Lyon2011 - 2014J'ai réalisé ma thèse au sein de l'UMR Agro-écologie (ex UMR Biologie et Gestion des Adventices) de l'INRA de Dijon.
Objectif: Comprendre les mécanismes génétiques de la résistance aux herbicides pour pouvoir, à plus long terme, envisager le développement d'un outil de diagnostic.
Le sujet de ma thèse : Détection, Identification et Caractérisation des gènes impliqués dans la résistance non liée à la cible aux herbicides chez le vulpin des champs (Alopecurus myosuroides).
Mes missions:
* Veille scientifique
* Essais en serre sur vulpins (multiplication par reproduction végétative, caractérisations phénotypiques, traitements herbicides, obtention F1 et F2)
* Travaux de biologie moléculaire (PCR, électrophorèse, qRT-PCR, extractionsARN/ADN, Dosage Nanodrop, SSH, Génotypage)
* Conception d’une base de données transcriptomiques avec l’INRA de Toulouse (LIPM). Mon rôle : Tri des séquences obtenues, calcul du N50, Vérification des données d’expression de la base, Analyse de ces données d’expression (R : DESeq - Differential gene expression analysis, TopGO - Enrichment analysis for Gene Ontology), comparaison du transcriptome avec d’autres espèces (Riz, maïs, Orge, Brachypodium), établissement d’une liste de gènes candidats à la résistance aux herbicides.
* Cours et TP donnés à l’université de Bourgogne
* Participation à des congrès internationaux (posters, présentations orales de mes travaux)
* Formation de stagiaires
AGROSUP DIJON
- Expérimentateur
DIJON2010 - 2011* Mise en place et réalisation d'essais en serre (caractérisation résistance vulpin à de nombreux herbicides)
* Mise en place du projet RNA-seq vulpin (choix des vulpins les plus résistants, choix des vulpins sensibles de référence)
* Bibliographie
* Réalisation de Posters pour des congrès
* Réalisation de SSH (hybridation soustractive suppressive)
INRA
- Stagiaire
Paris2010 - 2010
Cabinet Levesque - Dunkerque (59)
- Stagiaire
2008 - 2008Contrôle qualité sur les marchandises arrivant au port de Dunkerque, principalement des bananes venant du Suriname.
Expertise sur les produits en cas de problème (rupture de la chaîne du froid importante, denrées abimées etc...)
EARL Herman - Touffreville (27)
- Stagiaire
2007 - 2007Le but était de travailler dans une exploitation agricole afin de connaître mieux le métier. Cette exploitation est en plus spécialisée dans la production et le stockage de pommes de terre et dans la multiplication de plants de pomme de terre.
Molecular Plant Breeding: « mini-projet » en laboratoire, avec la rédaction d’un rapport rédigé comme une publication scientifique
* Résistances aux maladies : localisation d’un gène d’intérêt sur Arabidopsis thaliana
* Analyses moléculaires sur Kalanchoë surexprimant un gène d’intérêt
* Sélection assistée par marqueurs
* Analyse diversité génétique entre variétés de blés (marqueurs SSR et A
