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Thierry WASSELIN

GÖTTINGEN

En résumé

Ingénieur en chimie analytique, je me suis spécialisé dans le domaine de l’analyse protéomique par spectrométrie de masse. Ayant acquis une première expérience au sein du L.SM.B.O (Laboratoire de spectrométrie de masse bio-organique, Strasbourg), je continue à évoluer dans ce domaine en ayant travaillé sur la plateforme analytique du ZMBH (Zentrum für Molekulare Biologie Heidelberg, Heidelberg) puis maintenant à l’UMG (Universitätsmedizin Göttingen, Göttingen). Je poursuis ma carrière en Allemagne, mettant à profit ma formation d’ingénieur trilingue acquise à l’EPCM et mon affinité pour l’allemand. Je conjugue ainsi langues étrangères (allemand, anglais, notamment) et sciences.

Mes compétences :
Spectrométrie de masse
Chimie analytique
Gestion de projet
Electrophorèse 1D
Chromatographie liquide
Proteomique
Bio-informatique

Entreprises

  • Universitätsmedizin Göttingen - Ingénieur

    2016 - maintenant Au sein de la plateforme analytique de l’UMG (Universitätsmedizin Göttingen), je réalise l'analyse protéomique de divers échantillons biologiques sur des instruments de type Orbitrap (QExactive) et Q-TOF (ABSciex, Triple TOF 5600+). Je veille également aux bonnes performances instrumentales.

    Spectromètres de masse :
    - Orbitrap QExactive
    - TripleTOF 5600+

    HPLC :
    - Easy nLC 1000
    - Eksigent

    Outils bioinformatiques appliqués à l'analyse protéomique :
    - Moteurs de recherche (MASCOT)
    - Scaffold
    - MaxQuant
    - Perseus

  • ZMBH - Ingénieur

    2015 - 2016 Affecté à la plateforme analytique du ZMBH, mes missions étaient les suivantes :
    • Préparation des échantillons biologiques en vue des analyses protéomiques par spectrométrie de masse
    • Calibration des instruments et suivi des performances instrumentales grâce à un système de contrôle qualité
    • Réalisation des analyses sur des instruments de type Orbitrap
    • Exploitations des données : Recherche dans les banques de données
    • Transmission des résultats aux groupes de recherche

    En parallèle, j’ai travaillé sur deux projets
    • Optimisation de la fragmentation HCD sur l’Orbitrap Elite et évaluation de son efficacité et de sa complémentarité avec la fragmentation CID. Utilisation des résultats pour des analyses de routine et projets de recherche.
    • Intégration et utilisation d’un script provenant du groupe de recherche d’Oliver Kohlbacher sur ProteomeDiscoverer en vue de l’exploitation des données de quantification « label-free »

  • CNRS - Doctorant

    Paris 2007 - 2011 Mon travail a consisté à développer de nouvelles approches méthodologiques en protéomique a travers une meilleure compréhension des données de spectrométrie de masse et l'utilisation d'outils bioinformatiques.

    Mes projets de recherche ont porté sur le cancer du côlon, le jeûne prolongé et la reproduction.

    - cancer du côlon : utilisation du modèle de xénogreffe. Validation du modèle par l'analyse protéomique et détermination de l'origine des protéines. Analyses différentielles pour comprendre les mécanismes de résistance au traitement.

    - Jeûne prolongé : études sur le foie et trois muscles (coeur, soleus, tibialis). Analyse différentielle par analyse d'image de gels 2D. Analyse par MALDI-TOF et nano LC-MS/MS des spots selectionnés. Contrôle des identifications.

    - Reproduction : Etude portant sur la caractérisation d'une protéine, la vitellogénine, impliquée dans le statut reproducteur. Détermination des séquences peptidiques par séquençage de novo. Mise en évidence de deux isoformes.

    Maîtrise des instruments et outils bioinformatiques :

    Spectromètres de masse :
    - MALDI-TOF
    - ESI-Ion Trap
    - Q-TOF

    HPLC :
    - Agilent 1100
    - Agilent 1200

    Outils bioinformatiques appliqués à l'analyse protéomique :
    - Analyse de gel 2D (PDQuest)
    - Séquençage de novo (PEAKS)
    - Moteurs de recherche (MASCOT, OMSSA)

  • L.S.M.B.O - Ingénieur (stage master recherche)

    2007 - 2007 Le Laboratoire de spectrométrie de masse bio-organique de Strasbourg (L.S.M.B.O) est un laboratoire de recherche du CNRS et de l'université Louis Pasteur. Il est spécialisé dans la protéomique et l'étude des interactions non covalentes.
    Ses axes de recherches sont principalement liés à des thématiques biologiques

    Sujet : Le Cancer colorectal est le 3ème cancer en France avec près de 40 000 cas diagnostiqués en France. Le taux de mortalité est proche de 40 % dû à une détection tardive. Le modèle de xénogreffe représente un modèle de choix pour l'étude de la tumeur. .

    Mon travail au cours de ce stage Master a consisté à valider le modèle de xénogreffe par l'approche protéomique :
    - Utilisation de spectromètres de masse MALDI-TOF et ESI-Q-TOF.
    - Analyse des resultats par MASCOT et BLAST.
    - Mise en place d'une méthode de validation systématique de la taxonomie.

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