Mes compétences :
Bio-informatique
Bioinformatique
Entreprises
Institut Curie
- Ingénieur Recherche
PARIS 52013 - maintenant
CEA, Genoscope
- Post-doc
2011 - 2013Participitation au projet SynBioWatch(http://www.genoscope.cns.fr/synbiowatch/)
- Mise en place d'une plateforme d'analyses des données haut débit.
- Intégration au gestionnaire de workflow BIRDS (Bio Informatics Rules Driven System)
- Analyse des données d'un métagénome aérien (en collaboration avec la DGA).
CNRS, Université-Paris Sud
- Doctorat en bioinformatique
2007 - 2010"Génomique comparée et développement de nouveaux outils bioinformatiques permettant l'analyse de la diversité métabolique des Eumycota"
- Détection des protéines orthologues chez une cinquantaine de génomes de Champignons (par similarité de séquences et approches phylogéniques)
- Annotation des groupes d'orthologues
- Développement d'un outil, FUNGIpath (http://www.fungipath.u-psud.fr), afin de permettre l'étude de la conservation d'une voie métabolique donnée
- Analyse des résultats
Paris2006 - 2007Stage Recherche à l'Institut de Génétique et de Microbiologie (Université Paris Sud, Orsay).
Recherche d'orthologues à l'aide de différentes approches (Meilleurs Hits Réciproques, OrthoMCL, Inparanoid et analyse phylogénique).
Ecole Nationale Supérieure Des Industries Chimiques (Nancy)
Nancy2003 - 2006option bioinformatique
Stage Ingénieur réalisé chez Bayer CropSience (Lyon).
Étude des kinases, et plus particulièrement des histidine kinases, de Champignons :
- Détection par similarité de séquences (à l'aide du programme BLAST et des motifs PFAM).
- Analyse phylogénique et étude détaillée des différents groupes d'histidine kinases.
