Menu

Baptiste BRAULT

Hérouville-Saint-Clair

En résumé

Mes compétences :
Hibernate
Scrum
JUnit
XML
Spring
Python
Java EE
JavaScript
PostgreSQL
Java Platform
PHP 5
JSON
Maven
R
Git

Entreprises

  • 6cure - Ingénieur d'application

    Hérouville-Saint-Clair 2018 - maintenant

  • Centre François Baclesse - Ingénieur informatique

    CAEN 2012 - 2018 J'ai la charge de la conception au développement d'un outil pour une utilisation en batch pour l'analyse d'un grand jeu de donnée avec comme objectif final la mise en avant des résultats pour un rendu dans un contexte diagnostic.
    L'outil permet l’exécution des analyses de façon séparées ou par workflow dans ce mode, la configuration est facilement configurable avec un suivi précis de l'état d'avancement. Afin de faciliter l'utilisation et déporter les analyses de l'outil une interface est développé epour une utilisation multi site.
    Conception et déploiement d'une base de données permettant de mettre en avant les données ayant un intérêt dans la recherche sur le cancer.
    Administration des serveurs, des bases de données, formation des utilisateurs et des développeurs sur l'outil.

  • INRA Versailles - Ingénieur d'étude

    Paris 2011 - 2012 Participation au sein d'une équipe (méthologie Agile) au développement du système d'information pour la valorisation des données hétérogène. Correction des bugs, ajout de nouvelles fonctionnalités, insertion des données via un logiciel de type ETL.
    Participation avec une équipe de recherche sur le développement d'un pipeline d'analyse innovant pour la recherche d'évenement sur le génome de l'espère choisie

  • StarLims France - Ingénieur d'Application

    2010 - 2011 Rattaché au service client, avec comme missions principales le support et la maintenant des installations, du paramétrages sur des projets de courte durée, TMA.
    Prise en charges des appels reçus par mail, téléphone puis analyse des problèmes pour une réponse en termes technique et fonctionnels.

  • INRA de Versailles - Ingénieur d'étude

    Paris 2008 - 2010 Faire évoluer des applications « open source » du projet GMOD (Chado, Apollo, Gbrowse, http://gmod.org ) utilisées au sein de l’unité.
    Correction de bugs et ajout de nouvelle fonctionnalités sur un logiciel de curation manuelle de gène, Apollo développé en JAVA. Mise en place d'une instance Java WebStart.
    Installation, configuration d'un logiciel de visualisation génomique GBrowse.
    Installation, configuration et test d'un nouveau logiciel de visualisation génomique (visualisation type google map), JBrowse.
    Installation, test d'un wiki pour l'édition fonctionnelle de gène. Installation et configuration de MediaWiki avec différents extensions pour la gestion de données de type ontologique.
    Développement d'une interface pour l'édition fonctionnelle, en JAVA avec le framework Spring et Hibernate.
    L'ensemble des logiciels sont connectés à une base de donnée de type PostGreSQL.

  • Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire - Stagiaire

    2008 - 2008 EMBL (Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire) à Heidelberg (Allemagne)
    Participation au projet 4DXpress.Plateforme permettant de comparer l’expression des gènes durant le développement chez quatres espèces (zebrafish, drosophile, medaka, souris). Développement d'une interface du programme blast avec la possibilité de choisir les paramètres dans l'interface web du projet et l'affichage textuel des résultats. Développement un anatogramme, c'est à dire une représentation compacte sous forme d'image de termes d'annotations pour un groupe de gène. Durant ce stage, j'étais libre d'un point de vue organisation pour la réalisation des développements

  • Université du Pays de Galles - Stagiaire

    2007 - 2007 Laboratoire de biologie computationnelle à Aberystwyth
    • Interfaçage de la base de données Stock Region du Robot Scientist en JSP
    • Ecriture d’un premier rapport sur le LIMS, disponibilité et exigences pour le laboratoire Robot Scientist

  • Centre CIRDES (Centre International de Recherche Développement sur l’Elevage en zone subhumide) - Stagiaire

    2006 - 2006 • Choix d’un séquenceur pour un pays d’Afrique de l’Ouest.
    • Recherche de marqueurs microsatellites chez deux vecteurs et chez le parasite responsable de trypanosomose animale
    o Détermination des amorces pour le séquençage du vecteur responsable de la trypanosomose animale.

Formations

Réseau

Annuaire des membres :