Mes compétences :
Biologie moléculaire
Cartographie
Sequençage
NGS
Clonage
Entreprises
Assistance publique - Hôpitaux de Paris
- Ingénieur hospitalier en biologie
Paris2013 - maintenantIngénieur au sein du service de Microbiologie de l’hôpital Beaujon.
Transfert de technologies pour le diagnostic et l’épidémiologie microbienne : mises au point techniques puis transfert de la théorie et du savoir-faire aux techniciens de laboratoire du service, concernant les technologies faisant appel à la biologie moléculaire.
Mise au point de protocole pour faciliter l’élucidation de mécanismes de résistance aux antibiotiques chez les Entérobactéries les plus fréquentes en pathologie humaine.
Référent de logiciel, d’automates et d’appareils de diagnostic (installation, formation en interne et mise à jour, relation avec le fournisseur) : SIRIUS (JRI-suivi des températures), Séquenceur Applied Biosystems® 3130 (Life Technologie), GeneXpert (Cepheid), MALDI microflex (BRUKER)
-Techniques utilisées : Extraction ARN/ADN, PCR, RT-qPCR, clonage, électroporation, séquençage Sanger, utilisation des outils de bioinformatique en ligne (BLAST, alignement de séquence, contig), spectrométrie de masse
Genoscreen
- Ingénieur production NGS
Lille2012 - 2013CDD Ingénieur 6 mois au sein de la plate-forme de séquençage de masse.
Participation aux projets de métagénomique, de la réception des échantillons aux rendus des résultats aux clients.
-Techniques utilisées :Préparation de librairies et séquençage sur GS-FLX 454 Roche
Institut Pasteur
- Ingénieur biologie moléculaire
Paris2012 - 2012CDD de 6 mois (Janvier-Juin 2012) au sein de la plate forme de génotypage des pathogènes et santé publique.
- Participation aux activités de service de la plate-forme (séquençage d'ADN pour les Centres Nationaux de Référence- Technique Sanger)
- Prise en charge de plusieurs projets de caractérisation génétique de pathogènes par séquençage sanger, NGS (HiSeq 2000 Illumina), MLST, VNTR .
- Techniques utilisées : séquençage Sanger, préparation de librairies Nextera pour séquençage sur HiSeq 2000 Illumina. Logiciel d’analyse de séquences : BioNumerics
Centre R&D Nestlé Tours
- Assistante de recherche
2010 - 2011CDD 7 mois Novembre 2010-Juin 2011
Mon projet est d'enrichir la carte génétique Arabica ainsi que la carte génétique internationale Robusta en marqueurs microsatellites.
Centre R&D Nestlé Tours
- Stagiaire
2010 - 20108 mois de stage sur la cartographie et recherche de QTLs chez Coffea arabica
- Techniques utilisées : Extraction d'ADN, PCR, électrophorèse capillaire ABI PRISM 3500, HRM, génotypage par la technologie TaqMan
- Logiciels utilisés : JoinMap 4 et MapQTL 5.0
Université de Liverpool (UK)
- Stagiaire
2009 - 20096 mois de stage sur l'étude des gènes intervenant dans le métabolisme CAM chez la plante Kalanchoë fedtschenkoi.
- Techniques utilisées : Clonage, constructions RNAi et 35S, PCR, semi q RT-PCR, digestions enzymatiques, culture in vitro, transformation de plantes, extraction d'ARN.
INRA de Sophia-Antipolis
- Stagiaire
2006 - 200610 semaine de stage sur l'étude de la biodiversité du champignon Botritis cinerea.
- techniques utilisées : Culture du champignon, extraction d'ADN, PCR : amplification de microsatellites.