Emmanuel BOUILHOL

En résumé

Entreprises

• Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBiB) - Ingénieur en analyse de données biologiques

  2015 - 2018

• BioMérieux - Ingénieur Bioinformaticien

  MARCY-L'ETOILE 2014 - 2014 - Modélisation de données biologiques (modèle sémantique)
  - Récuperation, organisation et insertion des données dans une base de connaissance (Perl, SPARQL)
  - bio-curation, bibliographie

• BioMérieux - Stagiaire R & D

  MARCY-L'ETOILE 2014 - 2014 - Pipeline d'annotation de séquences (Perl, Bash)
  - Analyse statistique descriptive de sources de données (R)
  - Parsing et Alignement de méta-données (pattern matching)
  - Conception et utilisation de modèle de données (Ontologies)
  - Inclusion et requetages de données sémantiques (Web sémantique, SPARQL)
  - Outils : Protégé, Logiciels Corporate de gestion de documents et de projets, Logiciel de suivi de version, Blast, cd-hit, IDE Linux, Open-Link Virtuoso

• CHU Poitiers - Stagiaire Ingenierie Biomédicale

  Poitiers 2013 - 2013 -- Base de données et interface de bibliométrie et économétrie (SQL, PHP, HTML, JQuery, Ajax)
  -- Détection d’électrodes de neuro-stimulation médullaire sur images médicales (Java)

• Xlim-SIC & La Roche-Posay - Stagiaire

  2012 - 2012 -- Mise en place de protocoles d'acquisition de photographies dermatologiques
  -- Détection de plaques de Psoriasis sur photographie dermatologiques (MatLAB, Python)
  -- Détection de Mire et algorithme de calibration couleur (MatLAB, Python)

• Centre hospitalier régional universitaire de Lille - Stagiaire Ingénierie Biomédicale

  Lille 2011 - 2011 -Mise en place et administration d'une base de données d'images DICOM
  -Développement d'une interface d'administration de la base de données
  -Développement d'outils de tractographie, orientation et suivi des fibres neuronales

Formations

• CBIB

  Bordeaux 2018 - maintenant PhD student

• Université Poitiers GPHY

  Poitiers 2013 - 2014 Master 2 Génie Physiologique et Informatique option Imagerie
  
  -- Informatique : Programmation Androïd, J2EE, Administration Oracle, Data Mining
  -- Biologie : Formation aux NGS (Next generation sequencing)
  -- Imagerie : OpenCV, OpenGL, InPainting
  -- Divers : Marketing, Sécurité & réseaux, Création d'une entreprise
  
  -- Projet : Développement d'une application pour LeapMotion (JavaScript)

• Université Poitiers GPHY

  Poitiers 2012 - 2013 Master 1 Génie Physiologie et Informatique option Imagerie
  
  --Biologie : Omics, imagerie médicale (IRM, TEP, Echographies...), imagerie du petit animal (Microscopie confocale, biphotonique, GFP...)
  --Informatique : POO (Java, C++), IHM (Java)
  -- Imagerie : Quantification couleur, espace colorimétriques, Segmentation & Détection (Régions, contour...)
  -- Projet : Analyses de textures de peaux en vue de corréler une peau lésée et un type de Psoriasis

• Université Poitiers

  Poitiers 2011 - 2012 Licence
  
  Génie Physiologique, Biotechnologique et Informatique, Université de
  Poitiers (86), Option Biotechnologie et Imagerie.

• Université Clermont 1 Auvergne

  Clermont Ferrand 2009 - 2011 DUT Génie Biologique option Bioinformatique
  
  --Informatique : C, Perl, MySQL, PHP, Bash, Java, VB
  --Biologie : Génomique, protéomique, Biologie cellulaire, Physiologie animale & végétale
  -- Outils d'analyse : Gap4, PreGap4, Blast, ORFinder...

• Université Clermont 1 Auvergne

  Clermont Ferrand 2007 - 2009

Réseau

• Benjamin DUPONT

• Carole HERITIER

• Caroline NOREZ

• Clement VLH

• Ferdinand LOISEAU

• Geneviève GAGNE

• Marion DE LA MOTTE ROUGE

• Mylène JOSSERAND

• Patrick GIRARD

• Pierre-Yves AUDFRAY