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Gaëlle BLANDIN

Marseille

En résumé

Après un Doctorat en Sciences effectué à l'Institut Pasteur, j'ai passé trois ans et demi outre-atlantique (Etats-Unis) où j'ai travaillé à TIGR en tant qu'analyste sur les génomes de trois parasites qui sont chacun à l'origine de la maladie du sommeil, de la maladie de Chagas et de leishmanioses.
Depuis janvier 2006, je suis chef de projet à Généthon sur un projet visant à identifier les interactions protéines-protéines des protéines impliquées dans certains types de maladies musculaires rares.


2006- : Généthon, France. Chef de projet. Groupe du Dr I. Richard - Dystrophies des Ceintures.

2002-2005 : TIGR, USA. Chercheur CDD + Analyste en Bioinformatique. Groupe du Dr N. El-Sayed.

1998-2001 : Institut Pasteur, France. Etudiant/Chercheur en Doctorat "Analyse de Génomes et Modélisation Moléculaire". Laboratoire du Pr. B. Dujon.

Mes compétences :
Bio-informatique
Bioinformatique
Consultant
Génomique
Ingénieur
ornithologie
Protéomique
Sequençage
Support

Entreprises

  • Aix-Marseille Université - Ingénieur de recherche

    Marseille 2009 - maintenant javascript:void(0);

  • Généthon - Chercheur chef de projet

    Ivry 2006 - 2009 Première entreprise européenne à but non lucratif largement financée par l'AFM, Généthon est une structure unique dans laquelle chercheurs, techniciens, pharmaciens et médecins élaborent ensemble des technologies grâce auxquelles sont mis en développement clinique des thérapeutiques nouvelles, telles que la thérapie génique ou la thérapie cellulaire, pour traiter des maladies rares ou orphelines d’origine génétique.

    Ma mission consiste à gérer un projet visant à identifier les interactions protéiques au sein de la cellule musculaire, avec un focus sur des protéines particulières à l'origine de certaines maladies neuromusculaires. La technique du double-hybride a été utilisée, en partenariat avec la société de biotechnologie Hybrigenics et la validation de certaines interactions est testée en utilisant différentes approches expérimentales (co-immunoprécipitation, FRET ou visualisation de la co-localisation par immunohistochimie sur muscles de souris).

  • The Institute for Genomic Research (TIGR) - Analyste en bioinformatique

    2003 - 2005 Activité de The Institute for Genomic Research (TIGR) :
    TIGR est un institut américain à but non lucratif dédié au décryptage et à l'analyse de génomes. En 1995, TIGR a séquencé et analysé le premier génome bactérien. L'institut est doté d'un grand centre de séquençage qui collabore étroitement avec six départements travaillant sur des projets de recherche originaux qui leur sont propres : "microbial genomics", "parasite genomics", "mammalian genomics", "plant genomics", "viral genomics" et "bioinformatics". En particulier, le département de bioinformatique développe des softwares d'assemblage, d'annotation et de comparaison de génomes qui sont largement distribués dans la communauté scientifique.

    Missions et réalisations effectuées dans le cadre de mon poste (dans les départements "parasite genomics" et "bioinformatics"):
    (Voir : http://www.tigr.org/news/pr_07_14_05.shtml)
    • Génomique de deux parasites protozoaires, Trypanosoma brucei et T. cruzi : coordinatrice du séquençage, de la fermeture et de l’annotation du génome de T. brucei , responsable de l’annotation des régions « spécifiques » au génome de T. cruzi.
    • Etude comparative des génomes de trois parasites : T. brucei, T. cruzi et Leishmania major. Coordinatrice du projet de développement d’outils de visualisation et d’analyse destinés à l’étude de l’architecture des génomes et à la comparaison de leur contenu en gènes ; participation à l’étude de l’évolution des rétrotransposons de type non-LTR.
    L'ensemble de mes travaux ont donné lieu à plusieurs publications, en particulier à trois articles dans le journal scientifique américain Science en juillet 2005.

  • The Institute for Genomic Research (TIGR) - Chercheur CDD (Post-doc)

    2002 - 2003 Dans le cadre de mon post-doc, j'ai travaillé dans le groupe du Dr Najib El-Sayed (département "parasite genomics") sur différents projets :
    • Génomique du parasite protozoaire Trypanosoma brucei : coordinatrice du séquençage, de la fermeture et de l’annotation du génome.
    • Mise en place de puces à ADN pour le génome de T. brucei : responsable des analyses préliminaires de comparaison entre produits de PCR et différents types d’oligomères.

  • Institut Pasteur Paris / Université Paris7 - Doctorante (étudiant/chercheur en thèse)

    1997 - 2001 Suite à l'obtention du DEA (Master) Analyse de Génomes et Modélisation Moléculaire de l'université Paris7, j'ai effectué mon travail de thèse dans le laboratoire du Pr. Bernard Dujon (Unité de Génétique Moléculaire des Levures).
    Mon travail a porté principalement sur l'évolution des génomes de levures.
    Il s'est agit d'analyser la redondance du génome de la levure de boulangerie Saccharomyces cerevisiae, d'élaborer et de réaliser des analyses bioinformatiques dédiées à l’étude comparative des génomes de 13 autres levures (programme Génolevures I).
    Ce travail collaboratif a donné lieu à la publication d'un numéro spécial dans le journal scientifique FEBS Letters (décembre 2000) et contenant 21 articles originaux.

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