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Karolinska Institet - Center of infectious medicine
- Postdoctoral researcher
2014 - 2017
http://www.mcornilletscientificportal.com
Immunologie (périphérique et intra-hepatique) / Génétique
Spécificité : Phenotypes et fonctions des Cellules NK
Contextes : Cancers (primaires et secondaires) hépatiques et Biliaires
Our group performs translational immunological research studying tissue-resident natural killer cells in the human liver and uterus.
http://ki.se/en/medh/niklas-bjorkstrom-group
A key focus of the group is to gain insights into the basic biology of tissue resident NK cells in liver and uterus. Through unique collaborations with clinical units at the Karolinska University Hospital, we receive a high number of tissue samples. With respect to the uterus, key questions of interest include detailed characterization of the uterine NK cell KIR receptor repertoires, functional studies of uterine tissue resident NK cells, as well as trying to elucidate the ontogeny of uterine NK cells. In the liver we have a specific focus on human tissue-resident CD49a+ intrahepatic NK cells and study their phenotype, function, development, and role during liver diseases.
Moreover, we have an interest in the role of natural killer (NK) cells in the pathogenesis of liver diseases such as primary sclerosing cholangitis, steatohepatitis (NASH), and hepatitis virus infections (HBV, HCV, HDV). These diseases strongly predispose for tumor development in the human liver and we are also performing tumorimmunological studies evaluating the capacity of NK cells to recognize hepatocellular carcinoma and cholagiocarcinoma. Outside the liver, we also have an interest in NK-cell function during hemorrhagic fever virus infections.
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CNRS/INSERM Unité de Différenciation Epidermique et Autoimmunité Rhumatoide UDEAR
- Assistant Hospitalo-Universitaire
2013 - 2014
Recherche bioclinique/Physiopathologie de la Polyarthrite Rhumatoïde
*** SUJET DE THESE***
Analyse comparative de la spécificité des ACPA dirigés contre les épitopes immuno-dominants de la fibrine et évaluation de leur valeur pronostique
*DETAILS* :
Notre laboratoire étudie les auto-anticorps anti-protéines citrullinées (ACPA), spécifiques de la polyarthrite rhumatoïde (PR) qui, sur leurs antigènes-cibles, reconnaissent des épitopes générés par "citrullination" (désimination de résidus arginyl) sous l'action de peptidyl-arginine désiminase(s). Nous avons montré que les ACPA reconnaissent des formes citrullinées des chaînes alpha et beta de fibrine présentes dans le tissu synovial des patients. Nous avons poursuivi la caractérisation des épitopes reconnus par les ACPA en évaluant la réactivité de peptides « citrullinés » correspondant aux chaînes alpha et beta de la fibrine. Nous avons ainsi identifié 18 peptides réactifs parmi lesquels deux peptides, alpha36-50 et beta60-74, sont porteurs d’épitopes majeurs reconnus par une grande proportion de patients. Sur ces deux peptides, nous avons ensuite identifié les épitopes « alpha », « alpha’ » et « beta », reconnus par les ACPA. Nous avons ainsi montré qu’il existe une très grande homogénéité de réactivité des sérums rhumatoïdes vis-à-vis de ces épitopes et que la réponse auto-immune B contre la fibrine citrullinée est oligoclonale.
Spécificité fine des ACPA.
D’autres protéines citrullinées sont réactives in vitro avec les ACPA et certaines sont proposées comme de possibles cibles tissulaires chez les patients. Outre la filaggrine et la vimentine, des peptides issus l’un d’une protéine du virus d’Epstein Barr et l’autre de l’alpha-énolase humaine, sont aussi spécifiquement reconnus, sous forme citrullinée, par une proportion importante de sérums de PR. Nous pensons que les trois sous-populations d’ACPA dirigés contre les trois épitopes, « alpha », « alpha’ » et « beta », identifiés sur la fibrine citrullinée constituent la quasi-totalité des ACPA et reconnaissent de façon croisée les autres protéines citrullinées.
Pour le démontrer, le ou la doctorant(e) analysera la réactivité de sérums rhumatoïdes vis-à-vis de ces épitopes comparativement à la réactivité vis-à-vis des autres antigènes peptidiques citrullinés en utilisant une cohorte de plus 600 patients atteints de diverses maladies rhumatologiques dont plus de 200 PR. Par ailleurs, sur des séries de sérums choisis, il/elle analysera la réactivité croisée entre les différents types d’ACPA par des expériences d’immuno-absorption.
