CEA Saclay
- PhD
Gif-sur-Yvette
2007 - 2010
Laboratoire : DSV / I²BM / SHFJ / INSERM U1023 / laboratoire d'Imagerie in vivo de l'expression des gènes
Projet: Sélections d'aptamères pour la recherche, la thérapie et l'imagerie des cancers
Contexte:
Les aptamères sont des oligonucléotides (ADN, ARN simples brins modifiés ou non) sélectionnés pour interagir avec un cible donnée. Ces cibles incluent des petites molécules telles que des molécules organiques, des macromolécules comme des protéines mais également des systèmes complexes tels que des cellules entières ou des bactéries.
Les aptamères sont sélectionnés par une technique appelée SELEX pour Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment. A partir d'une banque aléatoire d'oligonucléotides, les séquences les plus affines pour un cible donnée sont sélectionnées grâce à des cycles successifs de sélection et d'amplification.
Les aptamères ont des propriétés comparables aux anticorps et les mêmes champs d'application : outils de purification par chromatographie d'affinité, de modulation de l'activité protéique, de détection (ELISA, cytométrie de flux, électrophorèse capillaire, PCR quantitative, microarrays, biosenseurs, imagerie in vivo) et outils thérapeutiques (aptamères à activité thérapeutique ou transporteurs de molécules thérapeutiques).
Missions:
- scientifiques et techniques
Utilisation d'une méthode particulière de SELEX (appelée Cell-SELEX) pour sélectionner des aptamères dirigés contre des marqueurs de surfaces cellulaires. Screening des candidats obtenus (binding et tests phénotypiques sur cellules), Identification des cibles des meilleurs candidats et validation des cibles, Etude approfondie des propriétés de ces aptamères par microscopie, cytométrie en flux et imagerie optique in vivo
-gestion de projet de recherche
veille scientifique et technique, établissement et mise en place de protocoles expérimentaux, analyse, synthèse et présentation des résultats, travail en équipe, encadrement de techniciens et d'un étudiant de master 2
- Valorisation
2 brevets
- Publications
In vivo uses of aptamers selected against cell surface biomarkers for therapy and molecular imaging.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22738730
Methods To Identify Aptamers against Cell Surface Biomarkers
http://www.mdpi.com/1424-8247/4/9/1216
- Communications scientifiques
Communications orales lors de congrès nationaux et internationaux dont :
8ème rencontre sifrARN. Dourdan, France => Prix de la meilleure présentation orale
- Compétences techniques :
Biologie moléculaire, Biologie cellulaire, Biochimie
Extraction d'acides nucléiques, Transcription reverse, Transcription d'ADN en ARN 2'F-Py, PCR, PCRq, Clonage & séquençage, Marquage d'acides nucléiques (aléatoire, 3'), Transfection (plasmides, siRNA), Mutagénèse dirigée, Chromatographie d'affinité, Extraction de protéines, Electrophorèse SDS-PAGE, Western-Blot, Culture cellulaire, FACS, Microscopie à fluorescence, Angiogenèse in vitro, Xénogreffes, Imagerie optique in vivo
