2010 - maintenantResponsable de l'élaboration de produits logiciels.
Coordinateur d'un groupe de travail dans le projet BioIntelligence.
Genomining
- Chef de projet
2003 - 2009MISSIONS DE CONSEIL
- Plusieurs missions de conseil scientifique (secteur systèmes d'information) ou de conseil stratégique auprès de l'industrie pharmaceutique/centres de recherche publics, en contact direct avec des Directions informatique/scientifique.
CHEF DE PROJETS BIOINFORMATIQUES
- Elaboration de systèmes d'information dans le domaine scientifique
- Participation à un projet européen du 6ème PCRD (~ 20 partenaires européens, durée 5 ans) : développements d'outils informatiques et de méthodologies pour l'étude des insertions de vecteurs de thérapie génique.
- Analyses scientifiques dans le cadre de prestations auprès de laboratoires académiques
- Conception et programmation de prototypes de produits logiciels développés par la société
DIVERS
- Représentation, avant-vente, rédaction de propositions et de contrats, recrutement.
Genoscope - Centre National de Séquençage
- Chef de projet
2000 - 2003Annotation du chromosome 14 humain : développement d'un pipeline d'annotation et d'interfaces utilisateurs, confrontation des procédures et des résultats d'annotations avec le consortium international de séquençage (rencontres annuelles au Sanger Institute, Cambridge, Angleterre). Encadrement d'une personne pour le développement des applications, participation active dans l'animation d'un groupe d'une dizaine de personnes impliquées dans le processus d'annotation (formation, élaboration de procédures, contrôle qualité).
Publication : The DNA sequence and analysis of human chromosome 14. Nature. 2003.
Séquençage du chromosome 14 humain : développement d'une procédure de re-positionnement cartographique entre deux versions de séquence assemblée, développement de procédures automatisées pour la gestion du "Finishing" du chromosome 14.
Gestion bio-informatique du projet de séquençage de la bactérie Lactobacillus Bulgaricus.
Expertise scientifique et technique dans des projets d'annotations.
Publications :
- Comparative analysis of BAC and whole genome shotgun sequences from an Anopheles gambiae region related to Plasmodium encapsulation. Insect Biochemistry and Molecular Biology. 2005.
- Genome-wide analyses based on comparative genomics. Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 2003.
- Assessing the Drosophila melanogaster and Anopheles gambiae genome annotations using genome-wide sequence comparisons. Genome Research. 2003.
Institut Pasteur
- Chercheur stagiaire dans le cadre de ma thèse
Paris1996 - 2000Thèse de biotechnologie dont le sujet était la caractérisation d'un mimétique de l'interleukine-2. Thèse réalisée dans l'Unité d'Immunogénétique cellulaire à L'Institut Pasteur. Mention très honorable avec les félicitations du jury.
Apprentissage de techniques de laboratoire : culture cellulaire, signaux de transduction (immuno-précipitation, western-blot), production/purification d'anticorps, études structure/fonction (tests de fixation, ELISA, SPR).
Travaux de synthèse et de rédaction : demandes de financements (ARC, Ligue contre le cancer, financement Pasteur Weizman), publications scientifiques, prise de brevet (USPTO 20060018873), présentations orales (congrès, soutenance de thèse).
Formation EMBO sur l'étude des signaux de transduction à l'Institut Weizmann, Rehovot, Israël.
Publications
- Structural analysis and modeling of a synthetic interleukin-2 mimetic and its interleukin-2Rbeta2 receptor. Journal of Biological Chemistry. 2003.
- Characterization of an IL-2 mimetic with therapeutic potential. Cellular and Molecular Biology. 2001.
- IL-2R beta agonist P1-30 acts in synergy with IL-2, IL-4, IL-9, and IL-15: biological and molecular effects. Journal of Immunology. 2000.
- The first alpha helix of interleukin (IL)-2 folds as a homotetramer, acts as an agonist of the IL-2 receptor beta chain, and induces lymphokine-activated killer cells. Journal of Experimental Medicine. 2000.
Institut Pasteur
- Chercheur stagiaire dans le cadre de mon DEA
Paris1994 - 1995DEA "Biotechnologie anticorps et récepteurs cellulaires pour immunoanalyse et ciblage", Université Paris V.
Apprentissage de techniques de laboratoire : culture cellulaire, production/purification d'anticorps, études structure/fonction (tests de fixation, ELISA, SPR).
Publications :
- Analysis of human IL-2/IL-2 receptor beta chain interactions: monoclonal antibody H2-8 and new IL-2 mutants define the critical role of alpha helix-A of IL-2. Cytokine. 1997.
- Biological and receptor-binding activities of human interleukin-2 mutated at residues 20Asp, 125Cys or 127Ser. European Cytokine Network. 1995.
