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Marion AGUIRREBENGOA

Paris

En résumé

Ingénieur, expérimentée dans le traitement de données de séquençage haut-débit dans la biologie cellulaire et moléculaire, je suis responsable d'une plateforme bioinformatique d'analyse de donnée dans un institut de biologie cellulaire et à la recherche d'un emploi dans les domaines des biostatistiques, statistiques industrielles ou le data mining.

Mes compétences :
SAP BI
SAS
Logiciel R
Biostatistiques
Informatique
biostatistics analysis
Microarrays
Scientific skills
SAS Statistical Package
SAP OFFICE
SAP
RNAseq processing
R processing
Quality Control
Python Programming
Matlab
Mass Spectrometry
Linux
Java
FORTRAN
Data Mining
C++
C Programming Language
Ada

Entreprises

  • Cnrs - Responsable plateforme - Ingénieur d'Etudes Bioinformatique/Biostatistique

    Paris 2016 - maintenant Création et Management de la plateforme BioInformatic Genomic Analysis (big-A) d'analyse des données à grande échelle du Centre de Biologie Moléculaire de Toulouse (CBI - FR3743)
    - Mise en place de la plateforme d'analyse des données à grande échelle du CBI
    - Analyse des données issues des séquençage haut débit du génome générées par les équipe du CBI
    - Développement de chaînes de traitements et d'applications web pour l'automatisation de taches
    - Formations internes
    - Développement de nouveaux outils et méthodes
    - Encadrement d'étudiants
  • CNRS / Université Paul Sabatier - Ingénieur de Recherche Biostatistique - Bioinformatique

    2013 - 2016 Responsable des activités bioinformatiques et biostatistiques dans les équipes “Chromatine et Prolifération cellulaire” (Dr Trouche) et “Chromatine et Raparation de l'ADN” (Dr Legube)
    - Traitement des données issues du séquençage haut débit des génomes dans les organismes modèles (ChIP-seq, RNA-seq, HiC)
    - Prgrammation R & Shell
    - Formation interne
    - Encadrement d'étudiants
    Projets nationaux et européens : INCA- Stress chromatinien et induction de la sénéscence, ERC-2014-CoG- DIVA
  • Sopra Group - Consultante BI

    Paris 2012 - 2013 Projet de reporting sous SAP pour des projets Airbus :
    - Reporting BO
    - Design d'univers
  • INSERM - Stagiaire

    PARIS 13 2012 - 2012 Titre du stage:
    Étude des relations et interdépendances entre biologie, bio-informatique et statistique.

    Descriptif du stage :
    Développement et application de méthodes pour corréler les données patients avec les données omiques : Programmation R&C/C++, analyse biostatistique.
    Stage en collaboration avec plateforme Biostatistique de Toulouse (Institut de mathématiques)
  • Airbus Opération SAS - Stagiaire

    Blagnac 2011 - 2011 Résumé du stage :
    Comparaison des différentes méthodes de Lissage de courbes par approximation d'un nuage de points, application du Krigeage a des jeux de données, comparaison avec la méthode réseau de neurones RBF

    Problème Posé :
    L’objectif du stage est, à partir d’un nuage de points, de trouver une fonction qui approche au mieux le nuage de points tout en lissant les irrégularités des données initiales. Autrement dit sachant x qui produit une sortie y = f(x) et on souhaite retrouver une approximation f' de f plus lisse à partir de la seule observation d’un certain nombre de couples entrée-sortie (xi,yi)

    Résolution :
    Etude bibliographique des différentes méthodes d'approximation et d'interpolation envisageables. Test de la méthode du Kriging et comparaison avec le réseau de neurones (RBF)

Formations

  • INSA TOULOUSE (Toulouse)

    Toulouse 2007 - 2012 Génie mathématique et modélisation - option statistique
  • EISTI

    Pau 2006 - 2007 Première année du cycle préparatoire intégré de l'EISTI
  • Lycée Jacques Monod

    Lescar 2002 - 2005 Baccalauréat

    Baccalauréat option S-SVT, spécialité Mathematiques, mention AB

Réseau