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Johan LEYRITZ

ILLKIRCH-GRAFFENSTADEN

En résumé

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Entreprises

  • Institut de Génétique et Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Illkirch - Ingénieur en développement et déploiement d'applications

    2012 - maintenant http://www.phenomin.fr/
    http://www.igbmc.fr/
    http://phdprogramme.igbmc.fr/
    http://labex-inrt.igbmc.fr/
    http://www.phenopro.fr/
    http://frisbi.eu/
  • Institut Clinique de la Souris (ICS), Illkirch - Ingénieur en développement et déploiement d'applications

    2010 - 2012 http://www.ics-mci.fr/
    http://www.celphedia.eu/
    http://www.rocad.org/
  • Transgénèse et Archivage d'Animaux Modèles (TAAM - UPS 44 CNRS Orléans) - Ingénieur en Systèmes d'Information

    2007 - 2010 Développement du Système d’Information de l'Institut
    dans le cadre du projet européen EMMA :
    - Migration des bases de données de Oracle 8 vers des SGBD open-source: MySQL et PostgreSQL.
    - Gestion et administration des bases de données de lignées de souris génétiquement modifiées dans le cadre du projet EMMA (European Mutant Mouse Archive). Plus d'infos sur PubMed : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19783817
    - Mise en place d'un ERP au niveau de l'Institut de Transgénose.
    - Gestion du wiki de l'Institut
    - Création d'interfaces utilisateur et de tableaux de bord.
    - Webmastering :
    - http://transgenose.cnrs-orleans.fr/intragene/
    - http://transgenose.cnrs-orleans.fr/taam/
    Intégration du processus Système d'Information dans un Système de Management Qualité ISO9001:2000
  • Centre de Génétique Moléculaire et Cellulaire (CGMC - CNRS Villeurbanne) - Ingénieur bioinformaticien

    2006 - 2006 Réalisation d’une base inductive de données SAGE (humaines et aviaires) et de son interface Web dans le cadre du projet BINGO (Base de données INductive de GénOmes) de l’ACI Masse de données
    Présentation orale en langue anglaise dans le réseau collaboratif BINGO : Toward inductive databases that biologists can use.
  • Laboratoire d’InfoRmatique en Images et Systèmes d’information (LIRIS - INSA Lyon) - Ingénieur bioinformaticien

    2006 - 2007 Réalisation d’une base de données SAGE inductive et de son interface Web dans le cadre du projet BINGO (Base de données INductive de GénOmes) de l’ACI Masse de données, extension aux données SAGE murines.
    Analyse de données transcriptomiques.
    Réalisation et ajout de modules de post-processing et clustering hiérarchique de concepts formels.
    Mise en service de la base (SQUAT) sur le Web : http://bsmc.insa-lyon.fr/squat
    Rédaction d'une publication : SQUAT: a web tool to mine human, murine and avian SAGE data, Leyritz et al. (BMC Bioinformatics 2008, 9:378). Librement consultable sur http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18801154
  • Centre de Recherches en Biochimie Macromoléculaire (CRBM - CNRS Montpellier) - Stage de DESS

    2005 - 2005 Mise en évidence de nouvelles sous-familles de Leucine-Rich Repeat proteins
    Réalisation d’une base de données de séquences protéiques et d’outils bio-informatiques d’analyse et d’alignement de ces séquences
    Mise en service de ces outils sur le site web du département Bioinformatique Structurale et Modélisation Moléculaire du CRBM.
  • Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE - CNRS Montpellier) - Stage de Maîtrise

    2004 - 2004 Etude des paramètres de dispersion dans une métapopulation d’Impatiens balfourii
    Rédaction d’un article : Characteristics and environmental correlates of seed dispersal in Impatiens balfourii (Balsaminaceae) (non publié).

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