Resolution Melt, PCR digitale (Biomark, Fluidigm), QC d’ADN (LabChip GX, PerkinHelmer)


Expertise bioinformatique
- Analyse des données NGS : Alamut Visual & Batch, HGMD, Genome Trax, CLC GW, SureCall, IPA, IVA
- Programmation robotique : Beckmann et Hamilton
- Analyse de séquences (SeqScape, Variant Reporter) et design de primers (Oligo 7, Visual OMP)

Anglais : TOEFL 94, TOEIC 805

Mes compétences :
Obésité
Diabète
Génétique
NGS

Entreprises

  • CNRS UMR8199 - Etudiant en thèse

    2011 - 2014 Étude des formes monogéniques de diabète de type 2 et d’obésité par le séquençage de nouvelle génération
  • CNRS UMR8199 (directeur : Pr. Philippe Froguel) - Ingénieur d’Etude en Génétique

    2010 - 2011 Sujet : génomique et physiologie moléculaire des maladies métaboliques (diabète et obésité)
    Techniques utilisées : PCR, électrophorèse, séquençage de première génération, High Resolution Melt (HRM), robots de pipetage, design de primers, analyse de séquences
  • Vivalis - Stage d'étude de la sialylation dans des cellules souches de canard

    Roussay, 2009 - 2009 Sujet : Expression et production de protéines thérapeutiques recombinantes dans les cellules souches de canard EBx®
    Techniques utilisées : PCR, digestion enzymatique, clonage bactérien, culture cellulaire, transfection, ELISA, FACS, chromatographie d'affinité, IEF, Western blot
  • Centre National de Génotypage - Stage d'études épigénétiques chez la souris

    2008 - 2008 Sujet : Développement d'un protocole d'enrichissement des séquences non-répétitives de l'ADN après immunoprécipitation de l'ADN méthylé
    Techniques utilisées : PCR, qPCR, purification d'ADN, fluorimétrie, utilisation de billes magnétiques, sonication, MeDIP, séquençage de seconde génération
  • Inserm U743 - Stage en immunologie sur la résistance au SIDA

    2007 - 2007 Sujet : Origine des macaques Rhésus et la résistance au SIDA
    Techniques utilisées : autopsie, extraction et purification d'ADN, PCR, séquençage de première génération, clonage de bactéries, phylogénie
  • Cork Cancer Research Centre - Stage sur la vaccination contre le cancer

    2006 - 2006 Sujet : Développement d'un vecteur viral recombiné contre le cancer chez la souris
    Techniques utilisées : extraction et purification d'ADN, électrophorèse, PCR, digestion enzymatique, clonage bactérien, culture cellulaire, électroporation de souris

Formations

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