Genome Express
- Ingénieur BioInformatique
1999 - 2006
1999 - 2007 : ingénieur BioInformaticien, Région Grenobloise
Conception, Développement et maintenance de nouveaux services BioInformatiques
Exemple de contrat : 175 K€ sur 2 ans
• Applications : Pipelines d’analyse dédiés Assemblage, finishing, CQ, Reporting automatique, hybridation soustractive
• Gestion documentaire : procédures opératoires, documentation & Compte-rendus d’analyse
• Réalisation des commandes, livraison et présentation des résultats
• Communications scientifiques associées aux nouveaux produits (congrès & articles)
Gestion de projets de BioAnalyse au service des clients
• Expertise Diagnostic Séquençage
• Assemblage en régions répétées
• Annotation et valorisation de clones ADNc (projet > 2 ans homme)
• typage ARN 16S (IP, Biomérieux)
• Détection de mutations, génotypage
• Analyse MicroArray (Plateforme Applera 1700 / Panther)
Accompagnement des clients internes (Services R&D, Business Development et Production) et externes (CNRS, CIRAD, CEA, INRA, ENS, Instituts Pasteur, Sanofi-Pasteur, Universités Européennes..)
Compétences
Logiciels BioInformatiques : package Phred/Phrap/consed, RepeatMasker, Blast2, Package EMBOSS, SIM4, Spidey, Ssearch3, clustalX, Fasta, Sequencher, SeqAnalysis..
Programmation : Perl5 (pTk, BioPerl), LabView, PHP, mySQL, Java (débutant), HTML, C (débutant), XML
► Auditeur interne (Référentiel : Norme ISO9001 : 2000)-
Travail collaboratif ayant abouti à la certification d’une activité de Biologie moléculaire
Audité dans le cadre de l’audit de Surveillance réattribuant la Certification pour 2006
► Gestion de Projet :
Animation de réunion, spécification des besoins, formalisation des plans d’action, travail d’équipe
Rapports d’étude & présentation des résultats de BioAnalyse
Veille technologique (logiciels de veille Internet..)
► Formations utilisateurs-
« Notions de base UNIX »
« Assemblage Shotgun, théorie & pratique »
► Langues :
Anglais, Bon niveau (TOEFL 543 pts)
Notions d’Espagnol