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Kévin PATRON

TOURS

En résumé

Actuellement, je suis en fin de 3éme année de thèse, soutenance prévue pour décembre 2015.

Mon projet de recherche a eu pour objectif d'étudier la phylogenie, les inducteurs et la régulation de l'opéron fru2 de Streptococcus agalactiae. Ce travail a été valorisé par un article publié en 2015, et un autre en cours de finalisation.

Ainsi, je suis aujourd'hui à la recherche d'un contrat post doctoral dans les domaines de la biologie moléculaire et de la microbiologie, plus principalement en génétique et métabolisme microbien, en France ou à l'étranger. Ceci me permettrait de compléter mes compétences en génétique microbienne, tout en étendant ma formation à d’autres techniques.

Je suis disponible à partir de février 2016.

Mes compétences :
Microbiologie
Biologie Moléculaire
Génétique microbienne
Métabolisme carboné microbien
Microbiote
RT-qPCR
Protéine recombinante
Double hybride bactérien
Gel shift
Fusion transcriptionnelle
Mutagènese dirigée
Phylogénie
Typage moleculaire (MLST)
Extraction ADN, ARN, Protéine

Entreprises

  • IRFTLM - Enseignant

    2014 - 2015 Enseignements :
    - Cours magistraux (8 Heures) : Interaction hôtes-bactérie, Entérobactérie
    - Travaux pratiques (140 Heures) : Identification bactérienne

  • UMR 1282-INRA, Infectiologie et Santé Publique, Equipe 5 Bactéries et risques materno-foetal - Doctorant

    2012 - maintenant SUJET
    Phylogénie, Inducteurs et Régulation de l'opéron fru2 de Streptococcus agalactiae.


    RESUME
    Streptococcus agalactiae est la première cause d’infections néonatales, et est aussi un pathogène émergent chez l’adulte immunodéprimé. Le but de ma thèse est de caractériser l’opéron métabolique fru2 en identifiant les relations entre les capacités métaboliques de la bactérie, son adaptation à divers environnements, et l’expression de ses facteurs de virulence. J’ai montré que cet opéron a été acquis au cours de l’évolution, et n’est présent que chez les souches appartenant à certains complexes clonaux. J’ai ensuite démontré que certains milieux riches, liquides biologiques humain, ainsi que quatre sources de carbone permettent l’activation spécifique du promoteur de cet opéron. Enfin, j’ai caractérisé le rôle d’activateur transcriptionnel de Fru2R, montré qu'il se fixe au niveau de la région promotrice de l'opéron fru2, et identifié les acides aminés jouant un rôle essentiel dans la régulation de cet opéron.

    TECHNIQUES ET COMPETENCES ACQUISES :
    - Extraction : ADNg, ARN, protéine
    - Typage moléculaire : MSLT
    - Phylogénie : eBURST, NJ
    - Etude des promoteurs : fusion transcriptionnelle (lacZ), dosage B-Gal, Race PCR
    - Etude des transcrits : RT-PCR, RT-qPCR
    - Séquençage
    - Mutagènése dirigée (acide aminé) ou par délétion propre (gène et opéron)
    - Etude d'interaction ADN/Protéine : Surexpression/Purification de protéine, marquage d'ADN, gel shift
    - Etude d'interaction Protéine/Protéine : double hybride bactérien
    - Logiciels : MAGE,bioedit, NCBI, EndNote 6X, Genious, Bprom, Mobyle


    PUBLICATION
    - Patron K, Gilot P, Camiade E, Mereghetti L. 2105. An homolog of the Frz Phosphoenolpyruvate:carbohydrate phosphoTransferase System of extraintestinal pathogenic Escherichia coli is encoded on a genomic island in specific lineages of Streptococcus agalactiae. Infect. Genet. Evol. 32:44-50.

  • EA 4369 Interaction hôte, environnement et microorganisme. - Stagiaire Master I et Master II

    2011 - 2012 L’objectif de ces stages était d’étudier l’impact d’un stress hypergravitaire sur la composition et la diversité du microbiote intestinal dans un modèle murin de souris centrifugées. Dans un premier temps, il a été nécessaire d’optimiser et valider l’extraction de l’ADNg des contenus intra-luminaux et de fèces. Dans un deuxième temps, ce stage a porté sur l’étude de la composition et diversité du microbiote intestinal chez la souris, par le biais de deux approches de biologie moléculaire que sont la PCR quantitative et le pyroséquençage

    Méthodes & Techniques utilisées:
    - Dissection de souris
    - Extraction d'ADNg
    - PCR & qPCR
    - Pyroéquençage
    - Bio-informatique: Artemis, Bioedit, NCBI, RDPII ..

Formations

  • Université Tours Francois Rabelais

    Tours 2012 - 2012 Doctorat de Microbiologie

  • Université De Lorraine

    Vandoeuvre Les Nancy 2010 - 2012 Master de Microbiologie environnementale et sanitaire

    Connaissances acquises :
    - Ecologie microbienne des eaux et des systèmes de traitement biologique des eaux.
    - Notions en microbiologie alimentaire et digestive.
    - Notions sur les mécanismes de réorganisations génomiques (recombinaison, transfert horizontal) et d’adaptation des microorganismes lors d’un stress.

  • Université Henri Poincaré UHP (Vandoeuvre Les Nancy)

    Vandoeuvre Les Nancy 2008 - 2010 licence en Biologie Cellulaire, Moléculaire et Physiologie Animale et Végétale

    - Notions en biologie moléculaire (réplication, transcription, traduction), cellulaire et physiologie (système digestif, immunitaire, nerveux).
    - Techniques d’extraction d’ADN/ARN/protéines.
    - Techniques d’analyse des ADN/ARN/protéines (Northern blot et dérivés, électrophorèses, immuno-précipitation, …).

  • Lycée Pierre Mendes France

    Epinal 2003 - 2006 Bac scientifique

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