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Florian CHAIN

Paris

En résumé

Bonjour,

j'ai travaillé initialement dans le domaine de la santé des plantes (jusqu'en 2008). Cependant, je me suis réorienté depuis et je travaille maintenant dans le cadre d'une autre thématique de recherche concernant les bactéries probiotiques.
Je bénéficie maintenant d'une bonne expérience dans divers environnements de travail et m'estime facilement adaptable. Je suis l'auteur de plus d'une douzaine de publications scientifiques en anglais et j'ai participé à la rédaction d'un brevet. Vous trouverez des informations plus détaillées sur mon parcours ci-dessous.

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Parcours
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Je situe le début de ma carrière professionnelle à la fin de mes études d'ingénieur agronome, effectuées à l'école nationale supérieure d'agronomie et des industries alimentaires de Nancy.

Mon premier travail de recherche d'importance a été réalisé au cours d'une thèse portant sur un virus de plantes et sa capacité à évoluer.
Ma carrière s'est ensuite poursuivie au Canada, où, pendant presque trois ans, j'ai contribué à des travaux portant sur deux thématiques de recherche.
- La première concernait l'étude de l'impact d'une alimentation en silicium sur la défense de deux plantes modèles (arabidopsis et blé) face à un champignon pathogène (oïdium).
- La seconde concernait la caractérisation d'un champignon susceptible d'être utilisé en lute biologique.

Depuis mars 2009, je suis employé en tant qu'ingénieur de recherche en CDD à l'INRA de Jouy-en-Josas au sein d'une équipe s'intéressant aux bactéries probiotiques. J'ai travaillé consécutivement sur deux projets (l'un terminé et l'autre en cours). Le premier s'est effectué dans le contexte d'un partenariat entre deux établissements de recherche publics et deux entreprises destiné à identifier de nouvelles bactéries probiotiques. Le second concerne l'amélioration des connaissances autour d'une bactérie commensale anti-inflammatoire.

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Compétences
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- biologie moléculaire, comprenant notamment l'utilisation de la PCR quantitative et de puces à ADN (affymetrix et agilent)
- expérimentation animale : j'ai suivi la formation de niveau I en 2010 et effectue régulièrement des essais in vivo utilisant des modèles murins
- culture cellulaire (utilisation de modèles orientés "inflammation"
- cytométrie en flux
- bioinformatique, avec de l'analyse de séquence et de données de puces avec R (packages Limma, Affy, principalement)
- immunologie basique (test ELISA)
- statistiques (utilisation de SAS, R, JMP ou graphPad)
- protéomique, avec initiation aux gels 2D

J'ai également encadré et/ou appuyé plusieurs étudiants.


J'ai été le responsable de la plate-forme PCR quantitative pendant mon post doc:
- "import" de la technologie au laboratoire
- formation des étudiants et du personnel

J'ai eu l'opportunité de donner quelques heures d'enseignement à des niveaux divers

J'ai participé à la rédaction de plusieurs articles scientifiques publiés (13) dans des revues à comité de lecture ainsi qu'à la rédaction d'un brevet

je sais utiliser les outils informatiques nécessaires à mon domaine (pack office, SAS (statistiques), divers outils bioinformatiques...)

Je parle anglais couramment

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Centres d'intérêt
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Comme le laisse entrevoir mon parcours, je me suis intéressé de manière générale aux interactions hôte-microorganisme. J'espère pouvoir continuer dans cette voie via la mise en oeuvre d'outils pertinents. Je n'hésite pas à acquérir les compétences nécessaires à l'avancement d'un projet.


Je suis actuellement en poste en CDD à l'INRA mais je reste en veille et examine toute offre permettant de continuer à effectuer un travail de recherche. Comme déjà mentionné, je suis tout à fait prêt à m'adapter à un nouvel univers de travail; que ce soit le domaine de recherche ou la structure d'accueil de nature publique ou privée.

