Doctorat en microbiologie moléculaire et pharmaceutique expérimenté dans le cadre de l'identification et l'étude des gènes et molécules impliqués dans la résistance des bactéries pathogènes aux agents antibactériens (antibiotiques, désinfectants), et l’étude des bactéries lactiques et des écosystèmes microbiens laitiers. Forte expérience de management de projets de recherche et de personnels.
Microbiologie:
- Culture et identification génétique des micro-organismes d’intérêt laitier
- Caractérisation technologique de ferments lactiques : courbes de fermentation CINAC, Bioscreen C Analyzer, activités métaboliques, production de biomasse (fermenteurs 2L), sensibilité aux bactériophages, antibiogramme
- Travaux avec des biofilms
- Contrôle des mesures de sécurité d’un laboratoire de microbiologie P2+ et des risques biologiques liés à la manipulation de bactéries pathogènes (STEC, L. monocytogenes, Salmonella)
Biologie moléculaire:
- Extraction/purification ADN et ARN
- Conception d’amorces pour des gènes cibles, PCR, qPCR et qRT-PCR
- Clonage de gènes, knock-out de gènes (vecteurs de replacement de gènes, phages, transposon), transformation, mutagénèse aléatoire et dirigée
- Expression et purification de protéines recombinantes (His- et GST-tag)
- SDS-PAGE, EMSA, 5’ RACE
- Western blots, Southern et Northern hybridation in-situ et nitrocellulose, ELISA
Génomique, transcriptomique, protéomique (travaux collaboratifs) :
- Séquençage Illumina de génomes entiers
- Analyse génomique comparative
- Méta-barcoding, méta-génomique et méta-transcriptomique d’écosystèmes microbiens complexes
- Dosage des arômes par GC-MS
- Séquençage peptidique par MALDI TOF-MS
- Protéomique des protéines de surface bactérienne – Trypsin cell surface ‘shaving’ LC-MS/MS
Compétences:
- Anglais bilingue
- Forte expérience en montage et gestion de projets scientifiques (incluant les budgets et délais)
- Excellente aptitude à communiquer et transférer des résultats scientifiques
- Encadrement de techniciens et étudiants au laboratoire
- Adaptable, travaille très efficacement en équipe et en collaboration nationale et internationale avec des laboratoires partenaires industriels et académiques
Mes compétences :
Adaptable
Biologie
Biotechnologie
Clonage
Culture
Culture cellulaire
Encadrement
Expression de protéines
Fromages
HPLC
Lait
Management
Microbiologie
Microsoft Expression
Perseverance
Protéines
Purification
QPCR
Sequençage