Siphi-Chaya SAR

En résumé

Entreprises

• Inserm - Ingénieure d’étude en bioinformatique

  PARIS 13 2015 - 2015 Objectif :
   Mise en place d’un workflow sous Galaxy et analyse des données de séquençage.
  Missions :
   Installation et configuration des logiciels, MobaXterm, VMWare
   Mise en place d’un workflow sous le serveur Galaxy, Bowtie2, MarkDuplicates, MACS
   Annotation des gènes enrichis, R et programme BETA sous Galaxy Cistrome, Présentations d’avancement de projet devant l’équipe

• INRA - Bioinformaticienne

  Paris 2014 - 2014 Objectif :
   Etude d’évolution des gènes subtélomériques chez les levures du clade Lachancea
  Missions :
   Recueil du besoin, Extraction des données (Python et Biopython)
   Analyse du contenu en gènes des subtélomères (Python)
   Alignement des séquences (BioEdit), Validation de l’hypothèse (R), Présentations d’avancement de projet devant l’équipe

• IBCP - Bioinformaticienne

  2013 - 2013 Objectif :
   Détermination des interactions protéine-protéine par approche-bioinformatique
  Missions :
   Extraction des données publiques (R), Visualisation et analyse des réseaux protéiques, iGraph (package sous R)

Formations

• Université Rennes 1

  Rennes 2012 - 2015 Master 2 Bio-Informatique et Génomique
  
  Systèmes et Réseaux sur le système Unix, la programmation en python, Java, la génomique fonctionnelle (approches haut débit de type transcriptome et protéome), Bio-informatique en génomique sur l’utilisation des logiciels les plus courants (MySQL,Blast, Fasta, Clustal, ScanProsite)

• Université Du Maine

  Le Mans 2009 - 2012 Licence Bio-Chimie