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François VALLÉE

RADON

En résumé

Depuis ma sortie du master de bioinformatique de Bordeaux, je travaille sur des projets de recherche variés pour créer des outils informatiques et des méthodes nouvelles. Un aspect important de ce métier est d'être à la charnière entre deux domaines très différents (biologie et informatique) et de pouvoir communiquer efficacement afin de comprendre leurs attentes et répondre à leurs besoins.

Mon dernier poste m'a permis de mettre mes compétences au service d'un expert en biologie (botanique/évolution), et ensemble, nous avons construit une méthode pour répondre à sa problématique.

Aujourd'hui je suis en Nouvelle-Zélande pour une année sur une thématique en biologie que je n'ai pas encore approfondie (la génétique des populations humaines) pour y développer un modèle basé sur des agents.

Mes compétences :
Informatique
Développeur
Bioinformatique
Biologie

Entreprises

  • Massey University - Assitant de recherche

    2014 - maintenant Modélisation à l'aide de systèmes multi-agents
    Développement logiciel

  • Végépolys Innovation - Ingénieur bioinformaticien

    2014 - 2014 Création d'un modèle pour l'aide à la sélection variétale.
    Rédaction d'un cahier des charges.
    Prototypage de logiciel.

  • INRA Angers-Nantes - Ingénieur d'études

    Paris 2012 - 2014 Conception d'un système d'information pour la gestion de données liées à la qualité de la pomme.
    - Base de données,
    - Interface Homme-Machine,
    - Systèmes d'Information

  • Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique - Assistant ingénieur

    2008 - 2011 CDD assistant ingénieur au LaBRI (Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique) :
    - Modélisation de réactions enzymatiques à l'aide de systèmes multi-agents intégrant des modèles gros grains : application à la chaîne respiratoire (LaBRI). Développement de toute l'application en Lisp avec une interface graphique en OpenGL.
    - Étude des réseaux métaboliques par la méthodes des modes élémentaires (LaBRI – INRA). Utilisation de programmes basés sur Metatool.
    - Gestion des bases de données TomaCyc et MitoCyc dans le cadre d'un projet ANR (LaBRI – INRA – Laboratoire de physiopathologie mitochondriale). Accessibles sur tomacyc.labri.fr. Bases de données au format PGDB (Pathway Genome DataBase).

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