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Najla BEN HASSINE

PARIS

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En résumé

Je suis BEN HASSINE Najla, diplômée en Master Génomique et Post Génomique (parcours Professionnel: GBI, Génie Biologique et Informatique) à l’Université d’Evry Val d’Essonne.
Je dispose de rigoureuses connaissances en traitement de données, bases de données biologiques, création d’interface graphique et la conception de site web.
Mon expérience professionnelle requise pendant les stages et CDD m'a donné une approche concrète du travail en équipe que je souhaiterai mettre à profit en intégrant une équipe de développement bioinformatique.
Ma participation dans la mise en œuvre d’applications bioinformatiques destinées aux traitements de données biologiques me permettra de mettre en pratique les enseignements reçus au cours de mon cursus, et d’enrichir mon expérience dans le domaine de la bioinformatique.


Mes compétences :
HTML/XHTML
Css/css3
Python
CGI
PHP / MYSQL
JAVA
Postgresql
FileZilla
Perl
Sql
Génomique
Traitement de données
Base de données
Protéomique
Interface graphique
UML
Joomla 2.5
Test unitaire

Entreprises

  • Hôpital Necker-Enfants Malades - Ingénieur d'étude clinique hospitalier

    2014 - 2015 PROJET : DÉPISTAGE AVANCE NON-INVASIF DE LA TRISOMIE 21 FŒTALE SUR DU SANG MATERNEL.

    MISSIONS:
    - Mise en place d'un workflow afin d'ordonnancer les contrôles qualités, les traitements et les analyses des données au cours de l'étude.
    - Mise en place d'un pipeline d'analyse bioinformatique et biostatistique pour traiter les données obtenues par NGS (HiSeq).
    - Création d'une base de données pour la gestion des données et des résultats.
    - Développement d'une interface web pour l'interrogation des données.

  • INRA - IE BIOINFORMATIQUE

    Paris 2013 - 2013 - Développement d’outils et leur intégration au sein du pipeline d’analyse de données NGS.
    - Traitements et analyses de données de séquençage (NGS) de type HiSeq 2000.
    - Recherche de variants génétiques (SNP, INDELS) dans des mutants EMS.
    - Rédaction de rapport d’analyses et de la documentation pour les outils developpés (Latex).

  • INRA JOUY EN JOSAS - IE bioinformatique

    2012 - 2012 PROJET:
    ETUDE DE L'INFLUENCE DU MICROBIOTE INTESTINAL SUR L'AXE DU STRESS AIGU CHEZ LE RAT PAR DES APPROCHES : PROTEOMIQUE, TRANSCRIPTOMIQUE ET BIOINFORMATIQUE.

    MISSIONS:
    - Expérimentation animale.
    - Extraction des ARN, RNA Nano Chip, qTLDA.
    - Eléctrophorèse1D couplée à la LC-MS/MS.
    - Traitement de données de la spectrométrie de masse.
    - Création d’une base de donnée.
    - Création d'un site web pour intégrer et interroger les données biologiques.

  • CENTRE NATIONAL DE RECHERCHES SCIENTIFIQUES CNRS - Stagiaire en bioinformatique

    2011 - 2011 PROJET:
    DEVELOPPEMENT D’OUTILS BIOINFORMATIQUES DESTINES AUX ANALYSES QUANTITATIVES DE SPECTROMETRIE DE MASSE A HAUT DEBIT DE TYPE : « LABEL FREE SPECTRAL COUNTING ».

    MISSIONS:
    - Développement, en Python, d’outils d’extraction et de filtration de données à partir de Mascot.
    - Conception de l'interface graphique associée.

  • ISSB - Stagiaire en bioinformatique

    2010 - 2010 PROJET :
    ANNOTATION DE SEQUENCES D’ADNc COMPLETS DE Xenopus tropicalis.

    MISSIONS:
    - Traitement des données brutes de séquençage par (bash, awk, Perl).
    - Détection des séquences hétérologues et des séquences contaminées par (Perl, BioPerl, Blast).
    - Nettoyage de séquences par EMBOSS (l’outil vectorstrip).
    - Recherche d’ORF.
    - Recherche de similitude par (blastn, blastx).

  • HOPITAL HABIB THAMEUR TUNIS - Technicien de laboratoire d'analyses médicales

    2007 - 2008 Biochimie, banque du sang, bactériologie

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