Mes compétences :
Agronomie
Bio-informatique
Bioinformatique
Biologie
Biologie moléculaire
Culture
Culture cellulaire
Expérimentation
Expérimentation Animale
Génomique
Microarray
Microbiologie
PCR
Phytopathologie
Probiotiques
Real Time
Recherche
Virologie

Entreprises

  • INRA - Ingénieur de recherche

    Paris 2009 - maintenant J'ai principalement participé à deux projets de recherche au sein du laboratoire ProbiHote (interactions des bactéries commensales et probiotiques avec l'hôte).
    Le premier était centré sur l'identification de nouvelles bactéries probiotiques, possédant notamment des propriétés immunostimulantes. Pour ce faire, j'ai participé au développement et à la mise en pratique de modèles cellulaires et murins permettant de cribler une collection importante de bactéries afin de répérer celles posédant des fonctions intéressantes.
    Le second projet (en cours) vise à mieux caractériser les propriétés anti-inflammatoires d'une bactérie commensale, notamment grâce à l'utilisation d'une banque génomique de type fosmidique.
    Au cours de ces projets, j'ai eu l'opportunité d'encadrer et d'assister plusieurs étudiants, de partciper au développement de collaborations avec d'autres laboratoires et d'acquérir de nouvelles compétences pertinentes pour mes thématiques de recherche (cytométrie en flux, culture cellulaire, expérimentation animale, etc.).

    Responsable : P. Langella

  • Université Laval - Post-doc

    2005 - 2008 Au sein de ce laboratoire d'accueil pour mon post-doc, j'ai participé de près aux thématiques de recherche :

    - Impact du silicium sur la stimulation des défenses des plantes (blé)
    - Caractérisation d’un champignon utilisable comme agent de lutte biologique (concombre).

    A fin de mener à bien les recherches entamées, j'ai :
    - mis en oeuvre des techniques d'étude d’expression de gènes (puces à ADN et PCR quantitative) avec analyse bioinformatique ( R (packages limma, affy, affyplm,...) pour les puces et REST pour les données de PCR quantitative), d’analyse de séquences, de protéomique (gels 2D) et d'autres techniques de biologie moléculaire;

    - travaillé en serres et chambres de croissance ;

    - été responsable du poste PCR quantitative (import de la technologie au laboratoire, formation du personnel et des étudiants);

    - développé des collaborations avec d’autres chercheurs;

    - encadré et appuyé 6 étudiants (master et doctorat);

    - donné quelques heures d’enseignement ;

    - rédigé des articles scientifiques (6 articles rédigés et soumis dont 3 parus et 3 en attente de décision)

    Encadrement : Richard Bélanger

  • INRA - Doctorant

    Paris 2001 - 2005 INRA (Insitut National de Recherche Agronomique)

    Thèse portant sur l'évaluation de la durabilité de résistance d'un virus de plante (le virus de la jaunisse nanisante de l'orge) sur blé. L'objectif consistait à tenter de prévoir si de nouvelles variétés de blé résistantes à ce virus peuvent conserver cette propriété malgré le potentiel évolutif du virus.

    Compétences et techniques mises en oeuvre :

    Virologie, biologie moléculaire classique, séquençage, immunologie (tests ELISA), essais en champs et phytotron (chambres de croissance luminosité, hygrométrie et température contrôlées), manipulation d'insectes (pucerons), expérimentation sur l'évolution de virus

    Encadrement: Emmanuel Jacquot, Maxime Trottet
    Jury de thèse: Christophe Brugidou, Bruce McDonald, Jacques Le Gouis, Benoît Moury, Grégoire Thomas

  • Everbee - Chargé de veille technologique

    pessac 2000 - 2000 Surveiller les innovations et produits du marché de la sécurisation des réseaux informatiques par systèmes de cryptage/décryptage des données logiciels ou matériels

  • INPL - Etudiant DEA

    2000 - 2001 INPL : Institut national polytechnique de Lorainne

    Impact de l'introduction d'une bactérie stimulant la croissance sur les communautés bactériennes indigènes

    Compétences et techniques mises en oeuvre :

    Microbiologie, Microscopie à fluorescence, réalisation de bactéries transformées à la GFP (green fluorescent protein), établissement de profils cataboliques et génétiques

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