ESPCI
- PhD Student
2007 - 2011
Sujet de recherche: Recherche des partenaires de l'amyloïde-bêta par spectrométrie de masse.
Laboratoire: Laboratoire de spectrométrie de masse biologique et protéomique USR 3149 ESPCI.
Responsable: Dr. Joëlle Vinh
Compétences techniques:
Protéomique: Spectromètres de masse MALDI-TOF/TOF 4800 (Applied Biosystem), MALDI-Orbitrap (Thermo), LTQ-FTICR (Thermo), LTQ-Orbitrap (Thermo), Q-Exactive (Thermo)
Développement de la LC-MALDI-TOF/TOF et la LC-MALDI-Orbitrap.
Chromatographie: Chromatographie en phase liquide (HPLC) système Ultimate 3000 (Dionex)
Bioinformatique: Utilisation des logiciels 4800 explorer, Protein Pilot (Applied Biosystem). Xcalibur, Proteome Discoverer (Thermo)
Mascot, MyProms.
Encadrements d'étudiants: Travaux pratiques de biologie moléculaire pour les étudiants de première année à l'ESPCI.
Publications
1. Hesse AM, Ndiaye S, Vinh J. Reversed-phase HPLC and hyphenated analytical strategies for peptidomics. Methods Mol Biol. 2011;789:203-21. PubMed PMID: 21922410.
2. Chiappetta G, Ndiaye S, Demey E, Haddad I, Marino G, Amoresano A, Vinh J.Dansyl-peptides matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometric (MALDI-MS) and tandem mass spectrometric (MS/MS) features improve the liquid chromatography/MALDI-MS/MS analysis of the proteome. Rapid Commun Mass Spectrom. 2010 Oct 30;24(20):3021-32. PubMed PMID: 20872635.
3. Chiappetta G, Ndiaye S, Igbaria A, Kumar C, Vinh J, Toledano MB. Proteome screens for Cys residues oxidation: the redoxome. Methods Enzymol. 2010;473:199-216. Review. PubMed PMID: 20513479.
4. Ndiaye S. Verdier Y., Demey E., Haddad I., Vinh J, Proteomic analysis of beta partners of amyloïd beta. En cours de rédaction
Conférences orales
1. Ndiaye S., Hesse A.M., Haddad I., Rossier J., Vinh J., Study of complex samples using multiple analytical dimensions: optimization of nanoLC-MALDI orbitrap and evaluation of complementary configurations, 25ème congrès de la Société Française d’Electrophorèse et d’Analyse Protéomique, Tours, France, 2008.
2. Ndiaye S., Hesse A.M., Rossier J., Vinh J., Improved knowledge of complex samples by multiplying dimensions of analyses: complementarity of 2D-LC-MALDI and 2D-LC-ESI, 25èmes Journées Françaises de Spectrométrie de Masse, Grenoble, France, 2008.
