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Arnaud LE CAVORZIN

Gentilly

En résumé

Bioinformaticien et Biologie Moléculaire pour Biocodex, je suis en charge de l'annotation et de la validation de données génomiques... ainsi que de la partie biologie moléculaire concernant l'extraction d'ADN et d'ARN et les essais PCR et QPCR.
Je m'occupe également de l'analyse de données métagénomiques, et des statistiques.


Formation et connaissances :
- OS : Windows, Linux (Ubuntu, Fedora) et Mac OS
- Php, html
- Python, Perl
- Sql, Oracle
- Analyses statistiques sous R
- Outils de traitement de textes et de gestion bibliographique (Open Office, Microsoft Office, LaTeX, Endnote, Zotero, Bibus...)
- Divers outils de traitement de données génomique et protéomique : prédiction de gènes, modélisation de protéines...

Biologie :
- Parcours à la base axé Génomique et Protéomique
- Expériences en laboratoire et analyses biologiques : analyses et traitement de données de puces Exon, PCR, QPCR, NFP, Groupes, analyses de facteurs de coagulations...

Entreprises

  • Biocodex - Bioinformaticien

    Gentilly 2012 - maintenant

  • Inria et Irset Seraic - Stagiaire

    2012 - 2012 Modélisation du réseau d'activation du TGFB1 dans le cadre de la fibrose hépatique.

    Analyse des données existantes dans les différentes bases de données, curation d'articles, mise en place d'un modèle discret dynamique

    Utilisation du modèle pour rechercher de nouvelles propriétés, pour mieux comprendre le fonctionnement de ce processus complexe.
    Utilisation du modèle pour comparer des conditions physiopathologiques particulières.

  • Inserm U936 - Stagiaire

    2011 - 2011 Mise en place et développement d'un outil en ligne de recherche bibliographique à partir de listes de gènes issues par exemple de données de microarray.

    Développement de l'outil en php, html.
    Mise en place de bases de données SQL pour les requêtes.
    Mise en place d'un test statistique pour pondérer les informations proposées aux utilisateurs.

  • CHU Pontchaillou service d'hématologie biologique et unité Inserm U917 - Employé en tant que technicien de recherche clinique

    2010 - 2010 Analyses de données des microarrays Affymetrix Human Exon dans le cadre de la recherche de marqueurs sanguins pour le Lymphome Diffus à Grandes Cellules B.

    Identification de marqueurs suite à l'hybridation des microarrays : utilisation de R et du software Partek Genomics Suite.

    Validation biologique des marqueurs en PCR, Q-PCR et tests Elisa.

  • CHU Pontchaillou service d'hématologie biologique, Unités Inserm U936 et U917 - Stagiaire

    2009 - 2009 Analyses de données de puces Affymetrix Human Exon pour la recherche de marqueurs sanguins dans le cas de Lymphomes Diffus à Grandes Cellules B.

    Analyse des données avec R et Partek Genomics Suite
    Validation biologique par PCR et Q-PCR.

  • Laboratoire de la Clinique St Côme - Technicien d'analyses médicales secteurs hématologie

    2008 - 2008 Analyses médicales de prises de sang:

    - Numération, formule et plaquettes
    - Facteurs de coagulations
    - Groupes sanguins

Formations

Réseau

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