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Pauline NOGARET

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En résumé

Mes compétences :
Microbiologie
Immunologie

Entreprises

  • DIMNP - Technicienne (Stagiaire)

    2016 - 2016 Stage de M1 : Etude de l’expression du facteur de virulence MgtC et de l’effet de son inhibiteur naturel MgtR chez P. aeruginosa.
    Stagiaire dans l'équipe Régulation Post-Traductionnelle des Protéines et Pathogénie de Mme V.Molle.
    Tutrice: A.B Blanc-Potard

    J'ai pu étudier l'expression du gène codant le facteur de virulence MgtC et l'effet biologique de MgtR (peptide inhibiteur de MgtC) chez P.aeruginosa et S.Typhimurium. Pour cela j'ai réalisé: des clonages bactériens, des infections de macrophages murins et d'amibes sociales D.discoideum ainsi que de nombreuses observations par microscopie à épifluorescence et par spectrofluorimétrie.
    J'ai également pu participer à une analyse en Live-Microscopie avec Laurence Berry.
    Dans un autre contexte, je me suis également intéressé aux OMV (Other Vesicule Membrane) et différents protocoles ont été testés afin de les visualiser en microscopie.


  • Laboratoie AQMC - Technicienne (Stagiaire)

    2015 - 2015 Technicienne (stagiaire) dans un laboratoire de contrôle qualité microbiologique.
    Découverte du laboratoire de contrôle qualité microbiologique (AQMC).
    Tuteur: Ghislain Lucibello (co-directeur technique)

    Ce stage obtenu suite à candidature spontané m'a permis de découvrir le fonctionnement d'un laboratoire de contrôle qualité microbiologique. J'ai pu suivre toute la démarche à suivre afin de réaliser l'analyse microbiologique de différente matrices en participant au prélèvement des échantillons (d'eau et en restauration), à leur réception (prise de température, étiquetage,...), à la pesé et enfin à l'analyse microbiologique. Je me suis également occupé de la laverie et de la stérilisation du matériel par l'autoclave.
    Ce stage a été plus un stage d'observation car je n'ai pu réaliser les examens microbiologiques que sur les produits non accrédités. J'ai donc pesé des échantillons de fromages (pour l'analyse par PCR du gènes STX 1,2 et eae d'E.coli) et de coquillages, réalisé des colorations de Gram, des tests biochimiques (oxydase, catalase), identifié au microscope certain type de moisissures. J'ai également participé au repiquage et à l'isolement de différentes souches (Salmonelle) et réaliser des milieux de cultures.
    J'ai été présente à deux audits qui ont eu pour but de contrôler la qualité du laboratoire et donner la certification COFRAC pour l'analyse des eaux par filtrations.
  • Laboratoire Arago/ Observatoire de Banuyls sur Mer (66) - Technicienne (stagiaire) en bactériologie marine

    2014 - 2014 Stage d'IUT: Participation à la description de nouvelles souches bactériennes de la collection MOLA.
    Tuteur: Laurent Intertaglia (Responsable Technique de la collection de bactéries)
    Unité Mixte de Service et de Recherche : Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologie Marine (LBBM)

    En utilisant des méthodes de biologie moléculaire (extraction d'ADN, PCR, séquençage) et une approche poly-phasique (isolement, suivi de croissance, tests biochimiques, cryoconservation), j’ai pu identifier et étudier plusieurs souches bactériennes provenant de la collection MOLA du laboratoire. Les résultats des analyses pour chaque souche ont pu être comparés avec ceux des souches les plus proches génétiquement (possédant le plus fort pourcentage sur Ezbiocloud et sur BLAST) afin de déterminer leurs similitudes et leurs différences.
    Durant mon stage, par analyse phylogénétique, trois nouveaux genres ont été mis en évidence.
    Le résultat de mon travail pourra être utilisé dans des articles scientifiques afin de décrire de nouveaux genres.

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