Valeur pronostique.
L’identification des trois épitopes « alpha », « alpha’ » et « beta » permet pour la première fois de classer les patients ACPA-positifs en trois groupes, en fonction de leur profil de réactivité. Grâce à deux cohortes de plus de 800 patients suivis depuis les stades précoces de la maladie pendant plusieurs années, la valeur pronostique des ACPA sera analysée comparativement dans chaque groupe de patients. Le ou la doctorant(e) recherchera dans les 2 cohortes, l’existence de corrélations entre chaque profil d’ACPA (anti-alpha, anti-beta, anti–alpha’) et les paramètres cliniques, biologiques et radiologiques de sévérité et d’activité de la maladie.
*Techniques utilisées relatives au sujet* :
Développement de tests ELISA originaux utilisant des protéines ou des peptides monoépitopiques, biotinylés ou non-biotinylés, Immuno-absorption compétitives- Analyses biocliniques : évaluation de valeurs diagnostiques et pronostiques.
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UDEAR (INSERM / CNRS / Universite Toulouse III)
- These en immune-rhumatologies
2010 - 2013
Cette unité est sous la tutelle du CNRS, de l'INSERM et de l'université Toulouse III Paul Sabatier.
Le CHU de Toulouse est classé premier au palmarès 2011 du Magazine « Le Point »
(9 fois premier, 6 fois second en 15 ans - 1400 établissements évalués - 63 activités dans les disciplines médicales et chirurgicales)
en Rhumatologie rang 2010 : 2e, rang 2011: 3e
http://www.chu-toulouse.fr/-palmares-2010-du-point-
Rapport d'évaluation de mon équipe d'accueil par l'Agence d'Evaluation de la Recherche et de l'Enseignement Supérieur en Mai 2010
Note de l'équipe : A+
Qualité scientifique et production : A+
Rayonnement et attractivité, intégration dans l'environnement : A+
Stratégie, gouvernance et vie du laboratoire : A+
Appréciation du projet : A+
"Strengths and opportunities : Well thought, ambitious, alreday leader in this field. What is outstanding is the linear evolution of the project: discovery of anti citrullin immunization, demonstration that fibrin is the major joint citrullinated antigen, mapping of
two dominant epitopes on citrullinated fibrin, tolerization to these two epitopes to cure RA."
L'école doctorale de l'université Paul Sabatier "Biologie Santé Biotechnologie" fait partie des 17 écoles doctorales françaises (sur 295 écoles évaluées) ayant obtenue un classement A+ ("Excellente") par l'observatoire Boivigny
http://www.boivigny.com/Le-classement-des-ecoles-doctorales_a335.html
Activités et associations : Equipe "Autoanticorps anti protéines citrullinées"
***** PUBLICATIONS*****
1.
In ACPA-positive RA patients, antibodies to EBNA35-58Cit, a citrullinated peptide from the Epstein-Barr nuclear antigen-1, strongly cross-react with the peptide β60-74Cit which bears the immunodominant epitope of citrullinated fibrin.
Cornillet M, Verrouil E, Cantagrel A, Serre G, Nogueira L.
Immunol Res. 2015 Feb;61(1-2):117-25. doi: 10.1007/s12026-014-8584-2.
2.
In Black Africans with rheumatoid arthritis, ACPA recognize citrullinated fibrinogen and the derived peptides α36-50Cit38,42 and β60-74Cit60,72,74, like in Caucasians.
Nogueira L, Cornillet M, Singwe-Ngandeu M, Viatte S, Bas S, Gabay C, Serre G.
Clin Immunol. 2014 May-Jun;152(1-2):58-64. doi: 10.1016/j.clim.2014.02.011. Epub 2014 Mar 1.
3.
The fibrin-derived citrullinated peptide β60-74Cit₆₀,₇₂,₇₄ bears the major ACPA epitope recognised by the rheumatoid arthritis-specific anticitrullinated fibrinogen autoantibodies and anti-CCP2 antibodies.
Cornillet M, Sebbag M, Verrouil E, Magyar A, Babos F, Ruyssen-Witrand A, Hudecz F, Cantagrel A, Serre G, Nogueira L.
Ann Rheum Dis. 2014 Jun;73(6):1246-52. doi: 10.1136/annrheumdis-2012-202868. Epub 2013 May 1.
4.
Autoantibodies to citrullinated fibrinogen compared with anti-MCV and anti-CCP2 antibodies in diagnosing rheumatoid arthritis at an early stage: data from the French ESPOIR cohort.
