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Sébastien FRAUD

SAINT PIERRE EN FAUCIGNY

En résumé

Doctorat en microbiologie moléculaire et pharmaceutique expérimenté dans le cadre de l'identification et l'étude des gènes et molécules impliqués dans la résistance des bactéries pathogènes aux agents antibactériens (antibiotiques, désinfectants), et l’étude des bactéries lactiques et des écosystèmes microbiens laitiers. Forte expérience de management de projets de recherche et de personnels.

Microbiologie:
- Culture et identification génétique des micro-organismes d’intérêt laitier
- Caractérisation technologique de ferments lactiques : courbes de fermentation CINAC, Bioscreen C Analyzer, activités métaboliques, production de biomasse (fermenteurs 2L), sensibilité aux bactériophages, antibiogramme
- Travaux avec des biofilms
- Contrôle des mesures de sécurité d’un laboratoire de microbiologie P2+ et des risques biologiques liés à la manipulation de bactéries pathogènes (STEC, L. monocytogenes, Salmonella)

Biologie moléculaire:
- Extraction/purification ADN et ARN
- Conception d’amorces pour des gènes cibles, PCR, qPCR et qRT-PCR
- Clonage de gènes, knock-out de gènes (vecteurs de replacement de gènes, phages, transposon), transformation, mutagénèse aléatoire et dirigée
- Expression et purification de protéines recombinantes (His- et GST-tag)
- SDS-PAGE, EMSA, 5’ RACE
- Western blots, Southern et Northern hybridation in-situ et nitrocellulose, ELISA

Génomique, transcriptomique, protéomique (travaux collaboratifs) :
- Séquençage Illumina de génomes entiers
- Analyse génomique comparative
- Méta-barcoding, méta-génomique et méta-transcriptomique d’écosystèmes microbiens complexes
- Dosage des arômes par GC-MS
- Séquençage peptidique par MALDI TOF-MS
- Protéomique des protéines de surface bactérienne – Trypsin cell surface ‘shaving’ LC-MS/MS

Compétences:
- Anglais bilingue
- Forte expérience en montage et gestion de projets scientifiques (incluant les budgets et délais)
- Excellente aptitude à communiquer et transférer des résultats scientifiques
- Encadrement de techniciens et étudiants au laboratoire
- Adaptable, travaille très efficacement en équipe et en collaboration nationale et internationale avec des laboratoires partenaires industriels et académiques

Mes compétences :
Adaptable
Biologie
Biotechnologie
Clonage
Culture
Culture cellulaire
Encadrement
Expression de protéines
Fromages
HPLC
Lait
Management
Microbiologie
Microsoft Expression
Perseverance
Protéines
Purification
QPCR
Sequençage

Entreprises

  • Actalia - Responsable Projet Microbiologie d'Intérêt Laitier

    2012 - maintenant Élaborer et coordonner des projets de recherche collaborative d’intérêt général (CNIEL, ANR…) et des prestations d’expertise privés pour la filière laitière. Développer des méthodes pour comprendre, analyser et maitriser les ferments lactiques et la biodiversité des écosystèmes des produits laitiers. Caractérisation technologiques de bactéries lactiques pour le développement ou l’amélioration de produits laitiers. Encadrement de techniciens.
  • Queen's University - Kingston - Canada - Responsable de projets en Microbiologie Moléculaire

    2007 - 2010 Étudier le rôle du stress oxidatif dans l'induction de pompes à efflux et promotion de gènes responsables de la résistance aux aminoglycosides chez Pseudomonas aeruginosa. Recherches appliquées dans le cadre d'infection chez des patients souffrant de la mucoviscidose. Rédaction, implémentation et management de projets de recherche. Management de multiples collaborations externes. Encadrement de personnels.
  • Merck Chemicals Ltd. - Nottingham - Angleterre - Technical Account Manager

    2006 - 2007 Responsable client sur le territoire anglais sud-ouest, support technique, expertise en biologie moléculaire, négociation de contrats universitaires et industriels.
  • Queen's University - Kingston - Canada - Postdoctorat en Microbiologie Moléculaire

    2004 - 2006 Etudier les gènes responsables de la résistance à la chlorhexidine et aux aminoglycosides chez Pseudomonas aeruginosa. Caractériser les mécanismes génétiques modulant l’expression des pompes à efflux et des systèmes de régulation. Encadrement d’étudiants.
  • School of Pharmacy & Biomolecular Sciences - Brighton - Angleterre - Postdoctorat en Microbiologie Pharmaceutique

    2002 - 2003 Etudier l’activité d’un amine oxyde contre des biofilms de Streptococcus mutans utilisant un modèle reproduisant l’environnement buccal humain. Projet financé par Procter & Gamble, Cincinnati, USA. Encadrement d’étudiants.
  • Welsh School of Pharmacy - Cardiff - Pays de Galles - Etudiant en doctorat

    1999 - 2002 Etudier les mécanismes d’action mycobactéricide de l’ortho-phthalaldehyde. Projet financé par ASP Biocides, Johnson & Johnson, Irvine, USA.
  • INSERM 329 - Laboratoire d'Immunochimie - Lyon - Assistant de recherche en biochimie clinique

    1997 - 1999 Développer une membrane de dialyse pour l’épuration sanguine d’endotoxines dans le cas clinique de choc septique. Projet financé par Hospal R&D Int (Gambro). Développer un essai immuno-enzymatique pour la détection d’un iso-peptide spécifique des corps apoptotiques.
  • BioMérieux - Marcy l'Etoile - Technicien en contrôle qualité immuno-sérologie

    MARCY-L'ETOILE 1996 - 1998 Contrôle des réactifs biologiques VIDAS (spécificité, stabilité, sensibilité) et constitution d’une sérothèque pour le contrôle des réactifs VIDAS HBs Ag.

Formations

  • Cardiff University (Cardiff)

    Cardiff 1999 - 2002 Ph.D. en Microbiologie Moléculaire et Pharmaceutique
  • Welsh School Of Pharmacy CPT (Cardiff)

    Cardiff 1999 - 2002 Ph.D. en Microbiologie Moléculaire et Pharmaceutique

    Cardiff - Pays de Galles - Royaume-Uni
  • Université Lyon 1 Claude Bernard

    Villeurbanne 1998 - 1999 Maîtrise de Microbiologie option Génétique Microbienne et Physiologie

    Villeurbanne - France
  • Coventry University (Coventry)

    Coventry 1997 - 1998 B.Sc. Hons degree option Biologie Appliquée

    Coventry - Angleterre - Royaume-Uni
  • IUT Lyon 1 - Université Claude Bernard (Villeurbanne)

    Villeurbanne 1995 - 1997 Option Analyses Biologiques et Biochimiques

    Villeurbanne - France

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