Paris2015 - maintenantIn charge of the bioinformatics analyses for Transcriptomic and Epigenetic Platform.
Université Paris-Sud
- Ingénieur d'étude en bioinformatique
Orsay2012 - 2015Mission principale : Développement d'outils pour l'analyse de données RIBO-seq
Autres :
* Analyses de données NGS : RNA-seq, assemblages (de novo et sur référence), recherche de variants (SNP, insertions/délétions, variants structuraux)
* Analyses statistiques : Expression différentielle avec R et Bioconductor, statistiques de base avec R ou Scipy (python)
* Développements : Python/Perl et dérivés (Bioperl, API Ensembl, Biopython, MatPlotLib) ;
* Galaxy : Installation et gestion d'une version locale, ajout d'outils (ToolShed et développement d'outils à façon)
* Travail collaboratif : Subversion, Trac, Eclipse KDE
INRA
- Apprentie en Bioinformatique
Paris2010 - 2012* Développement d'un pipeline de détection et d'analyse de micro-ARN (Perl, Bash, Awk) ;
* Recherche et annotation fonctionnelle de SNP (Samtools, GATK, outils EnsEmbl) ;
* Configuration d'une base Biomart locale et intégration des données.
Laboratoire de Biologie Neuro-Vasculaire Intégrée (Université Angers)
- Stagiaire
2010 - 2010Modélisation in silico du récepteur de la thyrotrophine (TSH)
Laboratoire LITIS - EA
- Stagiaire
2009 - 2009Recherche de régions promotrices in silico du gène SigX chez Pseudomonas
