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Siphi-Chaya SAR

PARIS 13

En résumé

Mes compétences :
Python Programming
MySQL
Java
VMware
UNIX
Personal Home Page
Microsoft Windows XP
Microsoft Windows Vista
Microsoft Windows 7
Microsoft Windows
Microsoft Excel
Mac OS X
Linux
Galaxy
Apple Mac

Entreprises

  • Inserm - Ingénieure d’étude en bioinformatique

    PARIS 13 2015 - 2015 Objectif :
     Mise en place d’un workflow sous Galaxy et analyse des données de séquençage.
    Missions :
     Installation et configuration des logiciels, MobaXterm, VMWare
     Mise en place d’un workflow sous le serveur Galaxy, Bowtie2, MarkDuplicates, MACS
     Annotation des gènes enrichis, R et programme BETA sous Galaxy Cistrome, Présentations d’avancement de projet devant l’équipe

  • INRA - Bioinformaticienne

    Paris 2014 - 2014 Objectif :
     Etude d’évolution des gènes subtélomériques chez les levures du clade Lachancea
    Missions :
     Recueil du besoin, Extraction des données (Python et Biopython)
     Analyse du contenu en gènes des subtélomères (Python)
     Alignement des séquences (BioEdit), Validation de l’hypothèse (R), Présentations d’avancement de projet devant l’équipe

  • IBCP - Bioinformaticienne

    2013 - 2013 Objectif :
     Détermination des interactions protéine-protéine par approche-bioinformatique
    Missions :
     Extraction des données publiques (R), Visualisation et analyse des réseaux protéiques, iGraph (package sous R)

Formations

  • Université Rennes 1

    Rennes 2012 - 2015 Master 2 Bio-Informatique et Génomique

    Systèmes et Réseaux sur le système Unix, la programmation en python, Java, la génomique fonctionnelle (approches haut débit de type transcriptome et protéome), Bio-informatique en génomique sur l’utilisation des logiciels les plus courants (MySQL,Blast, Fasta, Clustal, ScanProsite)

  • Université Du Maine

    Le Mans 2009 - 2012 Licence Bio-Chimie
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