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Blachon SYLVAIN

MONTMORENCY

En résumé

Après une formation d'ingénieur en biochimie à l'INSA de Lyon, je me suis intéressé à la bioinformatique.

En 2007, j'ai obtenu le diplôme de docteur en Informatique après une thèse portant sur la fouille de données d'expression de gènes.

Actuellement, je travaille au Max-Planck Institute de Golm sur le projet GoForSys, en tant que post-doc. GoForSys est un projet national de Biologie des Systèmes visant à mieux comprendre la photosynthèse.

D'un point de vue informatique, fouille de données et modélisation sont les deux axes de mon projet de recherche - le tout dans un environnement stimulant, mêlant biologistes, informaticiens, mathématiciens et physiciens - des populations savantes aux modes de pensée divers voire divergents mais ô combien enrichissants !

Parallèlement, je candidate aux postes de Maître de conférences dans les universités françaises.

Mes compétences :
Bio-informatique
Bioinformatique
Biologie
Docteur ingénieur
Fouille de données
Génomique
Modélisation
Protéomique
Transcriptomique

Entreprises

  • IRISA / INRIA à Rennes - Post Doc

    2007 - maintenant Financé par l'INRIA, mon projet était dédié à l'étude de la tumeur d'Ewing dans le cadre de l'ANR SITCON ( http://bioinfo-out.curie.fr/projects/sitcon/ ).

    Immergé dans l'équipe Symbiose, ma tâche principale a consisté mettre au point une méthodologie pour étudier les variations inter-individuelles de patients malades en les confrontant à un réseau de régulation de gènes impliqué dans les tumeurs d'Ewing.

    Pour plus d'informations : https://www.irisa.fr/symbiose/sylvain_blachon

    Ce travail a fait l'objet de :
    - une publication dans les actes d'un workshop international avec comité de lecture : http://www.ics.forth.gr/bmi/BMIINT2009/
    - une publication soumise dans un journal de bioinformatique
    - une publication en préparation
    - trois communications orales dans des conférences nationales et internationales
    - un poster dans une conférence internationale.

  • Laboratoires CNRS - UCB Lyon1 - INSA de Lyon - Thèse de bioinformatique

    2003 - 2007 Thèse sur la fouille de données biologiques. Extraction de motifs dans les données transcriptomiques. Recherche de gènes marqueurs du cancer. Travail interdisciplinaire. Travail en équipe. Rédaction d'articles scientifiques (français et anglais). Présentations orales (français et anglais). Encadrement d'un ingénieur en informatique. Transfert de savoir (chargé de TD en informatique). Conception et développement d'un système d'informations dédié à la recherche en biologie moléculaire.

    Ce travail a fait l'objet de 3 publications dans des journaux internationaux de bioinformatique ainsi que 3 publications dans des conférences internationales en informatique avec comité de lecture.

  • Laboratoire CNRS - UCB Lyon 1 - Stage en bioinformatique

    2002 - 2002 Stage sur la fouille de données transcriptomiques (données SAGE humaines). Rédaction de rapport. Veille technologique (état de l'art). Travail en équipe. Conception et développement de chaines de traitement en java.

    Ce travail a fait l'objet d'une publication dans un journal international de bioinformatique.

  • Laboratoire INRA - INSA de Lyon - Stage Ingénieur en bioinformatique

    2001 - 2001 Conception et développement d'un logiciel de design de puces à ADN. Programmation en C. Analyse de séquences nucléotidiques. Mise en place d'un protocole de validation.

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