Joseph CORTES

En résumé

Entreprises

• Pharma Pub On Line (2POL) - Développeur - Cadre

  2011 - 2014 Création d'une régie publicitaire (pour les pharmaciens) en lien avec SAGE 100, d'un Extranet client (factures...). Audit, étude des besoins, simplification des process, aide à la décision, support technique, formation interne et externe des outils développés.

• Quamediagroup - Chargé de Projet Flux XML - Cadre

  Aix-en-Provence 2008 - 2009 Chargé du développement du l'activité Trusted Feed, incluant : le relationnel client
  (reporting, explication du produit...), le relationnel fournisseur (Yahoo! et Orange), l'aspect technique, formation des commerciaux, réalisation des campagnes et management de 4 personnes, dont un technicien informatique.

• Babel Networks - Ingénieur d'Application & Chargé du contrôle qualité de l'application de télévision

  2008 - 2008 Chargé du contrôle qualité de l'application de télévision sur Internet : Babelgum.

• Baylor Institute for Immunology Research - Bioinformaticien - Biotechnicien

  2006 - 2007 15 mois au sein de l’équipe microarray pour la création d’outils informatique dédiés aux chercheurs :
  -Développer des outils pour aider l’analyse des données issues du scan des puces à ADN: analyse du besoin et élaboration du cahier des charges non formalisés, codage (JAVA, JSP, Spring, javascript, Ajax, CSS, MySQL et Tomcat) et test
  -Elaboration de la documentation : manuel utilisateur, manuel d’installation et démonstration
  -Intégrer les datasets immunologique publique et ceux générés au sein de l’institut, dans une database interne
  -Créer des portails Internet permettant la capture, l’organisation et la pré-analyse d’informations cliniques des échantillons envoyés au laboratoire pour y être analysés : analyse du besoin et élaboration du cahier des charges non formalisés, codage (JAVA avec POI pour création de fichiers de sortie en Excel) et test.
  
  6 mois au sein de l’équipe microarray pour la biologie moléculaire et puce à ADN : Obtenir l’ARN d’échantillons sanguins, les déposer sur puce et les scanner.
  
  Contexte informatique :
  Une fois les données des puces à ADN obtenues, des étapes de normalisations et de filtrages (enlever le bruit de fond de lame des intensités des spots d’ADN) sont réalisées. Ensuite le laboratoire a eu besoin de trier et identifier les gènes dont l’expression est statisquement différent par rapport à un groupe témoin. Il m’a donc été donné de concevoir un programme en Java qui permettait d’effectuer ces tâches et de donner les résultats sous forme de pages Excel.
  Avec le nombre grandissant de collaboration avec des études clinique, on m’a confié la réalisation de bases de données et formulaires internet, utilisable par les cliniciens depuis leur lieu de travail, et ce à travers 3 différents pays, afin d’initier l’envoi des échantillons sanguins, leur analyse, leur interprétation biologique avec études statistique s’appuyant sur les données clinique capturées.

• Integragen - Ingénieur bioinformaticien

  2005 - 2005
  Réalisation d'un programme informatique permettant le filtrage dynamique des données issues des puces CGH, produites au sein même de l’entreprise :
  - analyse du besoin et élaboration du cahier des charges non formalisés, codage (JAVA) et test
  - Elaboration de la documentation : manuel utilisateur.
  
  Contexte informatique :
  Le chercheur pour qui je travaillais avait besoin de pouvoir « jouer » avec les données de puce à ADN de l’entreprise via des jeux de filtre. Le but étant, à partir de même échantillons analysés dans différents laboratoires, de pouvoir comparer les résultats entre eux et d’arriver à la même conclusion biologique ; ou encore de pouvoir soutirer le plus d’information viable de puces ayant un des intensités de spots trop proche de celle de la lame, et donc enlevé de l’analyse par filtration avec le bruit de fond.
  
  Titre du rapport de stage : "Analyse des aberrations chromosomiques : Filtrage et transformation interactifs des données de puces à ADN"

Formations

• ESPE, Université Aix Marseille

  Aix En Provence 2014 - 2015 MASTER 1 - MEEF, option Biologie Génie Biologique
  
  MEEF : Métier de l'enseignement, de l'éducation et de la formation

• Institut Catholique De Lyon Master R&D Biotech/ESSEP 5

  Lyon 2005 - 2006 ESSEP 5 - Bioinformaticien
  
  Merci à Marie-Ange Becker! Et vive l'Europe quoiqu'on en dise.

• Université De Versailles Saint-Quentin-En-Yvelines (UVSQ)

  Guyancourt 2004 - 2005 MASTER 2 - BIG
  
  BIG : Bioinformatique et génomique
  Génie Biologique et Informatique - Université Evry Val d'Essonne.

• Univsersité D'Evry Val D'Essonne (Evry)

  Evry 2001 - 2004 DEUG, Licence et Maitrise GBI
  
  IUP GBI : Génie Biologique et Informatique - En 3 années

• Lycée Marie Curie

  Marseille 1999 - 2001 BTS Biotechnologie
  
  Brevet de Technicien Supérieur en Biotechnologie

• Lycée Ozenne

  Toulouse 1998 - 1999 Maths Sup TB
  
  TB : Technologies et biologie

• Lycée St Exupery

  Marseille 1996 - 1998 Bac. STL, option BGB
  
  Baccalauréat STL BGB : Science et technologie de laboratoire, option Biochimie génie biologique

Réseau

• Aurélie URBAIN

• Denis BOUILLET

• Fatena BELLAHCENE

• Isabelle TONNA

• Jean-Pierre DESVIGNES

• Jennifer CLOCHEAU

• Nadège KAMBOU PÉNÉ

• Noemie DURRAND

• Patrick CARMONA