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Mathias ANTOINE

Suresnes

En résumé

L'objectif principal de l'équipe de Biologie Structurale est de développer et d'appliquer des approches de pointe en biologie structurale et en caractérisation cinétique pour soutenir plusieurs programmes de target-based drug-discovery, depuis les étapes de validation de hits jusqu'a l'optimisation de leads.
Les domaines thérapeutiques abordés incluent l'oncologie, la cardiologie, le métabolisme, la rhumatologie et la neurologie.
Parmi les protéines ciblées figurent notamment kinases, protéases, déacétylases, oxydo-réductases, récepteurs nucléaires, GEFs,...
La gestion efficace des projets et des ressources, associée à la formation technique et scientifique de l'équipe est cruciale pour faire face aux défis d'un environnement multi-projets évoluant rapidement.

Mes priorités s'articulent sur 3 axes principaux :
• Cristallographie des protéines : Installation d'une plateforme robotisée de cristallogenèse et de diffraction aux rayons X.
• Spectrométrie de Masse : Mise en place et supervision d'une plateforme ESI-MS incluant un TOF et un Q-TWIMS-TOF. Les applications incluent la mesure d'interaction protéine-ligand par MS native et la caractérisation structurale fine de protéines recombinantes par nanoLC-MS-MS.
• Spectroscopie Optique et Cinétiques : Gestion d'une plateforme incluant intensité et anisotropie de fluorescence, dichroïsme circulaire et absorption UV-visible. Le couplage avec un stopped-flow donne accès aux cinétiques à l'état pré-stationnaire. Ses approches sont appliquées à la mesure de cinétiques d'interactions protéine-ligand et à la caractérisation structurale des protéines.

En complément de ces activités internes, de fortes collaborations ont été nouées avec des experts scientifiques des secteurs privé et publique, particulièrement avec plusieurs lignes de lumière du synchrotron SOLEIL.

Enzymologiste moléculaire de formation, je garde un très fort intérêt pour ce domaine, et plus particulièrement pour les relations structure/dynamique/fonction et l'enzymologie redox. J'ai régulièrement l'opportunité d'aider des collègues travaillant sur projets d'enzymologie difficiles.

Mes compétences :
Enzymologie
Fluorescence
Spectrométrie de masse
Protéines
Cristallographie
Spectroscopies

Entreprises

  • Servier - Attaché de Recherche - Chef d'Equipe Biologie Structurale

    Suresnes 2011 - maintenant Pilotage des activités de Biologie Structurale et support aux activités de Caractérisations des Protéines et Enzymologie

    • Encadrement de 2 post-docs : cristallographie des protéines / biophysique du repliement de protéines synthétiques, lignes PROXIMA1 et DISCO au synchrotron SOLEIL
    • Encadrement d'un technicien : Interactions protéine-ligands par Spectrométrie de Masse / Fluorescence / Cinétique Rapide
    • Pilotage du projet d'installation d'une plateforme de cristallogenèse et cristallographie.
    • Développement/amélioration de la plate-forme de Spectrométrie de Masse
    • Gestion de la plateforme de spectroscopie optique et cinétique rapide
  • Servier - Attaché Scientifique - Protein Science

    Suresnes 2009 - 2011 Pilotage des activités de Caractérisations des Protéines et Enzymologie

    • Mise en place d'une plateforme de Spectrométrie de Masse
    • Encadrement de techniciens
    • Gestion de la plateforme de spectroscopie optique et cinétique rapide

    Caractérisation de Protéines
    _ Homogénéité, Etat oligomérique (SEC-MALS, DLS, SAXS)
    _ Identité, Modification post-traductionelles (ESI-MS)
    _ Stabilité, Optimisation des tampons (CD, DLS, DSF)

    Interactions Protéine-Ligand
    _ Cinétique d'association / dissociation (Stopped-Flow Fluorescence)
    _ Mesure directe d'interaction, Stoechiométrie (Fluorescence, ESI-MS supramoléculaire en conditions natives, CD)
  • SERVIER - Chercheur Post-doctoral

    Suresnes 2007 - 2009 _ Fixation des ligands et dynamique conformationelle de la Glucokinase humaine.
    _ Mise en place et amélioration de la plateforme de spectroscopie optique (UV-Vis, Fluorescence, CD) et de cinétique rapide (Stopped-Flow Fluorescence).

    Encadré par les Drs Gilles Ferry et Jean Boutin
  • University of Nebraska-Lincoln - Post-doctoral Research Associate

    2006 - 2007 Etude du mécanisme catalytique de la CO déshydrogénase II de Carboxydothermus hydrogenoformans, une enzyme à centres [Ni-4Fe-5S] et [4Fe-4S].

    Metallo-enzymologie : Spectroscopie UV-Vis - Notion de RPE - Travail en chambre anaérobie.

    Encadré par le Pr. Stephen Ragsdale
  • Université Henri Poincaré Nancy 1 - ATER

    2005 - 2006 96 heures d'enseignements (Génie Génétique, Biochimie, Enzymologie)
  • Université Nancy Poincaré Nancy 1 - Moniteur

    2002 - 2005 192 heures d'enseignement (Génie Génétique, Méthodologie)
  • Université Henri Poincaré Nancy 1 - Doctorant

    2002 - 2006 Les Méthionine Sulfoxyde Réductases de classe A : catalyse, spécificité structurale et relations structure-fonction.

    Laboratoire de Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire

    Directeur de thèse : Pr. G. Branlant et Co-Directeur : Pr. S. Boschi-Muller.

    Génie génétique : Clonage - Séquençage - Mutagenèse dirigée - PCR.

    Microbiologie : Culture cellulaire bactérienne (E .coli). Surexpression de protéines recombinantes - Marquage isotopique N15/C13.

    Purification de protéines : Chromatographie basse pression, FPLC (filtration sur gel - échange d’ions - interactions hydrophobes), HPLC (phase inverse).

    Enzymologie – Biochimie des Protéines : Cinétique à l’état stationnaire et pré-stationnaire (stopped-flow et quenched-flow) - Etudes cinétiques en fonction du pH - Spectroscopie optique : absorption UV-visible, fluorescence.

    Collaborations : Spectrométrie de masse (LSMBO, Strasbourg), RMN (LCPM, Nancy), Cristallographie (LCM3B, Nancy), Chimie théorique (CBT, Nancy), Chimie organique (LCPM, Nancy).

Formations

Réseau

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