Nicaise-Roland P, Nogueira L, Demattei C, de Chaisemartin L, Rincheval N, Cornillet M, Grootenboer-Mignot S, Dieudé P, Dougados M, Cantagrel A, Meyer O, Serre G, Chollet-Martin S.
Ann Rheum Dis. 2013 Mar;72(3):357-62. doi: 10.1136/annrheumdis-2011-201056. Epub 2012 May 12.
5.
The antigen specificity of the rheumatoid arthritis-associated ACPA directed to citrullinated fibrin is very closely restricted.
Iobagiu C, Magyar A, Nogueira L, Cornillet M, Sebbag M, Arnaud J, Hudecz F, Serre G.
J Autoimmun. 2011 Dec;37(4):263-72. doi: 10.1016/j.jaut.2011.07.003. Epub 2011 Aug 27.
6.
Fcγ receptor profile of monocytes and macrophages from rheumatoid arthritis patients and their response to immune complexes formed with autoantibodies to citrullinated proteins.
Laurent L, Clavel C, Lemaire O, Anquetil F, Cornillet M, Zabraniecki L, Nogueira L, Fournié B, Serre G, Sebbag M.
Ann Rheum Dis. 2011 Jun;70(6):1052-9. doi: 10.1136/ard.2010.142091. Epub 2011 Mar 15.
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Natais leader européen du popcorn
- Ouvrier en production et conditionnement
2009 - maintenant
Ouvrier sur zone de stockage
Opérateur sur lignes de fabrication/conditionnement
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Galys Laboratoire
- Paneliste sensoriel - panel consomateur alimentaire
2009 - maintenant
Évaluation des caractères organoleptiques de produits finis alimentaires
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Institut Fédératif de Biologie (IFB) Toulouse, Laboratoire de biologie cellulaire
- Assistant MCU-PH
2009 - 2010
Etudes biocliniques / Recherches sur la physiopathologie de la Polyarthrite Rhumatoïde en vue de la préparation d'une thèse de science en immunopathologie.
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Projets développés à l'Ecole de Biologie Industrielle
- Participant aux projets - équipes de 5 à 8 personnes
2008 - maintenant
Formulation industrielle : Élaboration d’un jus de fruit alicament à base de soja et d'acérola en partenariat avec une entreprise
Toxicologie : Étude toxicologique du jus de fruit alicament, Étude des modifications du procédé sur la composition du jus de fruit
Création d’entreprise : Création d'une société sur un produit innovant, et élaboration d’une stratégie de commercialisation et de fidélisation (a abouti à un dépôt de brevet)
Marketing : Etudes de marché, études qualitatives, définition du produit (Palet breton)6P+S, Benchmarking, SWOT, eye tracking...
Biologie moléculaire : Production de protéines recombinante, rédaction de publication
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Laboratoire LEBEAU - façonnier compléments nutritionels
- Assistant directeur de production
2008 - 2008
Rédaction de dossiers de mise sur le marché de compléments alimentaires
Sourcing (excipients de compression, vitamines, minéraux, poudres, extraits, actifs)
Evaluation des MP et des fournisseurs
Développement de produits Bio (liquides, comprimés, gélules); du laboratoire au transfert industriel
Veille scientifique, réglementaire et technologique
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Institut National de la Recherche Agronomique - Unité Ecologie et Physiologie du Système Digestif
- Assistant Ingénieur de recherche
2006 - 2006
Recherche d’un régime alimentaire afin d’améliorer l’état pathologique de patients atteints de la maladie de Crohn (étude préclinique)
Recherche biliographique/Cytométrie de flux/Hybridation in situ/Analyses des données/Epidémiologie
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Laboratoire Vétérinaire Départemental de Seine et Marnes
- Technicien
2005 - 2005
Analyses immuno-sérologiques et microbiologiques (Brucellose, Salmonelles, Listéria...) dans le cadre de la surveillance sanitaire du département (Auto-contrôles alimentaires, prophylaxie...)
Étude des étapes de mise sous assurance qualité du secteur Sérologie
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Continentale Nutrition - Petfood - Site Biscuiterie
- Ouvrier en production
2005 - 2005
Approvisionnement des machines / Conditionnement des produits
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Vegarom International
- Technicien
2004 - 2004
Elaboration d’un contretypage d'arôme de crabe pour surimi
Formulation d’arômes et fonds de sauces
Organisation des scéances d'évaluation organoleptique des éssais formulés
