2015 - maintenantAnalyse statistique de données patients sur des essais cliniques de Phase I à III
Génération de règles d’associations à partir de méthodes statistiques et datamining dans le but d’identifier des signatures liées à l’efficacité, tolérance, ou profils dose-réponse d’un médicament ou de combinaison de drogues à partir de données cliniques (Mesures laboratoire, Electrocardiogramme, Signes vitaux, Paramètres hématologiques et biochimiques, etc).
Missions :
- Construction de la base de données discrétisée
- Identification de groupes de patients (clustering hiérarchique)
- Génération des règles et réseaux d’association via KEM (Knowledge Extraction Management – logiciel de datamining développé en interne)
- Génération des signatures logiques complexes et modèles prédictifs.
Programmation R et Utilisation de scripts KNIME
Ariana Pharmaceuticals
- Stagiaire
2015 - 2015A l’aide d’analyses statistiques de données transcriptomiques, étude de l'impact de l’utilisation de données publiques provenant de la base de données TCGA (The Cancer Genome Atlas) sur l'algorithme WINTHER, algorithme prédictif générant, à partir de données de profils d’expression de gènes collectées auprès de patients atteints de cancers (sein, poumon, colon,…), un classement des traitements thérapeutiques (disponibles ou en essai clinique) à partir de la liste des gènes différentiellement exprimés.
Programmation R et Utilisation de scripts de la plateforme d’analyse de données KNIME.
Institut de Biochimie et Biophysique Moléculaire et Cellulaire, CNRS
- Stagiaire
2014 - 2014Introduction à une étude structurale par cristallographie
Missions et manipulations :
- Obtention de cristaux de protéines par cristallographie optimisation puis congélation
- Etude des cristaux par diffractions aux rayons X au Synchrotron Soleil Paris Saclay
- Affinement de la structure protéique grâce aux logiciels CCP4 et Coot (logiciel de modélisation moléculaire)
Umea Center for Molecular Medicine (UCMM), Suède
- Stagiaire
2013 - 2013Etude des protéines et mécanismes impliqués dans le développement de la vulve du ver nématode Caenorhabditis elegans
Missions et manipulations :
-Croisements de différentes souches de Caenorhabditis elegans (wild type et mutantes)
-Observations du phénotype de la descendance grâce au microscope confocal et microscope à fluorescence
