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Mathilde DAURES

MONTROUGE

En résumé

Je suis à la recherche de nouvelles opportunités professionnelles dans le domaine de la bio-informatique appliquée à la génétique humaine.

Au cours de ma thèse j'ai développé un pipeline d'analyse de données de séquençage d'exomes, permettant l’agrégation de données issues d'une trentaine de bases de données publique et facilitant l’identification des variants pathologique par un système de score.
J'ai utilisé ce pipeline pour analyser les données de séquençage d'exome de plus de 200 patients diabétiques. J'ai identifié de nombreux gènes de diabètes connus chez ces patients et j'ai également identifié deux nouveaux gènes de diabètes.


Spécialisations :
Biologie : Génétique Humaine, Biologie Moléculaire, Culture Cellulaire, Microscopie
Informatique : Python, Perl, PHP, MySQL, HTML, CSS, C, Java
Analyses statistiques : R
Bioinformatique : Maîtrise des bases de données publiques (NCBI), Outils d'alignement (BLAST, Artemis...), Outils de visualisation moléculaire (RasMol, PyMol, VMD)
Anglais courant (TOEIC 805)

Mes compétences :
MySQL
Langage R
PHP
HTML
Génétique
CSS
Perl
Python
Statistiques
Biologie
Biotechnologies
Bioinformatique
Santé
Recherche et Développement
Gestion de projet
Veille scientifique
Bio-informatique

Entreprises

  • Inserm U958 - Doctorant en Génétique Humaine et Bioinformatique

    2012 - 2016 Identification de gènes à contribution monogénique dans le diabete

    Etude de population sélectionnées
    Analyse de liaison ou d'association
    Analyse NGS
    Etudes de voies métabolique
    Etudes dans les diabetes fréquents (type 1 et type2)

    Automatisation du processus via une intégration systématique des données dans un pipeline d'analyse bioinformatique
  • Inserm U958 - Assistante Ingénieur de Recherche en Bioinformatique

    2012 - 2012 Mise en place d'un pipeline d'analyse de données de séquençage haut débit
    Identification des gènes responsables de diabètes atypiques monogéniques
    Génétique Humaine
    Python
  • AgileBio - Assistant Ingénieur en Bioinformatique Modifier AgileBio

    Riedisheim 2011 - 2011 Amélioration, édition et création d' outils bioinformatiques en ligne
    PHP/Perl
  • ISoft - Stagiaire bio informatique

    Gif-sur-Yvette 2010 - 2011 Analyses préliminaires des outils et données pour une analyse intégrative de données de séquençage haut-débit. Création de modules de data-morphing et de pipeline d'annotation. Organisation et gestion de réunions avec les partenaires académiques afin de définir leurs attentes et leurs besoins
    Projet ANR
  • Inserm U955 - Assistante de maitrise d'ouvrage en bio informatique

    2010 - 2010 Etude de faisabilité et rédaction d'un cahier des charges pour une solution Open-Source remplaçant le logiciel ALAMUT (logiciel d'analyse des séquences ADN, ARN et protéiques)
  • Inserm U1001 Tamara's Lab - Technicienne de Laboratoire

    2010 - 2010 Génétique moléculaire, évolutive et médicale
    Développement d'un outil
    Marquage fluorescent des cellules ayant un stress SOS
  • Sis'NCom - Assistante Communication

    2009 - 2010 Organisation d’un événement de lancement pour le produit Sis4Web (solution logicielle innovante de gestion et d'analyse d'images scientifiques)

Formations

Réseau

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