Imaginatif, curieux et obstiné, je suis docteur en bioinformatique, biologie structurale et genomique.
Mes compétences :
Base de données
Bio-informatique
Entreprises
Aix Marseille Université
- Post-doctorant
Marseille2014 - maintenantDans le cadre du contrat CESBIC (Critical Enzymes for Sustainable Biofuels from Cellulose) administré par l’ADEME (Agence de l'environnement et de la maîtrise de l'Énergie), je participe à l’annotation de génomes fongiques au sein du laboratoire de glycogénomique dirigé par Bernard Henrissat et en partenariat avec des laboratoires européens de recherche publique et privé.
Le travail se déroulera en deux parties consécutives, nécessitant des compétences de génomique fonctionnelle et de bio-informatique. De nombreux génomes fongiques non accessibles dans les bases de données publiques seront annotés et analysés. L’étude portera principalement sur les protéines de la famille GH61 codées dans ces génomes. Ces protéines enzymatiques sont des lytic-polysaccharide mono-oxydases participant à la dégradation de sucres complexes. Les produits de ces catalyses seront utilisable comme biocarburant notamment. Dans un deuxième temps, les résultats de ce travail seront formatés pour être intégrés à la base de données CAZY (www.cazy.org).
Inra
- Post-doctorant
Paris2011 - 2014Mise a jour et gestion de la base de donnée des proteines à structure a/b Hydrolase: http://bioweb.ensam.inra.fr/ESTHERB/general?what=index
Production et cristalisation de proteines de la famille des a/b Hydrolase en systeme bacterien.
Laboratoire d'analyse biologiques et medicale
- Analyses bacteriologiques des prelevement biologique
2011 - 2011
Ecole de l'ADN de Marseille (Tous chercheur)
- Intervenant
2007 - 2007Encadrement d'un groupe de 10 étudiants pour la réalisation d'un T.P. de génetique sur 2 jours.
Colloque de l’EDSVS
- Co-organisateur et membre du Jury.
2006 - 2006
Association étudiante Hippo'These
- Membre du comité d'administration et chargé du site web
2006 - 2008Organisation d'evenements comme les journée biotechno en 2008
Inserm Centre de Recherche en Cancerologie de Marseille
- Doctorant
2006 - 2010Géneration d'une carte d'interaction proteine-proteine comportant tout les domaines PDZ du ver C. elegans par la technique de double hybride.
Analysedu réseau d'interaction par des outils bioinformatiques et statistiques.
Mise en place d'un outil d'investigation (le PIPE pour PDZ Interacting Protein Explorer)des interactions PDZ-proteines pour toutes proteines d'interet.